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단백질 분리 생화학 리포트

Purification of Protein Disulfide-Isomerase 1Purification of Protein Disulfide-Isomerase학번 *** 이름 ***目次Ⅰ 서 론Ⅱ 실험&결과Ⅲ 토 의Ⅳ 참고문헌Ⅰ. 서론PDI( Protein Disulfide-Isomerase )라는 단백질의 정제를 목적으로 하는 이번 실험은 2014년 11월 03일로부터 시작해서 LB배지 만들기, 1차 seeding, 2차 seeding, IPTG induction, SDS Page, Cell lysis, Ni-NTA affinity chromatography, Dialysis, SDS Page, Bradford assay, Lyophilization 순으로 11월 19일까지 진행하였다.단백질들은 각자의 분자적 기능( molecular function )과 세포적 기능( cellular function )을 수행한다. PDI는 세포적 기능으로서 소포체에 존재, 작용하며 분비 단백질의 이황화 결합 형성으로 단백질 접기( protein folding )에 관여한다. 또한 분자적 기능으로서 분자 chaperone으로서의 기능 또한 시사하고 있다. in vitro에서는 환원된 효소에 작용을 하여서 이황화물의 결합의 재조합에 의해 활성을 만들 수 도 있다.( 그림 1 ) 단백질 접기와 더불어 그 밖의 PDI의 세포적 기능은 MHC classⅠ molecules로 antigenic peptide를 저장하는데 도움을 주는 것과 HIV가 CD4 positive cells에 감염되는 동안에 HIV gp120 protein bonds를 파괴하는데 관련이 있는 등 밝혀진 여러 가지 생체 내에서의 기능들이 있다. PDI의 분자량은 57.05849 kDa( mouse의 PDI )이지만 이번 실험에서는 잘라도 활성에 영향을 주지 않는 도메인을 자르고 His-tag( 약 0.8 kDa) 를 포함한 추가적인 요소를(b)더해(c)53 kDa정도로 만들어서 실험을 하였다.(a)그림 1. (arget protein을 얻기 위함이다. OD값이 1이 넘었다면 희석해주면 된다.이렇게 세포를 키웠다면 원심분리를 통해 cell을 harvest를 하고 sonication을 통해 세포막을 부셔서 세포로부터 단백질을 얻는다. 그렇다면 우린 이 세포 안에 우리가 원하는 PDI가 제대로 IPTG induction이 되었는지 먼저 알아봐야 한다. 이렇게 우리가 어떤 단백질이 있는지 확인하고 싶을 때 사용하는 실험방법이 SDS Page이다. SDS Page는 SDS-폴리아크릴아미드 겔 전기영동이며 전기영동은 하전 된 입자가 전기장에서 반대 전하의 전극 쪽으로 이동하는 원리를 이용하여 물질을 분리하는 실험이다. SDS PAGE는 단백질을 음전하로 코팅하여 폴리아크릴아마이드 겔에서 단백질 분자량에 따라 전기영동 하는 방법이다. 폴리아크릴아마이드 겔은 폴리아크릴아마이드와 비스 아크릴아마이드 등으로 구성되며 두 물질은 서로 연결되어서 구멍을 형성한다( 그림 4 ). 단백질의 구조적 차이에 따른 저항의 차이를 없애주기 위해 음전하를 띄는 SDS로 비 공유 결합을 파괴하고 환원제인 β-mercaptoethanol이나 DTT을 이용하여 이황화 결합을 파괴한다. 이로 단백질은 변성된다. SDS가 두 개의 아미노산마다 결합하여 큰 음전하를 부여함으로 전하의 차이에 따른 이동속도의 차이를 없애준다. 우리 실험에는 APS(아크릴아마이드 중합의 개시를 도와준다.), TEMED(APS를 사용하는 경우에 촉매제로 사용된다. ), glycerol( 밀도가 낮은 것들은 날아갈 수가 있기에 이를 방지한다. )와 Tris-HCI( ph맞춰주기 위해 사용한다. )등이 사용되었다. SDS PAGE의 PAGE는 stacking gel과 resolving gel로 나눠지는데 stacking gel은 Cl이온과 글라이신의 high voltage gradient로 인해 stacking gel의 끝 부분에 단백질들이 한곳으로 모일 수 있는 역할을 해주며 resolving gel은 단백질이 크기에 따라 이동하는 자라고 있는 LB배지( induction 하지 않을 control 10 ml가 들어있는 conical tube, induction을 할 200 ml가 들어있는 삼각 플라스크 ), 2차 증류수, 알코올, 0.5 M IPTG 200 μl, Micropipette, Cuvette, Spectrophotometer, E-tube, Lysis buffer 20 ml( Tris 48 mg, pH 8.0).Ⅱ.Ⅰ.Ⅲ SDS-Page.Loading 시킬 sample, Conical tube, 비닐장갑, Lysis buffer 20 ml( Tris 48 mg, pH 8.0), Centrifuge, Sonication 기기, 15 % Running gel 10ml ( H2O 2300 μl, 30 % Acrylamide mix 5000 μl, 1.5 M Tris pH 8.5 2500 μl, 10 % APS 100 μl, 10 % SDS 100 μl, TEMED 4 μl ), 5 % Stacking gel 2ml ( H2O 1400 μl, 30 % Acrylamide mix 330 μl, 1.0 M Tris pH 6.8 250 μl, 10 % SDS 20 μl, 10 % APS 20 μl, TEMED 2 μl ), 1X Running buffer( 25 mM Tris pH 8.7, 0.25 M glycine, 0.1 % SDS ), Sample buffer( 1 % Bromophenol blue, 1 M Tris-HCl pH 6.8, 50 % Glycerol, 10 % SDS, β-mercaptoethanol, 증류수 ), Staining buffer( 증류수 80 %, 메탄올 10 %, 아세트산 10 %, R 250 coomassie blue 1 g/L ?메탄올에 녹인 다음 증류수, 아세트산 첨가 ), Destaining buffer( 증류수 80 %, 메탄올 10 %, 아세트산 10 % ), SDS Page틀, Loading시 전압을 가해주는 기기( 그림 8 ), Boiling을 때 2차 seeding만을 IPTG induction을 실시한다. IPTG는 Induction을 하기 위해서 0.5 mM IPTG를 넣어주어야 함으로 기존 0.5 M IPTG stock을 200 ml 배지에 1000분의 1인 200 μl를 넣어준다. OD값을 측정할 때 OD값이 1이 넘어가는 순간부터 용액을 cuvette에 옮길 때 증류수 500 μl, 용액 500 μl씩 넣어서 나온 OD값의 두 배로 OD값을 계산한다. 배양하면서 OD값이 induction한 것은 1.8일 때 harvest하였다. Harvest를 하기 전에 SDS-Page를 하여 발현을 확인하기 위해서 induction한 OD값이 1.8나온 용액은 5 ml빼서 5개의 E-tube에 각각 1 ml씩 넣어서 E-tube를 centrifuge에 위치 balance에 맞게 두어서 원심분리를 13000 rpm에서 5분간 한 뒤 만들어 둔 Lysis buffer 500 μl를 액체 LB배지는 버리고 pellet과 섞어서 E-tube에 넣어 -20℃에 보관해둔다. 이때 control의 OD값은 1.7이었으므로 5.5 ml를 5개의 E-tube에 1.1 ml씩 나누어 원심분리 하고 마찬가지로 pellet을 500 μl의 Lysis buffer와 섞어서 E-tube에 넣어서 ?20 ℃에 보관해둔다.Ⅱ.Ⅱ.Ⅱ.Ⅱ 11월 4일 Cell harvest.OD값이 1.8이 나온 200 ml 액체배지를 같은 통에 같은 무게를 넣은 물이 들어있는 것과 같이 centrifuge에 위치 balance에 맞게 두어서 원심분리를 8000 rpm에서 10분간 하고 위의 액체 LB배지는 버리고 밑의 pellet만을 lysis buffer 10 ml와 같이 섞어서 ?20 ℃에서 보관한다.Ⅱ.Ⅱ.Ⅲ SDS-Page.Ⅱ.Ⅱ.Ⅲ.Ⅰ 11월 6일 Sonication.Ⅱ.Ⅱ.Ⅱ.Ⅰ과정에서 SDS-Page를 위해 만들어 둔 sample을 sonication 하는데 밑에다 얼음을 받히고 5 sec동안 run 하고 5 sec동안 relax해주uffer 10 ml를 부어서 목요일, 5조, elution( e )라고 labeling한 conical tube에 받는다. 각각의 conical tube에 받은 용액들 중 200 μl을 E-tube에 옮겨서 냉동 보관한다.Ⅱ.Ⅱ.Ⅳ.Ⅲ 11월 10일 column recycle.Column에 증류수를 가득 넣어서 흘려보내고 후에 20 % EtOH을 가득 넣어서 흘려보낸다. EtOH가 조금 남았을 때 resin을 압축시켜서 빼내고 재활용한다.Ⅱ.Ⅱ.Ⅴ Dialysis.Ⅱ.Ⅱ.Ⅴ.Ⅰ 11월 10일 Dialysis buffer 만들기.큰 비커에 5 L 증류수를 담고 12.14g Tris를 넣어주고 pH를 HCI, KOH와 pH미터를 이용해서 pH 7.8로 만들어 준다.Ⅱ.Ⅱ.Ⅴ.Ⅱ 11월 11일 Dialysis.반투과성 막으로 snakeskin이라는 제품을 사용하며 막에 용액을 넣고 집게로 잘 집어서 Dialysis buffer안에다가 넣는다. 다음 날 와서 같은 buffer로 바꿔주고 4시간이 지나면 conical tube에 보관해 두고 SDS-Page를 위해 200 μl은 E-tube에 sampling해둔다.Ⅱ.Ⅱ.Ⅵ SDS-PageⅡ.Ⅱ.Ⅵ.Ⅰ 11월 13일 SDS-Page gel 제작.Ⅱ.Ⅱ.Ⅲ.Ⅱ방법과 동일하다.Ⅱ.Ⅱ.Ⅵ.Ⅱ 11월 13일 Sample 준비.여기서 사용할 sample들은 Ni-NTA affinity chromatography에서 준비된 샘플들 Sup, f.t1, f.t2, f.t3, e, dialysis들을 사용하며 각각의 sample 100 μl에 2X sample buffer 100 μl를 더해 SDS-Page sample을 준비한다.Ⅱ.Ⅱ.Ⅵ.Ⅲ 11월 13일 Sample loading.전체적인 방법은 Ⅱ.Ⅱ.Ⅲ.Ⅳ과 거의 일치하며 다른 것은 Ⅱ.Ⅱ.Ⅵ.Ⅱ에서 말한 sample들을 20μl씩 Marker는 10 μl를 loading 했다는 것이다.Ⅱ.Ⅱ.Ⅶ Bradford assay and UV method.Ⅱ.Ⅱ.Ⅶ.Ⅰ 11월 13일.

자연과학| 2021.09.20| 18페이지| 2,500원| 조회(412)

단백질, 생화학, 단백질 분리

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미생물 유전체 분석 리포트

G+C content가 유전자 예측에 사용되는 원리를 설명하시오?G+C content는 어느 한 종의 게놈 서열에서 G의 양과 C의 양을 합한 비율을 의미한다. 이는 A+T content와 합하여 100%가 된다. 이들 값이 50% 근처라면 별 문제가 없겠지만, 매우 높거나 낮다면 코돈 사용빈도에도 변화가 생기게 된다. Met와 Trp을 제외한 나머지 아미노산을 코딩하는 코돈은 2~6개씩 존재한다. 예를 들면, CUU, CUA, CUC, CUG 모두 Leu을 코딩하며, 앞의 2개 염기가 CU인 것이 중요하지, 세번째 염기가 무엇인지는 중요하지 않다. 이러한 현상을 설명하는 이론을 소위 wobble 가설이라고 한다. 만약에 어떤 종의 게놈 서열에서 G+C가 차지하는 비율이 50%보다 높다면, 동일한 아미노산을 코딩하는 복수의 코돈 중에서 세번째 위치의 염기가 G 혹은 C인 것이 선호될 것이다. 반대로 50%보다 낮다면 A 혹은 T 염기가 선호될 것이다. 종마다 gc content가 다르고 이것을 이용해 참 ORF는 코돈 사용 빈도가 G+C content에서부터 예측한 값에 잘 부합하는 반면에 거짓 ORF는 그렇지 않을 것이다. 수학적으로 코돈 사용빈도를 예측하지 않고, 체험적으로 하는 방법도 있다. 어떤 종에 대해서 모든 유전자는 아니지만, 일부 유전자에 대해서는 서열을 알고 있다면, 이들에서부터 코돈 사용빈도를 계산하고 그 값을 미지의 유전자 예측에 적용하는 것이다. 단, 그 일부 유전자가 대표성이 있어야 한다.BL21(DE3)의 조립된 콘티그 전체 평균 G+C content 값은 얼마인가? 또한 Nucmer를 이용하여 콘티그들을 매핑을 시도하였을 때, 매핑되지 않았던 26개의 콘티그의 평균 G+C content 값은 얼마인가? 그 차이를 간단히 설명하시오콘티그들의 평균은 50.9이다.평균 gc content가 차이가 난다.E. coli BL21 (DE)를 CAP3로 조립한 contigs들에 대해서 GeneMark를 이용하여 유전자 예측을 한 결과, 총 몇 개의 유전자가 예측되었으며, 이중에서 + strand에 위치하는 유전자 갯수와 - strand에 위치하는 유전자 갯수는 각각 몇개인가?전체 5692개중에 2954개는 -, 2738개는 + strand에 위치.3번에서 사용한 유전자의 단백질 서열들을 대장균 표준 균주인 K-12의 단백질들과 blastp한 후에 best hit만을 필터링한 결과 파일에서 상동성 % 값의 평균은 얼마인가? 반면에 Nucmer를 이용하여 콘티그들을 매핑을 시도하였을 때, 매핑되지 않았던 26개의 콘티그에서 예측된 단백질들의 평균 상동성은 얼마인가? 그 차이는 어떻게 설명하나?26개의 콘티그에서 111 gene 확인, 111 gene들에서 상동성 확인 :56.92459 값이 나왔다.blastp한 후에 best hit만을 필터링한 결과 파일에서 상동성 % 값의 평균은 얼마인가?90.71867611 값이 나왔다. 이는 unmapped는 기존 K12 gene들과 많이 다르며 K12가 아니라 다른 종에서 유입되었을 확률이 크다라는 점을 강조한다.위에서 사용한 GeneMark로 예측한 유전자 중에서 COG DB로 검색했을 경우, hit가 되는 유전자의 갯수와 hit가 되지 않는 유전자의 갯수는 각각 몇 개인가? 이 두 그룹 간에는 평균 단백질 길이의 차이가 관찰되는가?Hit된 것 : 3443개.Hit 되지 않은 것 : 4318 – 3443 = 875개.Hit가 된 단백질 서열 길이 평균:평균 길이 : 292.1711Hit 되지 않았던 단백질 서열 길이 평균:142.4869개 이다. Hit 되지 않았던 단백질 서열 길이 평균이 더 짧다.Nucmer를 이용하여 콘티그들을 매핑을 시도하였을 때, 매핑되지 않았던 26개의 콘티그에서도 operon이 예측되는가?예측 된다.위에서 찾은 operon 중에서 가장 흥미로운 것을 선택하고, 이 operon에 속하는 유전자들의 biological function은 무엇이라 추정하는가?제일 많은 gene을 포함한 operon을 찾으면 C에 있다.C는 Energy production and conversion. 기능에 대표적이며.이렇게 Nuo gene들이라는 것을 알 수있다.이처럼 산화환원효소들이다.

자연과학| 2021.09.20| 7페이지| 2,500원| 조회(130)

유전자, 학교 과제, 미생물 유전체

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워드 카운팅 과제 작성 내용

빅데이터 분산컴퓨팅 과제출력 개수 =38개 출력.주어진 Shakespeare 소설을 사용하여 WordCount를 pyspark을 사용하여 구현하시오. 구현 할 때, singlegram, bigram 모두를 사용하여 word를 count 해야 하며, 내림차순으로 가장 많이 나오는 단어를 38개만큼 출력하시오.*데이터: Shakespeare.txt*조 건1) 특수 문자( !_#@$%^&* )를 제거한 데이터 사용을 위해서 regular expression syntax를 이용한다.2) 단어를 모두 소문자 형태로 바꾼 후 사용위의 removePunctuation함수에 .lower()이 포함되있고removePunctuation함수를 사용한 data를 data_p에 저장한다.3) 단어의 앞,뒤 공백 제거 후 사용removePunctuation함수를 사용할 때 .strip()을 사용하였고 .split()를 하면 white space기준으로 잘리므로 공백은 포함되지 않는다.예시) “i am a boy” => [(i, am), (am, a), (a boy), (i), (am), (a), (boy)] 형태로 분해하여 wordcount.위 처럼 single gram, bigram나눠서 실시했다.전체적인 코드 모습:특수 문자들을 없애고 소문자로 변환, 문장 앞 뒤 빈칸을 지우는 함수를 정의한다.Data를 불러오고 특수 문자들을 없애고 소문자로 변환, 문장 앞 뒤 빈칸을 지우고 bigram을 구하기 위해 line을 enter기준으로 자르고 zip함수를 이용해서 bigram을 구하고 그 값이 존재하는 것을 count를 하고 single gram역시 실시하고 union이라는 함수를 이용해서 합친다.위는 single gram과 bigram을 고려한 word count를 출력하는 code이다.import redef removePunctuation(text):"""Removes punctuation, changes to lower case, and strips leading and trailing spaces.Note:Only spaces, letters, and numbers should be retained. Other characters should should beeliminated (e.g. it's becomes its). Leading and trailing spaces should be removed afterpunctuation is removed.Args:text (str): A string.Returns:str: The cleaned up string."""#return re.sub(r'[!,_'#@$%^&*().~{}]','',text.lower().strip())return re.sub(r'[^a-z0-9s]','',text.lower().strip())data = sc.textFile("data/bigdata_report/shakespeare.txt", 8)data_p=data.map(removePunctuation)dataRDD1 = data_p.flatMap(lambda line: line.split('n'))data_bi= dataRDD1.flatMap(lambda line: zip(line.split()[:-1], line.split()[1:])).filter(lambda bigram: len(bigram)>0).map(lambda word:(word,1)).reduceByKey(lambda a,b: a+b).union(data_p.flatMap(lambda line: line.split()).filter(lambda singlegram: len(singlegram)>0).map(lambda word : (word,1)).reduceByKey(lambda a, b : a + b))top38wc = data_bi.takeOrdered(38, key=lambda (w,c): -c)print 'n'.join(map(lambda (w, c): '{0}: {1}'.format(w, c), top38wc))*출력 화면 예시the : 27842and : 12984i, am : 10238결과 값 출력:참고로 bigram은 76번째부터 존재한다....

공학/기술| 2021.09.20| 4페이지| 2,500원| 조회(121)

분산컴퓨팅, 워드카운팅, 빅데이터 분산컴퓨팅

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유전체학개론 과제 자료입니다.

닉네임 : ****SRR490124의 reads를 ngsShort으로 trimming한 후에 bwa로 매핑한 결과 파일에서, 양 쌍끝 서열이 모두 매핑되지 않은 reads를 모아서 SOAPdenovo로 조립를 하여 얻어진 콘티그 중에서 3개를 스캐폴딩함으로써 길이가 4619 bp인 스캐폴드를 하나 얻었다. 이 3개의 콘티그들은 각기 스캐폴드의 어느 부위에 해당하는가?SOAPdenovo 사용시에 -K를 47로썼을 때 contig 3개가 확인되는데 그것을 말씀하시는 것 같다. 이는 K47.contigPosInscaff라는 결과 파일을 보면 확인할 수 있다.>scaffold19 0 - 23285 2336+ 4037 2774- 1845얻어진 5개의 contig중에서 contig 9번은 scaffold에서(4619 bp) base position 0에서부터 2328까지 이고 contig 5번은 2336에서 2739까지이고 contig 7번은 2774부터 4619 (마지막 base position)까지 이다.1번 문제의 조립에 사용된 reads들을 다시 스캐폴드에 매핑하여, 이 스캐폴드에 있는 2개의 gaps 중에서 35개의 “N”으로 표시된 부분에 걸칠 것으로 예상되는 reads를 선별하여 bam 파일로 저장하라.K12 reference sequence에 mapping되지 않았던 MT203 sequences read들을 SOAPdenovo라는 program으로 K옵션을 47로 assembly했을 때의 scaffold sequence이며 N의 연속적인 sequence로 된 gap이 2군데 존재한다.이중 35개의 N으로된 gap이 scaffold에 어느 부분에 쉽게 존재하는지 K47.contigPosInscaff라는 결과 파일을 보면 확인할 수 있다.>scaffold19 0 - 23285 2336+ 4037 2774- 1845Contig 5번과 7번사이에 scaffold에서 2739bp- 2774bp사이에 35개의 gap이 존재하며 이사이의 reads들을 뽑기위해bwa index K47.scafSeqK47.scafSeq를 index한다.bwa mem K47.scafSeq trimmed_490124_1.unmapped.fq trimmed_490124_2.unmapped.fq > trimmed_490124_unmapped.K47scaf.samunmapped reads를 K47.scafSeq에 mapping한다.samtools view -b trimmed_490124_unmapped.K47scaf.sam | samtools sort > trimmed_490124_unmapped.K47scaf.sorted.bammapping한 것을 bam파일로 바꾼다.samtools view -b trimmed_490124_unmapped.K47scaf.sorted.bam scaffold1:2730-2780 > K47scaf_2730_80.bam2739bp- 2774bp사이이지만 많은 read들을 하기 위해 넉넉잡아 scaffold에서 2730bp -2780bp사이를 bam file로 만들었다.2번 문제의 bam 파일에 저장된 reads를 SOAPdenovo를 이용하여 조립하라 (“-K 47”를 추천). 얻어진 콘티그 또는 스캐폴드 서열을 1번 문제의 스캐폴드와 비교하여 gap에 해당하는 서열을 추정하라 (NCBI blastn “Align two or more sequences” 옵션 추천) (10점).-K를 47로 추천하셨지만 자꾸 에러가나서 K(SOAPdenovo는 K값 홀수만 가능)를 43으로 해봤다.결과로 contig가 하나 만들어지는데 이게 정말 제대로 되었는지 1번 문제의 스캐폴드와 비교하였다. 5개 missense : protein기능에 가장 영향을 끼쳤던 것 -> ENST00000481731, ENST00000486775 SIFT: deleterious 심각한 영향 줄 거라고 예측, polyphen은 benign이다.chr20:23345844-> 2개 missense variant SIFT: tolerated, polyphen: benign 심각한 변화를 주지 않을 것이라고 예측됨또한 이들 중에서, 전세계 인구집단과 비교하였을 때 매우 희귀한 변이는?chr20:1459060은 rs6042507로 알려져있다.chr20:23345844는 rs6048760이라고 지금은 알려져 있다.두 개의 MAF (Minor allele frequency)를 확인해보면 chr20:1459060는 rs6042507로 보면 G가 더 많지만 reference가 T로 되있고 chr20:23345844는 C가 더 많지만 reference가 A로 알려져 있다.둘 중 희귀한 변이는 rs6042507이고 reference가 희귀한 변이를 가지고 있다.RNA-seq를 이용하여 fusion gene을 찾는 원리를 간략히 설명하시오.RNA-seq data를 이용해서 reference genome에 mapping하면 서로 다른 chromosome에 상이한 mapping되는 read들을 확인할 수 있을 것이다. 이 reads들의 개수와 quality가 유의한 정도면 fusion gene이라 판단되는데 상이한 mapping 결과로는 한 read가 split mapping될 수도 있고 한 쌍의 reads중에서 짝끼리 다른 chromosome에 mapping될 수 도 있다. 즉, 간단하게 sam flag에서 properly mapped가 아닌 것을 뽑고 이들의 quality와 depth를 확인하여 fusion gene을 찾는다.ENCODE 프로젝트에서 수집한 NGS 기반 오믹스 데이터는 어떤 것들이 있는지 각각 한 문장으로 간략히 설명하시오.5C : chromatin structure- sequence가 구조적으로 가까이 있음을 확인한 dataDNase-seq and FAIRE-seq : open chromatin을 확인ChIP-seq : histone modifications and DNA binding of over 100 transcription factors를 확인RNAseq and CAGE : RNA transcription에 대한 양 등을 확인

자연과학| 2021.09.20| 10페이지| 2,500원| 조회(237)

유전, 시험준비, 유전체학개론

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해외대학 체험 레포트

글로벌 문화와 해외 대학 체험.- 기말과제 Portfolio.CONTENTSCHAPTER 1. 자신이 공부할 대학 및 학과의1년(대학원은2년/ 교환학생은6개월)의 Module Curriculum.1CHAPTER 2. 자신이 공부할 대학 및 학과의 특징, 장점 및 장학금과 같은 학생 지원 정보.4CHAPTER 3. 자신이 거주할 지역 및 대학 내에서의 Non-Academic Activities.7CHAPTER 4. 학업계획서 (Statement of Purpose).9글로벌 문화와 해외 대학 체험 Portfolio. 1Chapter 1자신이 공부할 대학 및 학과의1년(대학원은2년/ 교환학생은6개월)의 Module Curriculum.2016년 7월 15일 더운 여름이다. 나는 땀을 흘리며 교수님의 방문을 두드렸다.‘똑 똑 똑...’“네”“안녕하세요. 교수님.”교수님은 나에게 가까이 와서 앉으라고 하셨다.“제가 조사하라는 것은 다하셨나요?”나는 그렇다고 대답하며 준비한 학교의 Curriculum을 보여드렸다.“이게 어느 학교죠?”내가 가고 싶은 대학교는 캘리포니아 대학교 샌디에이고이다. 그렇다. 생물학에 있어서 매우 강력한 스펙이 아니면 엄두도 못 낼 학교이다. 그러나 나는 꿈은 크게 가지고 싶었다. 일단 해보고 안 되면 다른데도 지원 할 생각이다. 이 학교가 유명한 것은 많은 노벨상 수상자를 배출해 냈다는 점과 생물 연구소와 병원을 두루 가지고 있고 슈퍼컴퓨터와 최신 실험도구들이 있어서 생물학 연구에 있어서는 최고의 장소이다.“이게 무슨 학과의 Curriculum인가요?”“뉴로..사이언스..”“유로? 아 유럽연합이요?”“아니요! 뉴로요 뉴로... 신경”갑자기 또 수업시간 때 한 교수님께서 하신 말씀이 생각났다. ‘내가 나이만 젊었어도 신경과학 공부를 할 텐데...’라고 하신말씀이 수업이 끝난뒤 내 귓가에 맴돌았다. 요즘 신경과학은 과학의 대세라고 할 수 있다. 나에게 더 큰 계기는 ‘메타생각’이라는 책을 읽고 난 뒤였다. 그 책을 읽고 나는 ‘뭔가 뇌에 대한 많es들은 다 이루어져야 하며 물론 다른 전공학도 들어야 하며 제한은 없다. Minor proposition course & exam은 얼마나 잘 신경과학을 이해했고 지금 논문을 쓰고 있는 실험을 잘 이해했는지에 대한 시험이며 각 담당교수님께서 채점을 실시한다. Complete TA requirement는 한 사분기를 교직에서 학생들을 가르쳐야 한다. 그리고 마지막으로 논문평가를 받아야한다. Molecular and Cellular Neuroendocrinology의 연구소에서는 주로 기억력과 관련된 연구를 수행한다. 매우 관심이 가며 나는 Developmental Neurobiology (Dr. Greg Lemke), Neuropsychopharmacology (Drs. Mark A. Geyer and David Segal) 를 포함한 다른 전공학도 많이 들어 폭 넓은 공부를 할 생각이다. Molecular and Cellular Neuroendocrinology는 주로 성장할 때, 생식 기능에서, 스트레스를 받을 때 내분기계 호르몬과 신경계간의 상호조절에 대한 topic으로 강의가 진행되며 최신의 연구결과를 주로 공부한다.다음 사진들은 교수님에게 보여준 들어야 되는 3학기동안의 core courses이다.Research Round는 발표수업이다. 현재 자신이 연구하고 있는 것을 발표하고 과학적인 질문을 한다.다른 open lecture 필요 없이 전공과 관련된 공부에 주력하려고 한다.Chapter 2자신이 공부할 대학 및 학과의 특징, 장점 및 장학금과 같은 학생 지원 정보."잘 알겠는데 붙을 수 있겠어요? 다른 학교도 많은데...“나를 못 믿으시는 듯하다.“보시면 컴퓨터와 관련된 과목들도 있잖아요. 저 컴퓨터도 융합전공이라고 해서 이 부분을 어필하면 될 수 도 있지 않을까요?”“지원 자격이랑 등록금은 어떻게 되죠?”교수님께 준비한 자료를 보여드렸다.보다시피 기본적인 테스트를 봐야하고 공인 영어점수가 필요하고 추천서 3장 그리고 SOP가 필요하다.등록금은 어ffice Box 7307 New York, NY 10116-7307로 동봉하여 보내면 된다. 최고 $6,000까지 지원 해주며 미국에 있는 대학생과 대학원생을 대상으로 한다. 주로 대학이나 사회에 얼마나 많은 공헌을 했고 평화와 정의 실현을 했느냐를 본다. 이외에도 학교에서 하는 장학금을 보면 해외 학생대상으로 Engelhorn Family Scholarships, Osher Foundation Scholarships등 여러 가지가 있었지만 대게 학부생 대상이었다. 그런데 주목할 만 한 점은 Neurosciences Graduate Program 에 의한 Student Funding/Stipend이 존재한다는 것이다. Funding 은 매년 일학년에게 $1,000씩 제공한다. 그리고 학교를 다니면서 연구소에 있으면서 또 교사활동을 하면서 급여를 받는다. 그리고 논문 또는 자기 실험에 있어서 support를 받을 수 도 있다. NSF Graduate Research Fellowship Program (GRFP), Ruth L. Kirschstein National Research Service Award (NRSA) Predoctoral Fellowship등 해당하는 여러 군데가 존재한다.“이 학교 말고 다른 학교는 알아봤나요?”“그건 아직... 여기밖에 못 봤습니다.”이 학교를 고른 이유는 앞에서 말했듯이 생물학연구에 안성맞춤이라는 점도 있었지만 학교가 해안가 옆이라 매일 학생들은 서핑을 주로하거나 해수욕을 즐긴다고 한다는 점이 나를 이끌었다. 그리고 이 학교를 관심 있게 볼 때쯤 한 교수님 성함이 눈에 들어왔다. 바로 라마찬드란 교수님이었다. 이분은 생리학을 전공하셨지만 지금은 신경과학을 통계학 쪽으로 연구하시는 것 같다. 전에 라마찬드란 교수님의 TED강의를 본적이 있어서 교수님이 있으신 학교라고 생각하니 더욱 가고 싶어졌다.또한 UCSD는 신경과학에 있어서 유명하다.“잘 알겠습니다. 한설 학생이 가기 전에 더 필요한 것이 없는지 알아보도록 하세요.”“네s student, admitted to University of California, San DiegoApplicant : ***University of California, San Diego9500 Gilman DrLa Jolla, California 92093Dean of the Graduate DivisionDate : December 2 2016To whom it may concernNow I am writing a one man story. he like biology than above all else. But I have noticed while writing my essay that there is no a sufficiency of writing. However his figure is cream of crop. So I could write. His name is ***. I believe that he will be the best.*** is a man who has good luck whenever doing something. In our life, people undergo hard times respectively and this pain also came to me as usual; however, he believed that he could overcome this by getting rid of it with my luck. For instance, when he took ***, he expected that he might fail this exam because he did not prepare the exam. However, he passed the exam and this experience made me confident about the existence of his luck. Moreover, in military, he met the senior of his university as a senior in nce of one’s specialty in the army is worthwhile. Moreover, he submit finished school assignments at the same time. On the day, he had to documents for schoolwork and military so quickly. he regretted my decision because he failed that application. Therefore he had to change my application for the infantry. Thus, I concluded that I have to better control my short temper for the more nice future.Having studied for four year at the department of biomedical systems at ** University, his grade constantly increased and he was working as good researcher who there is no lateness. His dream is that take nobel prizes. I guess that emerge new person who take nobel prize of neuroscience part in University of California, San Diego.Brain is universe. In order to know the universe, We need minimal lucky, patience, scientific knowledge. I seem to who have everything man is ***. So I believe that he will be the best. I really appreciate you for reading my resume.Your Sincerely***.1) 캘리포니아 대학교 샌디에이고(UCl

인문/어학| 2021.09.20| 12페이지| 2,500원| 조회(164)

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