(소논문) qPCR을 통해 알아본 추위와 백색지방의 베이지화와의 상관관계

소개

의료정보학 시간에 과제로 작성한 소논문입니다. qPCR을 통해 특정 유전자 발현(Ucp1, Dio2)을 측정하여 추위에 노출된 마우스에서 채취한 백색지방에서 베이지화가 발생한 것을 확인하는 실험을 진행하고 작성하였습니다.

목차

1. Abstraction

2. Introduction

3. Material and method
1) 지방조직 채취
2) Phase seperation
3) RNA precipitation
4) RNA wash
5) NanoDrop
6) RT-PCR
7) Real time quantitative PCR

4. Result

5. Discussion

본문내용

Abstraction
본 실험은 추위에 노출되었을 때 백색지방에서 베이지화가 일어나고 갈색지방이 활성화된다는 것을 확인하기 위해 수행되었다. 추위(7.3℃)에 노출시킨 마우스 4마리와 그렇지 않은 마우스 4마리에서 갈색지방조직과 백색지방조직(서혜부 지방조직)을 채취 후 RNA를 추출하였다. RT-PCR을 수행하여 RT와 CE의 Ucp1, Dio2, Tbp의 mRNA expression을 비교하였다. 실험 결과, iWAT의 경우 Ucp1.의 mRNA expression이 RT에 비해 CE에서 약 8배정도 증가했다. 이것은 백색지방이 추위에 노출될 경우 Ucp1이 증가되어 베이지화(백색지방의 갈변화)가 일어난다는 것을 의미한다. 원래 이론대로라면 Dio2도 증가해야 맞지만 RT에 비해 CE에서의 Dio2의 mRNA expression은 감소하였다. iBAT의 경우는 Ucp1, Dio2, 모두 RT보다 CE에서 mRNA expression이 증가하였다. 이것은 낮은 온도에서 갈색지방이 활성화한다는 것을 의미한다. 즉 본 실험을 통해 갈색지방이 추운 환경에서 활성화된다는 것을 확인할 수 있었으며 비만을 예방하고 체중을 감량하는데 낮은 온도에 노출되는 것이 상당한 도움을 줄 수 있음을 알 수 있었다.

Introduction
비만은 당뇨, 고혈압 등 성인병의 대표적인 원인으로 꼽히며 현대인들의 큰 이슈 중 하나이다. 비만이라고 하면 일반적으로 지방을 빼야 한다고 생각하지만 에너지를 지방형태로 저장하는 백색지방(WAT)과 달리 살을 빼는데 오히려 도움을 주는 ‘갈색지방(BAT)’도 있다. WAT은 보통 지방저장기능을 담당하며 피하, 심부 혈관 주변, 복강 내 등 다양한 곳에 존재한다. BAT는 교감 신경계에 의해 자극되는 백색지방세포에서 발생한다. 특히 신생아와 동면하는 포유류에 많고 성인에게도 존재하지만 그 비율이 적고 나이가 들면서 더 감소한다. 주요 기능은 온도 조절이다.

참고자료

· https://www.sigmaaldrich.com/KR/ko/technical-documents/protocol/protein-biology/protein-lysis-and-extraction/tri-reagent
· https://assets.thermofisher.com/TFS-Assets/CAD/manuals/3091-NanoDrop-One-User-Guide-v1.3-sw-KOREAN.pdf
· https://en.wikipedia.org/wiki/Acid_guanidinium_thiocyanate-phenol-chloroform_extraction
· https://ko.wikipedia.org/wiki/%EA%B0%88%EC%83%89%EC%A7%80%EB%B0%A9%EC%A1%B0%EC%A7%81
· https://terms.naver.com/entry.naver?docId=5141578&cid=60266&categoryId=60266
· https://zymoresearch.eu/pages/what-is-trizol
· https://openwetware.org/wiki/Phenol/chloroform_extraction
· https://en.wikipedia.org/wiki/Ethanol_precipitation
· https://www.thermofisher.com/kr/ko/home/references/ambion-tech-support/rna-isolation/general-articles/practical-tips-for-handling-rna.html
· https://what-when-how.com/molecular-biology/diethylpyrocarbonate-molecular-biology/