총 16개
-
Site-directed mutagenesis, DNA sequencing2025.01.221. GFP (green fluorescent protein) GFP는 Aequorea victoria로부터 추출한 형광 단백질로, 빛을 흡수하여 형광을 발광한다. GFP는 11개의 β-sheet가 β-barrel 구조를 이루고 있으며, barrel 내의 chromophore가 빛을 흡수하여 전자를 excitation시키고 바닥 상태로 돌아가면서 형광을 방출한다. GFPuv는 GFP의 variant 중 하나로, UV(ultra violet)을 흡수하여 형광을 방출한다. 2. Site-directed mutagenesis Site-d...2025.01.22
-
Site-directed Mutagenesis를 이용한 GFP 돌연변이 도입 및 DNA 염기서열 분석2025.12.171. Site-directed Mutagenesis Site-directed mutagenesis는 DNA 서열의 특정 부분에 point mutation, deletion, insertion 등의 돌연변이를 도입하는 방법이다. 이 실험에서는 mutation을 포함하는 DNA primer를 이용하여 pGFPuv에 Y66H와 Y145F mutation을 도입했다. PCR을 통해 open circular DNA를 생성한 후 DpnI 효소로 메틸화된 template DNA를 선택적으로 제거하여 돌연변이를 도입한다. Pfu DNA polym...2025.12.17
-
Site-directed mutagenesis & DNA sequencing2025.01.181. Site-directed mutagenesis Site-directed mutagenesis는 원하는 돌연변이를 포함하는 짧은 DNA primers를 사용하여 DNA 염기서열 특정 위치의 mutation을 일으켜 돌연변이를 얻는 방법입니다. 이 방법을 이용하여 GFP의 chromophore 아미노산 서열을 변경하여 다양한 색상의 형광 단백질을 만들 수 있습니다. 2. DNA sequencing DNA sequencing은 DNA를 구성하는 염기 순서를 결정하는 작업입니다. Sanger sequencing 방법은 dNTP와 dd...2025.01.18
-
인디고 합성 및 염색 실험 예비보고서2025.01.131. 인디고 합성 실험을 통해 유기합성으로 인디고 염료를 만들어보고, 이를 천에 염색해봄으로써 염료 및 염색에 대한 이해도를 높이고자 하였다. 인디고는 가장 오래된 식물계 천연물감으로, 쪽 또는 남이라고 불리며 중국에서 유럽으로 전해졌다. 인디고의 주성분은 인디고틴이며, 적색의 인디루빈, 황색의 인디고옐로 등의 부성분도 공존할 수 있다. 베이어-드류손의 인디고 합성법과 호이만의 인디고 합성법 등 다양한 합성 방법이 소개되었다. 2. 염료와 염색 염료는 chromophore(발색단), chromogen(색원체), auxochrome(...2025.01.13
-
색소유기화학 중간고사 내용정리2025.11.151. 유기색소의 구조와 성질 유기색소는 분자 내 발색단(chromophore)과 보조색단(auxochrome)을 포함하는 유기화합물입니다. 색소의 색깔은 전자의 에너지 준위 차이에 의해 결정되며, 공액 이중결합 시스템이 발달할수록 더 긴 파장의 빛을 흡수합니다. P. F. Gordon의 저서에서 다루는 색소 화학은 분자 구조와 광학적 성질 간의 관계를 설명합니다. 2. 발색단과 보조색단 발색단(chromophore)은 빛을 흡수하는 유기분자의 부분으로, 주로 공액 이중결합이나 방향족 고리 구조를 포함합니다. 보조색단(auxochro...2025.11.15
-
Site-directed Mutagenesis와 DNA Sequencing을 이용한 GFP 변이 분석2025.12.191. Site-directed Mutagenesis Site-directed mutagenesis는 DNA 염기서열에 인위적으로 mutation을 도입하는 방법으로, 원하는 mutation을 포함하는 short DNA primers를 사용하여 PCR을 수행한다. 본 실험에서는 GFPuv에 Y66H, Y66H/Y145F mutation을 도입했다. PCR 후 생성된 mutated DNA와 original template DNA를 구분하기 위해 DpnI endonuclease를 사용하여 메틸화된 original template DNA만...2025.12.19
-
천연 색소 추출 결과 보고서2025.01.091. conjuation 컨쥬게이션(conjugation)이란 이중결합과 단일결합이 교대로 이루어진 결합 구조를 칭한다. 원자의 결합으로 이루어진 분자, 어떠한 화학물질이 흡수할 수 있는 특정 한 파장의 값은 그 화학적 구조에 기인한다. 색을 띄는 분자들, 유기 색소 분자들은 통상적으로 시그마와 파이 결합이 길게 번갈아 있는 구조를 이루 고 있다. 이러한 단일 결합, 이중 결합이 번갈아 있는 결합을 콘쥬게이션 이중 결합(conjugated double bond), 또는 파이 결합의 접합(파이 -conjugation)이라고 한다. 가...2025.01.09
-
GFP 단백질 정량 실험: Lowry assay와 Extinction coefficient assay 비교2025.12.131. Lowry Assay Lowry assay는 Biuret reaction과 Folin reaction이 합쳐진 단백질 정량 방법이다. Cu2+와 folin reagent의 산화환원반응을 바탕으로 하며, Tyr, Trp, Cys가 산화되면서 750nm 파장에서 파란색을 띠는 heteropolymolybdenum blue가 형성된다. 표준곡선을 이용하여 미지의 단백질 농도를 계산하는 방식으로, 아미노산 조성에 따라 측정값이 영향을 받을 수 있다는 한계가 있다. 2. Extinction Coefficient Assay Extinct...2025.12.13
-
[분석화학실험5] 자외가시부흡광도측정법을 이용한 자양강장음료 중 caffeine, benzoic acid의 정량2025.04.271. 자외가시부흡광도측정법 자외가시부흡광도측정법은 불포화 결합 등의 발색단(chromophore)을 갖고 있는 화합물에 대하여 자외선 또는 가시광선을 조사하여, 그 최대 흡수파장 영역을 알아냄으로써 정성 분석에 이용하고, 표준액과 샘플의 흡광도를 측정함으로써 샘플의 농도 등을 확인하는 정량분석에 이용한다. UV 분광광도기의 구조에는 광원, 파장선택기, 시료 용기, 검출기 등이 포함된다. 2. Lambert-Beer 법칙 Lambert-Beer 법칙에 의하여 식 A = abC 가 성립하므로 시료 농도 C에 따른 흡광도 A의 변화를 나...2025.04.27
-
바이러스학 실험: Transfection과 Subculture2025.12.171. Transfection Transfection은 세포 내부에 외래 유전자를 인위적으로 도입하여 원하는 DNA를 발현시키는 실험 방법입니다. 본 실험에서는 polyethylenimine(PEI)을 transfection reagent로 사용했습니다. PEI는 중성 pH에서 높은 양전하 밀도를 가진 합성 polymer로, 음전하를 띤 DNA를 감싸 세포 내부로 전달하는 역할을 합니다. 293T cell line에 GFP 발현 plasmid DNA를 transfection한 결과, 형광현미경을 통해 녹색 빛을 띠는 세포들이 관찰되어...2025.12.17
1 / 2
