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[만점보고서]Plasmid DNA 추출과 DNA 정량 실험보고서2025.01.171. Plasmid DNA 추출 Plasmid DNA는 세균의 세포 내에서 염색체와 별개로 존재하는 자가복제 DNA이다. Plasmid DNA 추출을 위해 Alkaline Lysis 법을 사용하여 세포를 용해시키고 plasmid DNA를 염색체 DNA와 분리한다. 이 과정에서 다양한 buffer를 사용하여 pH 변화를 조절하고 불순물을 제거한다. 2. DNA 정량 Nanodrop 분광광도계를 이용하여 추출한 plasmid DNA의 농도와 순도를 측정한다. 260nm 흡광도로 DNA 농도를 측정하고, 260nm/280nm 및 260n...2025.01.17
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서울대학교 물리분석실험 FRET(2024)2025.01.231. FRET(Forster resonance energy transfer) FRET은 두 dye 사이의 non-radiative energy transfer로, donor dye가 들뜬 상태가 되면 acceptor dye에게 에너지를 전달한 뒤 바닥 상태로 돌아가는 현상이다. FRET efficiency는 실험적으로 측정되며 이로부터 두 색소 사이의 거리를 계산할 수 있다. 반대로, TCSPC(Time correlated single photon counting)를 이용해 형광 lifetime을 측정하면 이를 이용해 FRET ef...2025.01.23
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Cell Transfection and Cell lysis 레포트2025.01.211. Cell Transfection Cell transfection은 관심있는 외부 gene을 세포에 인공적으로 도입하여 외부 DNA가 세포 내에서 발현되도록 하는 과정입니다. 이를 통해 세포의 특성을 변화시켜 유전자나 단백질의 발현과 기능을 연구할 수 있습니다. 다양한 화학적, 물리적, 바이러스 매개 방법이 사용되며, 특히 HEK-293T 세포는 transfection 효율이 높아 널리 사용됩니다. 또한 epitope tagging 기술을 통해 단백질의 특성을 분석할 수 있습니다. 2. Cell Lysis Cell lysis는 ...2025.01.21
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[유전학] transfection method와 T7E12025.05.031. Transfection 방법 Transfection은 세포 내로 외부의 DNA나 RNA가 인위적으로 전달되는 과정을 의미한다. 핵산이 세포 내부로 들어가려면 세포막을 통과해야 하는데 이 방법에는 화학적, 생물학적, 물리학적 방법들이 이용된다. 대표적인 물리학적 방법으로는 Electroporation과 biolistics(유전자 총)이 있으며, 화학적 방법으로는 cationic lipid transfection이 있다. 각각의 방법들은 장단점이 있어 실험 목적과 이용하는 세포에 따라 선택하게 된다. 2. 새로운 Transfect...2025.05.03
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레닌저 생화학 정리노트 Ch11. 생체막과 수송2025.05.101. 생체막의 구조와 기능 생체막은 지질 이중층으로 구성되며, 다양한 지질과 단백질로 이루어져 있다. 생체막은 세포의 경계를 정의하고, 선택적인 물질 출입을 허용하며, 세포 내 대사산물 및 이온을 유지하는 등 다양한 기능을 수행한다. 생체막은 유동적이고 비대칭적인 구조를 가지며, 막 단백질은 수용체, 수송체, 효소 등의 기능을 담당한다. 2. 막 단백질의 종류와 특성 막 단백질에는 주변 막에 느슨하게 결합된 단백질, 양친매성 단백질, 그리고 강하게 통합된 막 관통 단백질 등 다양한 유형이 있다. 이들 단백질은 막에 다양한 방식으로 ...2025.05.10
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미적분을 이용한 혈류 속도 분석2025.04.291. 혈액의 구성과 기능 혈액은 운반, 응고, 조절 등의 다양한 기능을 수행하는 액상의 조직으로, 적혈구, 백혈구, 혈소판 등의 세포 성분과 혈장으로 구성되어 있다. 혈액은 우리 체중의 약 8%를 차지한다. 2. 하겐-푸아죄유 방정식을 이용한 혈류 속도 분석 혈류 속도는 혈관 직경, 혈관 길이, 혈액 점도, 혈압 등의 요인에 따라 달라지며, 하겐-푸아죄유 방정식을 통해 수학적으로 설명할 수 있다. 혈관 중심축에서 가장 빠른 혈류 속도가 혈관 벽면으로 갈수록 감소하는 이유를 이 방정식을 통해 증명할 수 있다. 3. 미분을 이용한 혈류...2025.04.29
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아주대 생실1) Plasmid DNA 추출 보고서2025.05.101. 플라스미드 DNA 추출 이 실험을 통해 플라스미드 DNA를 추출하고 전기영동을 통해 플라스미드 DNA의 형태를 관찰할 수 있었습니다. 플라스미드는 생장에 필수적인 염색체 DNA와 물리적으로 분리되어 있는 대표적인 에피솜 DNA 분자로, E.coli 세균에서 플라스미드를 추출하여 DNA를 관찰했습니다. 실험에서는 여러 가지 버퍼를 사용했는데, 이는 플라스미드 DNA 추출을 위한 것입니다. 실험 결과 3kb와 10kb 부분에서 플라스미드 DNA가 관찰되었으며, 3kb 부분은 Linear DNA, 10kb 부분은 Open-circu...2025.05.10
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생화학 실험/실습 보고서 (DNA Gel electrophoresis)2025.01.231. 제한효소 제한효소는 DNA의 특정한 염기배열을 식별하고 이중사슬을 절단하는 엔도뉴클레아제로서 재조합 DNA를 만들기 위해서 사용하는 특수한 효소이다. 제한효소의 종류에는 1형, 2형, 3형, 4형, 5형 등이 있으며, 각각 인식하는 염기서열과 절단 방식이 다르다. 하나의 플라스미드는 여러 제한효소에 의해 자를 수 있다. 2. 전기영동 Agarose gel에서의 DNA pattern은 smear, 용해되지 않은 물질과 고분자량의 DNA, RNA cloud, supercoiled plasmid, relaxed 또는 nicked c...2025.01.23
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Enzyme Activity- Colorimetric of Catalase2025.01.131. 효소 효소(enzyme)란 생체 내의 화학반응을 매개하는 단백질 촉매이다. 효소와 결합하는 특이적 반응물을 기질(substrate)이라고 하고 기질과 반응하여 활성화 에너지를 낮춰 반응을 촉진 시킨다. 기질의 입체구조와 효소의 활성부위가 맞아야 결합하여 반응이 일어나고 이를 기질특이성을 가졌다고 한다. 효소는 결국 단백질이므로 3차구조에 중요한 온도, pH 등 환경 조선이 활성 정도에 영향을 미친다. 촉매 작용에는 총 네가지 정도의 방법이 있다. 2. 카탈레이스 카탈레이스는 O2 대사 동안 생성된 과산화수소에 의한 산화적 손상...2025.01.13
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아가로스 겔 전기영동 실험실습 보고서2025.01.021. 아가로스 겔 전기영동 이 실험실습 보고서는 아가로스 겔을 이용하여 미지의 DNA를 분리하고 분석하는 과정을 설명합니다. 실험 과정에는 아가로스 겔 제작, 전기영동 수행, 결과 분석 등이 포함되어 있습니다. 아가로스 겔의 농도, DNA 샘플의 특성, 버퍼 사용 등이 전기영동 결과에 미치는 영향을 고찰하고 있습니다. 또한 실험 과정에서 겪었던 어려움과 배운 점도 함께 기술되어 있습니다. 1. 아가로스 겔 전기영동 아가로스 겔 전기영동은 생물학 및 분자생물학 분야에서 널리 사용되는 중요한 기술입니다. 이 기술은 DNA, RNA, 단...2025.01.02
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