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"BLOSUM matrix" 검색결과 1-19 / 19건

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    아주대 생명과학실험 생물정보학 실습
    MatrixBLOSUM62가 아닌 BLOSUM30, BLOSUM90으로 옵션을 변경 시 결과는 어떻게 달라지나요?BLOSUM30Bat-RaTG12와의 비교Pangolin(천산갑) ... 었다. BLAST 검색은 BLOSUM62와 같은 채점 매트릭스를 사용한다. BLAST는 시퀀스의 중요한 패턴만을 검색하므로, FASTA보다 시간 효율적이면서도 상대적으로 민감 ... Substitution Matrix) 매트릭스는 생물정보학 분야에서 단백질의 서열 정렬에 사용되는 중요한 치환 매트릭스이다. 이 매트릭스는 진화적으로 다양한 단백질 서열 간
    리포트 | 14페이지 | 1,500원 | 등록일 2024.04.15
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    아주대 생물학실험1 결과보고서 [7주차 생물 정보학] (점수 10/10, 에이쁠)
    Matrix의 약자이다. 이는 단백질의 서열 정렬에 사용되는 치환 매트릭스이다. BLOSUM 매트릭스는 진화적으로 발산하는 단백질 서열 간의 정렬을 점수화하는 데 사용하고 로컬 ... 할 수 있다.(2)BLOSUM Matrix의 종류와 용도Matrix용도Similarity(%)BLOSUM 90서로 정말 비슷한 서열의 유사성을 비교할 때 사용한다. 서열의 길이가 짧 ... 에서 일정 부분을 추출하여 각각 자른 word에 점수를 부여하여 분석에 이용3. BLOSUM(1) BLOSUM의 정의 : 생물정보학에 BLOSUM은 BLOcks Substitution
    리포트 | 25페이지 | 2,000원 | 등록일 2024.01.30
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    생물정보학 결과보고서
    타입으로 나뉜다2) BLOSUM : Blocks Substitution Matrix Matrix의 약자로 단백질의 서열 정렬에 사용되는 치환 행렬이다한 아미노산이 다른 아미노산 ... 으로 바뀔 가능성 즉 두 아미노산의 유사성을 나타내며 아미노산 사이 생물학적 화학적 관계를 반영해 점수를 매긴다 BLOSUM 점수행렬에서 양의 수는 두 아미노산이 서로 잘 바뀔 수
    리포트 | 14페이지 | 1,000원 | 등록일 2023.11.13
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    아주대학교 생물학실험1 7주차 생물정보학 실습 보고서 만점입니다
    .BLAST 프로그램의 유형3) BLOSUM (EMBOSS NEEDLE)BLOSUM (Blocks Substitution Matrix)단백질 서열의 서열 유사성 판단할 때 유용 ... 하게 쓰임.한 아미노산이 다른 아미노산으로 바뀔 가능성(두 아미노산의 유사성)을 나타.냄BLOSUM은 점수행렬을 사용. 양의 수는 두 아미노산이 서로 잘 바뀔 수 있는 경우를 의미 ... 하며, 음의 수는 그 반대, 즉 두 아미노산이 서로 잘 바뀌지 않는 경우를 의미함.점수가 높으면 높을수록 homology(항등성)가 더 있다고 판단함.BLOSUM 점수 행렬의 종류
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 11페이지 | 2,000원 | 등록일 2022.01.29
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    [일반생물학실험]생명정보학 실습
    는 서열이다.② Seed 서열 : Query Sequence에서 일정 부분을 추출하여 각각 자른 word에 점수를 부여하여 분석에 이용 한다.라. BLOSUM생물 정보학 ... 는 대상 단백질 또는 유전자 서열을 데이터베이스와 비교하여 query sequence와 유사한 데이터베이스 서열을 식별할 수 있다.Matrix사용할 때Similarity ... (%)BLOSUM 90서로 정말 비슷한 서열의 유사성을 비교할 때 사용한다. 서열의 길이가 짧지만 그 내에서도 다른 점을 찾고 싶을 때 이용한다.70~90BLOSUM 80BLOSUM 90
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 6페이지 | 2,500원 | 등록일 2022.06.17
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    생명과학실험 A+) 생물정보학 실습 결과 레포트
    -SARS-CoV 순이다. 이는 BLOSUM62의 기준에서 측정한 값들로 판단한 결과이다. BLOSUM MATRIX의 설정에 따라 값이 다르게 나온 이유는 BLOSUM90의 경우 ... 의 핵산 일치하는 단어가 있는지 데이터베이스 내에서 검색한다. 양방향으로 matching hit를 확장한 후, 정렬을 생성하고 통계량을 생산한다.4. BLOSUM-서열 정렬에 가장 많이 ... ) NCYFPLNSYGFQYTTG (단백질서열)BLOSUM62, Word size:6 설정-ㄱ2019년 신종 코로나바이러스2. BLOSUM 실습1) Bat-RaTG12아미노산 서열
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 13페이지 | 1,000원 | 등록일 2022.06.29
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    [생물학실험1] 생물정보학
    [4]- Blocks Substitution Matrix 의 약자- 아미노산 서열을 정렬할 때, BLOSUM이 사용된다.- 단백질 서열들 간 서열 유사도를 비교, 분석할 수 있다. ... - Blastn : 핵산(DNA) 서열을 DNA 데이터베이스로부터 찾고자 할 때 사용한다.Blastp : 단백질 서열을 단백질 데이터베이스로부터 찾고자 할 때 사용한다.4) BLOSUM ... 을 입력한 후, “BLAST” 버튼을 클릭한다.2) BLOSUM 사용 방법- 첫 번째 빈칸에 첫 번째 아미노산의 서열을 입력하고 두 번째 빈칸에 두 번째 아미노산 서열을 입력한 후
    리포트 | 17페이지 | 2,000원 | 등록일 2024.07.31
  • 아주대학교 생물학실험1 세포정보학 실험 결과보고서
    다. 이 값은 sequence 데이터베이스 크기에 따라 다르며 시퀀스 길이에 비례한다. 3) BLOSUM(Blocks Substitution Matrix): 아미노산 서열을 정리 ... 1. 실험 목적 - BLAST의 원리를 이해하고 사용방법을 익힌다. 이를 활용하여 주어진 아미노산 서열 정보를 기존 데이터베이스와 비교하고 동정해본다.- BLOSUM 점수행렬 ... 하는 알고리즘. 한 아미노산이 다른 아미노산으로 바뀔 가능성(두 아미노산의 유사성)을 나타낸다. BLOSUM 점수행렬에서 양의 수는 두 아미노산이 서로 잘 바뀔 수 있는 경우(유사도가 높
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 7페이지 | 2,500원 | 등록일 2020.12.17 | 수정일 2020.12.19
  • [아주대] 생물학실험1 생명정보학 보고서 A0
    과 단백질 서열을 검색하는 BLASTp가 있다. 또 다른 분석방법으로 BLOSUM(Blocks Substitution Matrix)이 있는데 BLOSUM은 블록처럼 틈이 없는 서열정렬 ... 에서 아미노산들의 치환 정도를 정리한 행렬표를 말한다. 따라서 서로 비교할 두 개의 단백질 서열을 각각 입력하면 유사성을 수치적으로 알 수 있다. 이때 BLOSUM을 만드는 데 ... 쓰이는 서열 정렬은 사용된 서열들의 퍼센트 동일성에 따라 단어 끝에 숫자를 붙인다. 예를 들어 BLOSUM60은 60%의 서열동일성을 가진 서열들 중에서 아미노산들의 치환을 계산해서
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 9페이지 | 2,000원 | 등록일 2021.01.14
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    생물 정보학 리포트
    -SARS-CoV-2와 가장 유사하다. (2). 유사성을 비교하는 BLOSUM matrix를 기본 옵션인 BLOSUM62가 아닌 BLOSUM90과 BLOSUM30으로 바꿨을 때 결과 ... 인지 알아보는 실험과 단백질 서열의 서열 유사성을 비교하는 실험을 진행해 보도록 한다. 이 과정에서 BLAST와 BLOSUM을 이용하여 실습을 해보도록 한다. 실험 결과 1 ... 에서 betacoronavirus로 변경하였을 때, entrez record가 변경되었다. 2). BLOSUM 실습 과제 (1). 위 표의 첫 번째 서열은 현재 전 세계적으로 유행하고 있
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 10페이지 | 1,000원 | 등록일 2022.07.08 | 수정일 2025.01.28
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    아주대학교 생물학실험1 (A+보고서) 생물정보학
    과 Blastp가 핵심이다.BLOSUM: 단백질간 서열의 유사성을 확인 할 때 사용하는 tool이다. Blocks Substitution Matrix로 한 아미노산이 다른 아미노산 ... BLOSUM오리너구리의 PTPN4 유전자 mRNA 아미노산 서열의 일부와 바늘두더지 아미노산 서열을 90matrix에서 비교한 결과 similarity가 120/120으로 100 ... 으로 바뀔 가능성 즉 두 아미노산의 유사성을 나타낸다. 이것은 진화적 유연관계로 이해 할 수 있다. BLOSUM의 경우 행렬로 아래와 같이 필수아미노산 20개가 나열되며, 이
    리포트 | 11페이지 | 1,500원 | 등록일 2024.02.12
  • [아주대 생명과학실험] 생물정보학 실험 보고서
    째 아미노산 서열을 각각 입력한 뒤 Submit을 눌러 유전자의 단백질 정보를 확인한다. (More options… 배너를 클릭해 BLOSUM matrix 와 같은 옵션을 재설정할 수 ... 이 존재하는 것이다.(2) BLOSUM 실습BLOSUM 90 matrix를 이용하여 주어진 오리너구리의 PTPN4 유전자 일부와 가장 유사한 아미노산 서열을 가진 종은 무엇인지 보고서 ... .2 BLOSUM 실습 과제5.2.1 사람-오리너구리 비교 결과5.2.2 바늘두더지-오리너구리 비교 결과5.2.3 개-오리너구리 비교 결과5.2.3 주머니쥐-오리너구리 비교 결과5
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 21페이지 | 1,500원 | 등록일 2022.08.30 | 수정일 2022.09.01
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    아주대 생물학실험 1 생물정보학실습
    는 서열 정렬은 사용된 서열들의 퍼센트 동일성에 따라, 단어의 끝에 숫자를 붙인다.① BLOSUM 점수 행렬Matrix사용할 때Similarity(%)BLOSUM 90서로 정말 비슷 ... 다. Percent Identity는 쿼리가 시퀀스와 얼마나 유사한지 설명한다.5) BLOSUM서열 정렬에 가장 많이 쓰이는 치환 행렬이다. 1992년 PNAS저널에 헤니코프 부부 ... 한 서열의 유사성을 비교할 때 사용한다. 서열의 길이가 짧지만 그 내에서도 다른 점을 찾고 싶을 때 이용한다.70~90BLOSUM 80BLOSUM 90을 이용한 서열보다는 긴 서열
    리포트 | 12페이지 | 1,500원 | 등록일 2024.03.18
  • 생물정보공학- 기출문제정리
    지 않는 이유도 부연 설명하시오 (15점).Dot matrix를 이용해서 서열정렬 할 경우의 기본 방법은 어떻게 되는가?. 그리고 Dot matrix를 이용한 서열정렬 방법이 갖 ... 여 Frequency Matrix, Position-Specific Scoring Matrix를 작성하시오 (단, 서열의 위치간은 상호 독립적인 것으로 간주할 것. PSSM은 log-odds sc ... 하시오 (10점).3. BLOSUM 과 PAM 매트릭스에 붙는 수치 (ex, BLOSUM 80, PAM 250)가 의미하는 바가 무엇인가 간략히 설명하시오 (8점).4. Gap
    Non-Ai HUMAN
    | 시험자료 | 8페이지 | 3,500원 | 등록일 2020.12.10
  • 생물정보학 정리
    retag-odds score : PAM matrices converted to log-odds matrix-Annotation : row data에 addictive ... , biological 분석 프로그램 제공4.BLOSUM과 PAM 숫자가 가지는 의미*PAM(Percent Accepted Mutation): 100개를 기준으로 mutation 생긴 것-PAM 1 ... 고 있다.*BLOSUM(Blocks Amino Acid Substitution Matrices)-BLOSUM 60 : 사용한 sequence의 similary 60이상
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 3페이지 | 1,500원 | 등록일 2020.12.10
  • Pairwise Sequence Alignment 목적과 방법 소개
    . Initialize matrix to match scores (0 or 1) → 초기화과정!!!2. Do summation operation → 가중연산하기!!!!: Finds the
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 4페이지 | 2,000원 | 등록일 2020.12.10
  • 단백질 서열 분석 보고서
    수SARS-CoV-related69.5%, 262.069.5%, 178.067.8%, 192.0위의 표는 EMBOSS Needle 알고리즘을 이용하여 BLOSUM Matrix 옵션 ... Simiarlity는 98.8%, Score는 325.0으로 가장 높게 나왔기 때문이다. 또한, 다른 BLOSUM Matrix 에서도 가장 높은 유사성을 띠는 것을 보아 Pangolin ... (천산갑)-CoV가 Human-SARS-CoV-2와 가장 유사한 아미노산 서열을 가진 바이러스임을 알 수 있다.유사성을 비교하는 BLOSUM matrix를 기본 옵션인 BLOSUM
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 8페이지 | 1,000원 | 등록일 2020.11.25
  • 카이스트 Bioengineering Laboratory 1 lab2 Protein Sequence Alignment
    .BLOSUM matrix는 amino acid 간의 유사도를 짧은 길이의 amino acids sample들을 통계적 분석을 통해 작성한 scoring matrix이 ... 다. BLOSUM 뒤에 숫자 X가 붙는데, 이는 최소 유사성이 X% 이상의 서열들을 모아서 작성한 BLOSUM matrix라는 것을 의미한다. X가 낮으면 서열의 동일성이 낮다는 것을 의미 ... 하므로 BLOSUM matrix를 구하기 위해 사용된 sample들이 유사성이 적은, 진화적으로 먼 것들을 이용하였다는 것을 말한다. 그러므로 BLOSUM30 같은 matrix는 진화
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 5페이지 | 1,000원 | 등록일 2015.01.04
  • 생물정보학 Glucansucrase를 조작 및 주문 시퀸싱 일련과정의 정리
    ubalignment - 10 개의 보고서 영역을 검색하고 싶을 땐 , 10 을 선택해준다 .③ Choose the Scoring matrix - BLOSUM 은 일반적으로 PAM 보다 낫 ... 다 . - BLOSUM80 을 BLOSUM45 대신에 적용하면 , the Local alignmnets 는 짧아지는 경향이 있다 .④ ResultsBuilding a Multiple
    Non-Ai HUMAN
    | 리포트 | 105페이지 | 2,000원 | 등록일 2008.06.11
  • 콘크리트 마켓 시사회
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2025년 11월 27일 목요일
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- 한국인의 가치관 중에서 정신적 가치관을 이루는 것들을 문화적 문법으로 정리하고, 현대한국사회에서 일어나는 사건과 사고를 비교하여 자신의 의견으로 기술하세요
- 작별인사 독후감