생물 정보학 리포트

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목차

1. 실험 목적

2. 실험 결과
1) BLAST 실습 과제
2) BLOSUM 실습 과제

본문내용

1. 실험 목적
컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 학문인 생물 정보학에 대해 이해하고, 생물 정보학 tool을 사용하는 방법을 익혀 미지의 유전자를 데이터베이스에 대조하여 어떤 서열인지 알아보는 실험과 단백질 서열의 서열 유사성을 비교하는 실험을 진행해 보도록 한다. 이 과정에서 BLAST와 BLOSUM을 이용하여 실습을 해보도록 한다.

2. 실험 결과
1). BLAST 실습 과제
(1). 각 5개의 DNA 및 단백질 서열은 어떤 코로나 바이러스인지 BLAST를 이용해 동정 후 보고서 결과에 작성
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(2). 명확하게 하나의 바이러스로 동정되지 않는다면, 그 서열은 어떤 것이며 어떤 다양한 종으로 동정되는지 작성, 그리고 왜 그런 결과가 나왔는지에 대해서도 서술
: CTCAAGGGTTGGAGACTCCATTGTTACAGCCTGTACTGGCTCTTGG 서열
Bat MERS-like coronavirus, Betacoronavirus England 1, BtVs-BetaCoV/SC2013, Coronavirus Neoromicia/PML-PHE1/RSA/2011, Human betacoronavirus 2c EMC/2012, Human betacoronavirus 2c England-Qatar/2012, Human betacoronavirus 2c Jordan-N3/2012로 하나의 바이러스로 동정되지 않는다.
BLAST에 입력된 서열이 짧아서 이런 결과가 발생했을 것이다.

(3). 슬라이드 25page를 참고하여 database를 betacoronavirus로 변경하여 검색해보고 standard database 결과와 차이를 제시
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참고 자료

없음