[일반생물학실험]생명정보학 실습

소개

"[일반생물학실험]생명정보학 실습"에 대한 내용입니다.

목차

1. 실험 목적

2. 실험 이론 및 원리
1) 생물정보학
2) NCBI
3) BLAST
4) BLOSUM

3. 실험 방법
1) BLOSUM
2) BLAST 사용방법

4. 실험 결과
1) BLAST 활용 실습
2) BLAST 실습 과제
3) BLOSUM 실습과제

5. 토의 사항
1) 실험 고찰

본문내용

1. 실험 목적
1.1. 생물정보학 학문을 이해하고 생물정보학 Tool을 사용하는 방법을 익힌다.
1.2. 생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 미지의 유전자를 데이터베이스에 대조하고 어떤 서열인지 탐구한다.
1.3. 생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 단백질 서열의 유사성을 비교해본다.

2. 실험 이론 및 원리
2.1. 생물정보학
생물학적인 문제를 응용수학, 정보과학, 통계학, 컴퓨터 과학, 인공지능, 화학, 생화학등을 이용하여 주로 분자 수준에서 다루는 학문으로 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 모든 분야를 포함하는 학문이다. 생명체가 가지고 있는 유전정보를 찾아내는 연구 사업을 유전체 사업이라고 하는데 이러한 유전체 사업의 결과로 얻어진 정보를 가공 처리하여 유용한 정보를 얻어내는 학문을 생물 정보학이라고 한다. 따라서 생물정보학은 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 모든 분야를 포함한다.

2.2. NCBI
미국 국립생물공학정보센터로 미국 보건성 산하 국립의학도서관의 운영 분야 중 하나이다. NCBI는 생명과학 및 의학 논문 인덱스의 데이터베이스인 PubMed, 유전체 서열 데이터베이스인 GenBank를 비롯하여 각종 생명공학 정보들을 담고 있다. 생정보학 전담부서로 컴퓨터를 활용하여 생물학 및 의학 분야의 방대한 데이터를 분석하기 위한 DB를 구축하고 분석도구를 개발하는 것이 주요 임무이다. 그렇기 때문에 가장 널리 쓰이는 분석 도구인 서열 검색용 프로그램 등을 개발하였다.

2.3. BLAST
Basic Local Alignment Search Tool의 약자로 아미노산 서열이나 DNA 염기 서열과 같은 생물학적 서열 정보를 비교하는 알고리즘으로 특정 서열을 데이터 베이스 서열과 비교, 동정한다.
Nucleotide BLAST : 획득한 유전자를 알기 위해 데이터베이스에 검색 할 수 있는 검색 엔진
Protein BLAST : 획득한 단백질 서열을 알고 싶을 때 이용하는 검색엔진

참고자료

· 없음