A+[일반생물학및실험] Agarose gel 만들기 및 DNA electrophoresis 레포트

소개

A+ 받았던 일반생물학 레포트입니다.

목차

Ⅰ. Title
Ⅱ. Date
Ⅲ. Name
Ⅳ. Purpose
Ⅴ. Material
Ⅵ. Method
Ⅶ. Results
Ⅷ. Discussion
Ⅸ. Projects
Ⅹ. Reference

본문내용

이번 전기영동 실험은 각 조에서 두 명만 뽑아 실험에 참여하는 방식으로 진행되었다. 나는 그 두 명에 해당하지 않아 다른 조원들이 실험하는 모습을 지켜보았는데 직접 실험을 하면서 만들어보지 못하여 Agarose gel 용액에 대해 알아갈 기회가 적어 아쉬웠다. 그래서 Agarose gel이 무엇이고 DNA 전기영동에서 무슨 역할을 하는지 궁금증이 생겼다. 그리고 찾아본 결과, Agarose gel은 전기영동법에 사용되는 한천을 이용하여 제조하는 3차원 구조의 겔이라는 것을 알았다. 더욱 자세히 설명하자면 한천에서 유래된 나선형의 agarose 분자가 여러 번 꼬여있는 형태로 뭉쳐서 겔 형태로 굳어 있으며 생체 분자가 통과할 수 있는 통로와 구멍이 있다. 이러한 고체 형태의 3차원 구조는 수소결합을 통해 이루어지며, 열에 의해 다시 액체 형태로 돌아간다. Agarose gel은 내부의 크고 작은 구멍들이 있고 유연하면서 단단한 구조를 이루고 있기 때문에, DNA나 단백질과 같은 큰 분자들이 전기영동을 통해 이동하는 데 유용하다.
또한 agarose gel을 만들 때 1x TAE용액으로 희석하여 만드는데 이 용액이 무엇인지 궁금하여 조사해보았다. TAE 완충액은 트리스 염기, 아세트산과 EDTA를 함유하는 혼합물이다. 분자생물학에서는 DNA와 RNA 같은 핵산을 분리하기 위해 일반적으로 agarose 전기영동에 사용된다. 트리스 염기는 양이온을 공급하여 (-) charge를 띄고 있는 DNA를 운반하고 Acetate는 트리스로 인해 높아진 pH를 낮추어 DNA의 변성을 방지한다. 그렇다면 TAE만 이 실험에 쓰일 수 있는 것일까? 다른 버퍼에는 어떤 종류가 있을지 의문이 생겼다. 버퍼에는 크게 TAE buffer와 TBE buffer가 있다. TBE는 트리스 염기, 붕산 및 EDTA를 함유하는 혼합물이다.

참고자료

· 전기영동 최신 프로토콜/ 강호일/ 월드 사이언스/ p26-28, p29-33
· 식품과학기술대사전/한국식품과학회/광일문화사/2008
· 전기영동, 아가로스 및 아크릴 아마이드 젤. Methods Enzymol /Ogden, RC, and Adams, DA/1987/p61-87
· 표준 DNA 전기 이동 법을 위한 전도성 매체의 역사 그리고 원리/ Anal Biochem. Brody, JR, Kern, SE/2004/p33
· 중합 효소 연쇄반응(PCR) https://terms.naver.com/entry.nhn?docId=927698&cid=51007&categoryId=51007
· 고리 열림 DNA https://terms.naver.com/entry.nhn?docId=1061622&cid=40942&categoryId=32326
· 선형 DNA https://terms.naver.com/entry.nhn?docId=428915&cid=60261&categoryId=60261
· 초 나선 DNA https://terms.naver.com/entry.nhn?docId=5141474&cid=60266&categoryId=60266
· 아가로스 겔(Agarose gel) https://terms.naver.com/entry.nhn?docId=4353235&cid=40942&categoryId=32308