서강대학교 일반생물학실험1 실험 6. GFP 단백질과 단백질 정량 (Protein Measurements)
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2024.01.17
문서 내 토픽
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1. 단백질 정량 방법실험에서는 Lowry assay와 Extinction coefficient assay 두 가지 단백질 정량 방법을 사용하여 EGFP의 질량농도를 측정하였다. Lowry assay는 Biuret reaction과 Folin reaction을 거쳐 750nm에서 흡광도를 측정하고 BSA 표준곡선을 이용하여 EGFP 농도를 계산하였다. Extinction coefficient assay는 EGFP의 몰흡광계수와 Lambert-Beer's Law를 이용하여 488nm에서 EGFP 농도를 직접 계산하였다. 두 방법의 결과값에 차이가 있었는데, 이는 Lowry assay가 단백질 종류에 따라 흡광도 차이가 나는 반면 Extinction coefficient assay는 특정 단백질의 고유 흡광도를 이용하기 때문이다. 측정값의 정확도를 높이기 위해서는 표본 수 증가, BCA assay 등 다른 측정법 사용 등이 필요하다.
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2. 단백질의 구조와 기능단백질은 아미노산의 peptide 결합으로 이루어진 중합체로, 세포 내에서 주로 효소, 항체, 구조 단백질 등의 역할을 한다. 단백질의 구조는 1차 구조(아미노산 서열), 2차 구조(α-helix, β-sheet), 3차 구조(접힌 형태), 4차 구조(단백질 복합체) 등으로 구분된다. 단백질 중 하나인 GFP(녹색형광단백질)는 발광해파리에서 유래되었으며, 세포 내 유전자 발현을 관찰하는데 널리 사용된다.
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1. 단백질 정량 방법단백질 정량 방법은 단백질의 양을 측정하는 다양한 기술들을 포함합니다. 가장 널리 사용되는 방법은 Bradford 분석, Lowry 분석, BCA 분석 등입니다. 이러한 방법들은 각각 장단점이 있으며, 실험 목적과 시료의 특성에 따라 적절한 방법을 선택해야 합니다. Bradford 분석은 빠르고 민감하지만 일부 물질에 의해 방해받을 수 있습니다. Lowry 분석은 민감도가 높지만 시간이 오래 걸리고 복잡한 편입니다. BCA 분석은 Bradford와 Lowry의 장점을 결합한 방법으로, 비교적 간단하고 정확하며 다양한 시료에 적용할 수 있습니다. 단백질 정량 방법의 선택은 실험 목적, 시료의 특성, 실험실 여건 등을 고려하여 결정해야 합니다. 또한 정량 결과의 정확성을 높이기 위해 표준 단백질을 사용하고 적절한 대조군을 설정하는 것이 중요합니다.
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2. 단백질의 구조와 기능단백질은 생명체에서 가장 중요한 생체 고분자 중 하나로, 다양한 구조와 기능을 가지고 있습니다. 단백질의 기본 구조는 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 폴리펩타이드 사슬입니다. 이 사슬은 수소 결합, 이온 결합, 소수성 상호작용 등에 의해 특정한 3차원 구조를 형성합니다. 단백질의 구조는 크게 1차 구조(아미노산 서열), 2차 구조(α-나선, β-sheet), 3차 구조(전체적인 3차원 구조), 4차 구조(여러 개의 폴리펩타이드 사슬이 결합한 구조)로 나뉩니다. 이러한 단백질의 구조는 단백질의 기능과 밀접하게 연관되어 있습니다. 단백질은 효소, 호르몬, 항체, 구조 단백질 등 다양한 기능을 수행하며, 생명체의 생명 활동에 필수적인 역할을 합니다. 따라서 단백질의 구조와 기능에 대한 이해는 생물학, 의학, 약학 등 다양한 분야에서 중요한 의미를 가집니다.
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6XHis-tagged eGFP 발현, 정제 및 특성 분석1. Green Fluorescent Protein (GFP) 및 enhanced GFP (eGFP) GFP는 해파리 Aequorea Victoria에서 발견된 단백질로 238개의 아미노산으로 이루어져 있으며 27kDa의 크기를 가진다. eGFP는 GFP의 64번 아미노산인 Phenylalanine을 Leucine으로, 65번 아미노산인 Serine을 Th...2025.12.14 · 자연과학
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GFP 단백질 정량 실험: Lowry assay와 Extinction coefficient assay 비교1. Lowry Assay Lowry assay는 Biuret reaction과 Folin reaction을 결합한 단백질 정량법으로, 높은 검출 감도(1 μg)를 가진다. 알칼리성 환경에서 펩타이드 결합과 Cu2+가 복합체를 형성하고, Folin reagent를 환원시켜 750 nm에서 파란색을 띤다. 본 실험에서 BSA를 표준 단백질로 사용하여 표준곡선...2025.12.19 · 자연과학
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GFP 단백질과 단백질 정량(Protein Measurements)1. 단백질 정량 단백질 정량 방법 중 Lowry assay와 Extinction coefficient assay를 통해 단백질을 정량하고, 비교하는 과정에서 흡광도와 표준곡선의 의미를 이해하고자 수행한 실험이다. 단백질은 아미노산의 중합체로, 아미노산 사이에 펩타이드 결합이 반복되며 단백질이 형성된다. 이번 실험에서 사용한 단백질의 농도를 정량하는 방법은...2025.01.22 · 자연과학
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A+ 생화학실험 <12주차. Protein expression> 레포트1. 발현 벡터 (pET vector) 발현 벡터(expression vector)는 분자 클로닝 결과로 얻은 재조합 DNA를 competent cell을 비롯한 다른 세포에 전달하는 데 사용한다. pET 벡터는 E. coli에서 재조합 단백질을 발현하기 위해 사용하는 대표적인 발현 벡터이다. pET 벡터는 플라스미드에 해당하나, 이 외에도 viral ve...2025.01.20 · 자연과학
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Lowry protein assay(단백질 정량 분석) 결과레포트1. Lowry protein assay Lowry protein assay 실험은 단백질 정량 분석에 대해 이해하고 그중에서 Lowry method로 단백질 정량 분석을 하는 실험이다. 농도를 알고 있는 서로 다른 농도의 BSA sample 5개의 흡광도를 측정하는 실험을 진행하고 두 번째 실험에서는 최적의 파장대(750nm)에서 미지 농도의 단백질 sa...2025.01.22 · 자연과학
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GFP: 형광 단백질의 원리와 연구 응용1. GFP(녹색 형광 단백질)의 발견과 원리 GFP는 일본 과학자 시모무라 오사무가 형광 해파리(Aequorea Victoria)에서 발견한 최초의 형광 단백질입니다. 형광은 전자가 빛에 의해 여기되어 기저 상태로 돌아올 때 가시광선을 방출하는 현상입니다. GFP의 발광 원리는 Ser-Tyr-Gly로 구성된 발색단에 기반하며, 파이 시스템의 전자가 청색광...2025.12.18 · 자연과학
