RAPD 마커를 이용한 인삼 품종 및 육성계통의 유전적 다양성 분석

서지정보

· 발행기관 : 한국국제농업개발학회
· 수록지 정보 : 한국국제농업개발학회지 / 25권 / 2호
· 저자명 : 방경환, 정종욱, 김영창, 조익현, 김장욱, 신미란, 현동윤, 김동휘, 차선우, 김기홍, 문지영, 노봉수, 김홍식

초록

RAPD 마커를 이용하여 인삼 품종 및 육성계통의 유전적 다양성 및 유연관계를 분석한 결과는 다음과 같다.
1. 총 130개의 primer 중 polymorphism을 나타내는 70개의primer를 선발하였고, 그 중 재현성이 있으면서 polymorphism이 높은 25개의 primer를 선발하였다. 증폭된 DNA 단편의수는 189개이고, PCR 산물은 100 ~ 2,800 bp 범위로 증폭되었다.
2. 각 primer에 의해 증폭된 DNA 단편의 수는 3개 ~ 17개로 다양하였으며, primer 한 개당 평균 7.6개의 DNA 단편이증폭되었다. OPD19 primer를 이용한 유전분석 결과, 총 5개의 유전양상이 나타났는데, 약 500 ~ 1,300 bp의 증폭산물에서품종 및 계통 간 유전적 다형성을 나타냈다.
3. 선발된 primer별 대립인자는 최소 1.33에서 최대 2.00의 범위였고, 평균 1.709이었다. primer별 유전적 다양성은 OPD15가 가장 높았고, OPF2가 가장 낮은 값을 나타내었다. 본 연구에서 분석에 이용된 25개의 RAPD primer 중에서 D15, D19, B5, A19등은 인삼 품종과 계통에서 비교적 높은 수의 대립단편과 높은 유전적 다양성 값을 나타내는 primer였다.
4. 유사도 계수 0.98을 기준으로 24개의 품종 및 계통을 대상으로 군집분석을 수행한 결과, 미국에서 수집 육성된 G04116과 국내 품종인 천풍, 연풍 그리고 국내 육성 계통인 G04009, G04026, G04069, G04084는 그룹을 형성하지 않았고, 17개의 품종 및 계통은 2그룹으로 분류되었다. I 그룹에는 고풍, 금풍과 12계통(85%), II 그룹에 3계통(15%)이 포함되었다.

영어초록

In this study, Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analyses were used to clarify the genetic polymorphisms among Korean ginseng cultivars and breeding lines and to classify them into distinct genetic groups. Among 130 primers in RAPD analysis, 25 primers were selected as the appropriate identification of genetic characteristics in Korean ginseng cultivars and breeding lines. Twenty-five RAPD loci generated a total of 189 DNA bands. Amplified PCR products were showed the highly reproducible banding patterns at 100 ~ 2,800 bp. The number of amplified bands for each RAPD primers ranged from 3 to 17 with a mean of 7.6 bands. In the case of OPD19 primer, 5 banding patterns were displayed in Korean cultivars and breeding lines. Banding patterns were approximately 500 to 1,300 bp amplicons. The number of alleles for each RAPD locus ranged from 1.33 to 2.00 with a mean of 1.71 alleles. OPD15 and OPF02 primers demonstrated the highest and the lowest genetic polymorphisms, respectively. Cluster analysis based on genetic similarity estimated by RAPD markers classified Korean cultivars and breeding lines into 2 groups. Group I included Gopoong and 11 breeding lines (50%); group II included 3 breeding lines (1.3%). Consequently, the results of ginseng-specific RAPD markers may prove useful for the evaluation of genetic diversity and differentiation of Korean ginseng cultivars and breeding lines.

참고자료

· 없음