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Real-time PCR을 이용한 유전자 발현 분석2025.01.231. 전사(Transcription) 수준에서의 유전자 발현 분석 기법들 유전자 발현 분석 기법에는 Single gene analysis와 Whole genome analysis가 있다. Single gene analysis는 개별 유전자의 발현량을 확인하는 실험 기법으로 Northern Blotting과 Real-time PCR이 있다. Whole genome analysis는 세포 내 전체 유전자의 발현량을 확인하는 실험 기법으로 RNA sequencing이 있다. 2. cDNA 합성에 사용될 수 있는 primer의 종류 cDN...2025.01.23
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유전자 발현 분석을 위한 RT-PCR 실험2025.01.041. PCR (중합효소 연쇄반응) PCR은 target DNA의 특정 염기서열을 복제하는 기술로, template DNA, primer, dNTP, DNA 중합효소 등이 필요합니다. 온도 조절을 통해 DNA 변성, primer 결합, 신장 단계를 반복하여 DNA 단편을 기하급수적으로 증폭할 수 있습니다. 2. real-time PCR real-time PCR은 PCR 과정 중 증폭되는 DNA를 실시간으로 모니터링할 수 있는 기술입니다. 형광 검출법을 사용하여 증폭되는 DNA 양을 정량적으로 분석할 수 있습니다. 이를 통해 초기 DN...2025.01.04
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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(Realtime PCR을 이용한 유전자 발현 분석)2025.01.231. RNA sequencing RNA sequencing은 DNA로부터 전사되는 모든 RNA 전사체의 염기서열을 차세대 분석기술을 사용하여 분석하는 기술이다. RNA sequencing을 위해서는 cDNA가 필요한데 cDNA를 준비하는 일반적 과정은 보통 RNA 추출>RNA 선택>cDNA 합성>라이브러리 제작으로 이루어진다. RNA 염기서열 분석 기술을 통해 alternative RNA splicing, 유전자의 발현량, 염기서열의 변이, gene fusion, single nucleotide polymorphism, SNP 등의...2025.01.23
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식물분자생물학실험 Real-time PCR (Quantitative RT-PCR) 결과보고서2025.01.181. RT-PCR RT-PCR은 RNA 서열을 DNA로 역전사하여 PCR을 통해 증폭하는 기술이다. 이는 RNA 기반 생명체의 유전자 발현 분석에 활용되며, COVID-19 팬데믹 당시 SARS-CoV-2 바이러스 검출에 중요하게 사용되었다. 2. Quantitative RT-PCR Quantitative RT-PCR은 유전자 발현량을 정량화하는 기술로, 실시간으로 형광 신호를 측정하여 유전자 증폭 정도를 확인할 수 있다. SYBR Green과 TaqMan probe 방식이 대표적이며, 각각 장단점이 있다. 3. C3H55 유전자 ...2025.01.18
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Gene Expression Analysis and Gene Set Enrichment Analysis2025.01.181. 전사체 데이터 유전 요인의 중요성이 부각됨에 따라 의료 분야에서는 사람들의 유전적 성향을 파악하여 질병을 예측, 예방하고, 개인의 유전정보를 기반으로 한 맞춤 의료 서비스에 관한 관심이 높아지고 있다. 맞춤 의료 서비스를 제공하기 위해서는 사람의 유전정보를 분석해야 하는데, 이 경우 전사체 (transcriptome: 세포나 조직에서 한순간 발현되는 전체 RNA의 모음을 의미한다. 이 RNA들을 이용하여 조직에 따라 발현되는 유전자들의 정보를 얻을 수 있다) 분석을 이용할 수 있다. 전사체 분석을 통해 정상 세포와 비정상 세포...2025.01.18
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분자생물학 실험 (A+)Agarose gel eelectrophoresis 결과보고서2025.01.041. Agarose gel electrophoresis Agarose gel electrophoresis는 DNA 분자를 분리하고 분석하는 기술입니다. 이 실험에서는 DNA 샘플을 아가로스 겔에 로딩하고 전기장을 가해 DNA 조각들을 크기에 따라 분리합니다. 이를 통해 DNA 조각의 크기와 양을 확인할 수 있습니다. 이 기술은 유전자 클로닝, DNA 서열 분석, 유전자 발현 분석 등 다양한 분자생물학 실험에 사용됩니다. 2. DNA 분리 및 분석 이 실험에서는 DNA 샘플을 아가로스 겔에 로딩하고 전기장을 가해 DNA 조각들을 크기...2025.01.04
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[생물공정실험] 3주차 Gene expression analysis by RT-PCR 예비보고서2025.04.261. cDNA 정의 및 합성 방법 cDNA(complementary DNA)는 RNA를 주형으로 역전사효소와 DNA 중합효소에 의해 합성된 DNA입니다. 역전사효소를 이용한 cDNA 합성에서는 RNA와 annealing 위치에 따라 3종류의 primer를 사용할 수 있습니다. (1) 역전사 효소 (reverse transcriptase; RTase), (2) RT반응에 사용하는 primer (oligo dT primer, random primer, gene-specific primer). 2. Downstream applicatio...2025.04.26
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생물공정실험 결과보고서 - Gene Expression Analysis by RT-PCR2025.01.041. Reverse Transcription PCR (RT-PCR) 이 실험의 목적은 reverse transcription PCR을 통해 얻은 cDNA 샘플을 real-time PCR로 증폭시키는 것입니다. 다양한 시약을 사용하여 cancer cell과 ADSC cell의 유전자 발현, 특히 housekeeping gene인 GAPDH와 target gene인 Thy-1의 발현 차이를 분석하고자 합니다. 2. Real-time PCR 분석 실험 결과를 통해 ΔCt 값을 계산하여 각 세포주에서 target gene인 Thy-1이 h...2025.01.04
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PCR을 통한 gene structure 분석2025.05.011. EtOH Precipitation DNA는 전하를 띄는 인산골격을 가지고 있어서 극성이다. 물도 극성이므로 물에 잘 녹는다. DNA를 뭉치게 하려면 물과 DNA간 결합을 약화시켜야 한다. Ethanol은 물보다 훨씬 덜 극성이다. 따라서 ethanol을 첨가하면 DNA의 인산기와 다른 양이온간의 결합이 강해지면서 DNA 침전을 형성한다. 이 과정을 위해선 적절한 양의 양이온이 필요하다. 너무 많으면 DNA와 같이 침전되고 너무 적으면 침전되지 못한 DNA가 생긴다. 이 실험에선 3M sodium acetate를 final 0....2025.05.01
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RNA 추출, cDNA 합성 및 qRT-PCR2025.01.181. PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR은 DNA의 상보적 가닥에 결합하는 2개의 프라이머를 동시에 사용하여 증폭을 원하는 DNA의 특정 영역만을 in vitro에서 복제, 증폭하는 기술이다. 3단계를 거쳐 DNA를 복제하는데, 변성, 결합, 신장 과정을 반복하여 DNA를 증폭시킨다. 2. RT-PCR (Reverse Transcriptase PCR) RT-PCR은 유전자에서 만들어진 RNA에서 역전사효소를 이용하여 cDNA를 생성한 후, cDNA를 주형 가닥으로 PCR을 수행하여, 유전자의 RNA 발현...2025.01.18