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나노의생명공학 레포트입니다.2025.05.081. Corona virus 코로나바이러스는 27~32 kb 길이의 단일가닥 감염성 있는 양성 RNA 게놈을 가지며, 바이러스 입자 표면에 곤봉 모양의 Spike 단백질이 존재한다. 코로나바이러스의 감염은 숙주세포의 수용체와 비리온(virion)의 결합에 의해 개시되며, 바이러스 Spike 단백질이 숙주세포의 수용체 결합에 중요한 역할을 한다. 코로나바이러스의 유전체 RNA로부터 replicase 단백질이 만들어지며, 비구조단백질(nsp3, nsp4, nsp6)에 의해 형성되는 이중막 소포(DMVs)가 바이러스의 RNA 합성과 전사...2025.05.08
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[건국대학교] 유전체학 DNA_replication 리포트2025.01.151. DNA 복제 개시 ORC(Origin Recognition Complex)는 이중가닥 DNA를 열어 Helicase를 불러오는 역할을 한다. Helicase는 DNA의 이중가닥을 단일가닥으로 풀어주는 효소이며, ATP를 사용한다. Topoisomerase는 Helicase가 풀어준 DNA의 꼬임 현상을 해소해준다. 2. 단일가닥 DNA 보호 SSB 단백질(Single-Strand Binding Protein)은 단일가닥 DNA가 다시 이중가닥으로 붙는 것을 막고 DNA를 endonuclease로부터 보호한다. 진핵생물에서는 R...2025.01.15
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A+ 생화학실험 <10주차. Cloning> 레포트2025.01.201. Molecular Cloning Molecular cloning은 분자 생물학에서 recombinant DNA를 생성하고 숙주 내에서 replication을 수행하는 실험적인 기법입니다. 이 기법의 주된 목적은 target 유전자(insert)를 plasmid DNA(vector)에 넣어 대량의 target 유전자 또는 해당 유전자로 인해 발현되는 단백질을 얻는 것입니다. 일반적으로, 서로 다른 유기체에서 얻은 DNA sequence를 사용하며, 하나의 유기체는 cloning되는 DNA의 source 역할을 하며, 다른 유기체...2025.01.20
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박테리아 형질전환(Transformation) 실험2025.11.161. 형질전환(Transformation) 형질전환은 plasmid DNA를 E.coli에 도입하는 과정입니다. 42℃ heat shock을 통해 세포막의 유동성을 증가시켜 DNA가 통과할 수 있는 adhesion zone을 형성합니다. Heat shock 조건에서 세포 투과성이 증가되며, 이는 작은 DNA 분자가 세포 내로 진입할 수 있게 합니다. Electroporation은 전기장을 사용하는 대안적 방법입니다. 2. 회복 기간(Recovery Period) 회복 기간은 형질전환된 세포의 생존력과 클로닝 효율을 높입니다. 이 기...2025.11.16
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Gel extraction & TA cloning 실험 보고서2025.11.171. Gel Extraction Agarose gel 전기영동으로 확인한 PCR product를 gel 상에서 분리 및 정제하는 기술이다. FADF buffer를 이용해 gel을 용해한 후, silica membrane을 가진 column에 DNA를 결합시키고 wash buffer로 불순물을 제거한 후 ddH2O로 elution하는 과정으로 진행된다. Chaotropic salt가 포함된 FADF buffer는 silica membrane의 O-와 DNA의 인산기 사이에 cation bridge를 형성하여 DNA 부착을 가능하게 한...2025.11.17
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Delavirdine 합성 가능 메커니즘2025.01.291. Delavirdine Delavirdine는 HIV-1 감염 치료에 사용되는 비뉴클레오사이드 역전사효소 억제제입니다. 이 약물은 역전사효소를 억제하여 바이러스 RNA를 DNA로 전사하는 과정을 차단함으로써 HIV 복제를 억제합니다. Delavirdine의 분자 구조에는 피리딘 고리, 술폰아미드 그룹, 아민 그룹, 방향족 고리 등의 다양한 작용기가 포함되어 있습니다. Delavirdine의 합성에는 여러 가지 방법이 있으며, 이 문서에서는 두 가지 방법을 설명합니다. 첫 번째 방법은 메틸 피루베이트와 N-(4-아미노페닐)메탄술폰...2025.01.29
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[생물공정실험] 6주차 P1 Transduction 결과보고서2025.04.261. P1 Transduction 이번 실험에서는 P1 phage를 이용하여 recipient cell에 transduction하고 target 유전자가 삽입됐는지 colony 색으로 확인해보았다. E.Coli균의 사전 준비 과정은 조교님께서 대신 해주셨다. 이번 실험에서 recipient cell은 gadA gene이 knockout된 E.coliΔgadA이고, donor cell은 copA gene이 knockout되고 kanamycin 항생제에 대한 저항성을 가진 유전자가 삽입된 E.coliΔcopA::kan이다. 이를 통해 ...2025.04.26
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Reading Explorer4 (3rd edition) UNIT4A. DESIGN BY NATURE2025.04.301. Biomimetics 생물학자 Andrew Parker는 가시도마뱀의 등에서 물이 빠르게 이동하는 현상을 관찰하고, 이를 바탕으로 사막에서 물을 수집할 수 있는 장치를 개발하고자 했다. 이처럼 생물학적 구조와 기능을 모방하여 공학, 재료과학, 의학 등의 문제를 해결하는 것이 바로 바이오미미크리(biomimetics)이다. 전 세계의 과학자들이 다양한 자연의 설계 비밀을 연구하고 모방하려 노력하고 있으며, 이를 통해 풍력발전기, 자동차, 건축물, 의료기기 등 다양한 분야에서 혁신적인 기술이 개발되고 있다. 2. Biomimeti...2025.04.30
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DNA 복제 메커니즘과 유전자 발현 조절2025.12.181. DNA 복제 과정 DNA 복제는 반보존적 복제 방식으로 이루어지며, 복제 분기점에서 DNA helicase가 이중 나선을 단일 가닥으로 분리한다. SSB 단백질이 단일 가닥을 안정화하고, DNA polymerase가 5'에서 3' 방향으로 새로운 DNA 가닥을 합성한다. Leading strand는 연속적으로 합성되고, lagging strand는 Okazaki fragment로 합성된 후 DNA ligase에 의해 연결된다. 이 과정에서 10억 개의 nucleotide당 1개의 오류만 발생할 정도로 높은 정확도를 보인다. 2...2025.12.18
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Nester 미생물학 7장: 전사, 복제, 번역 및 유전자 발현2025.11.171. 전사(Transcription) 전사는 DNA의 단일가닥을 주형으로 RNA를 합성하는 과정으로, 개시, 연장, 종료 단계로 이루어진다. RNA 중합 효소가 프로모터에 결합하고 시그마 인자의 도움을 받아 개시되며, DNA의 5'에서 3' 방향으로 이동하면서 RNA를 합성한다. DNA의 염기 A, T, G, C는 RNA에서 U, A, G, C로 전사되며, 종료부위에서 Rho 단백질이나 NusA 단백질에 의해 전사가 종료된다. 2. DNA 복제(DNA Replication) DNA 복제는 시작, 연장, 종결 단계로 이루어진다. 복제...2025.11.17
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