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대장균에서 재조합 단백질 생산 및 정제2025.01.131. 재조합 단백질 생산 대장균 BL21(DE3) 균주는 재조합 단백질 고발현에 널리 사용되며, lac 프로모터와 T7 프로모터를 이용하여 IPTG 유도 하에 단백질을 발현할 수 있다. 본 실험에서는 pET28a 벡터를 사용하여 His-tag 융합 단백질을 생산하고, Ni-NTA 친화성 크로마토그래피와 FPLC를 통해 단백질을 정제하는 방법을 익혔다. 2. 단백질 분석 SDS-PAGE를 통해 단백질 크기별 분리와 정제 과정을 확인하였고, Bradford assay로 단백질 농도를 정량하였다. 또한 DES와 OASS 효소 활성 측정을...2025.01.13
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A+ 생화학실험 <13주차. His6-tagged Protein Purification> 레포트2025.01.201. 단백질 정제 단백질 정제(Protein Purification)는 생물학적 연구 및 산업적 응용을 위하여 단백질을 혼합물로부터 분리하고 정제하는 과정이다. 이 과정은 일반적으로 여러 단계를 거치며, 각 단계에서는 단백질의 용해도, 크기, 전하, 결합 친화도 등의 단백질 간 서로 다른 특성을 활용하여 단백질을 분리한다. 첫 번째 단계는 세포 용해(Cell Lysis)로, 세포벽을 파괴하여 세포 내의 단백질을 방출하는 것이다. 다음 단계는 affinity chromatography이다. 이 방법은 특정 단백질에 결합하는 리간드를 ...2025.01.20
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SDS-PAGE2025.01.121. SDS-PAGE SDS-PAGE는 단백질을 분리하는 기술로, 전기영동 이동성을 이용한다. 단백질은 SDS 처리를 통해 균일하게 음전하를 띠게 되어 분자량에 따라 분리될 수 있다. 이 실험에서는 단백질 발현에 IPTG의 영향을 확인하고자 하였으나 이전 실험 결과의 불확실성으로 인해 IPTG의 영향을 명확히 알기 어려웠다. 단백질 염색 결과를 통해 약 45 kDa 크기의 단백질이 분리된 것을 확인할 수 있었다. 2. Discontinuous Buffer System Discontinuous buffer system은 stackin...2025.01.12
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생명과학실험1 SDS-PAGE & Coomassie blue Staining2025.01.131. SDS의 역할 및 원리 SDS(sodium dodecyl sulfate)는 계면활성제의 일종으로 단백질이나 핵산의 구조를 깨뜨려 선형으로 만들어주는 역할을 한다. 아미노산의 소수성 부분과 hydrophobic interaction을 하며 결합하는데, 아미노산 2개당 1개 정도 binding하여 단백질을 변성한다. 2. Gel에 들어가는 시료의 역할 ① Tris-HCl: Stacking gel과 Resolving gel의 pH를 다르게 하여 각 gel에서 Glycine의 charge 다르게 조정해준다. 또한 Cl-를 첨가해주어서...2025.01.13
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연세대학교 생화학실험(1) 6주차 Peptide Mass Fingerprinting In-gel Digestion2025.05.041. Peptide Mass Fingerprinting (PMF) Peptide Mass Fingerprinting (PMF)은 단백질 동정을 위한 기술로, 단백질을 효소로 절단하여 생성된 펩타이드의 질량을 측정하고 데이터베이스와 비교하여 단백질을 식별하는 방법입니다. 이 기술은 SDS-PAGE를 통해 분리된 단백질 밴드에서 시작되며, 밴드를 절단하고 효소로 소화하여 생성된 펩타이드의 질량을 질량분석기로 측정합니다. 이렇게 얻은 펩타이드 질량 데이터를 데이터베이스와 비교하여 단백질을 동정하게 됩니다. 2. In-gel Digesti...2025.05.04
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분자생물학 실험 (A+) Purification of plasimid from bacterial cells 결과보고서2025.01.041. 분자생물학 실험 이 보고서는 박테리아 세포에서 플라스미드를 정제하는 실험에 대한 내용을 다루고 있습니다. 실험 과정에서 플라스미드 추출, 정제, 확인 등의 단계를 거치며, 실험 결과와 분석이 포함되어 있습니다. 이를 통해 분자생물학 실험 기법과 플라스미드 조작 기술을 익힐 수 있습니다. 2. 플라스미드 정제 박테리아 세포에서 플라스미드를 추출하고 정제하는 과정이 자세히 설명되어 있습니다. 세포 용해, 단백질 제거, DNA 정제 등의 단계를 거치며, 최종적으로 순수한 플라스미드 DNA를 얻는 것이 목표입니다. 이러한 기술은 유전...2025.01.04
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프로테오믹스 기법을 이용한 파골세포 활성 단백질 탐색2025.01.121. 파골세포의 활성 조절 파골세포는 뼈를 분해하는 역할을 하며, 이들의 활성은 호르몬 변화나 염증에 의해 촉진됩니다. 연구 결과, 파골세포 내의 CK-B 단백질이 이 세포의 활성을 조절하며, CK-B 단백질을 억제하면 뼈의 파괴를 막을 수 있다는 사실이 밝혀졌습니다. 2. 프로테오믹스 기법 프로테오믹스는 수백, 수천 개의 단백질을 한꺼번에 분석할 수 있는 방법입니다. 이를 위해 단백질 분리 정제 기법, 단백질 성상 분석 방법, 생물정보학을 이용한 정보 통합 등의 기술이 사용됩니다. 이를 통해 복잡한 생명 현상을 단백질 수준에서 이...2025.01.12
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SDS-PAGE and Protein Analysis2025.01.211. SDS의 역할 및 SDS-PAGE 원리 SDS(Sodium Dodecyl Sulfate)는 계면활성제로서 친수성과 소수성 부분을 모두 지니고 있으며, 단백질을 변성할 수 있는 물질이다. SDS-PAGE는 이러한 SDS의 특성을 토대로 하여 단백질을 분자량에 따라 band 형태로 분리하는 실험이다. 단백질은 그 구조와 전하, 분자량이 모두 다르기 때문에 SDS를 통해 단백질의 구조와 전하를 모두 일정하게 한 뒤 분자량에 의해서만 분석을 진행한다. 2. Gel에 들어가는 시료의 역할 Acrylamide와 N,N'-Methylene...2025.01.21
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A+ 생화학실험 <14주차. 단백질 분석 (SDS-PAGE)> 레포트2025.01.201. SDS-PAGE SDS-PAGE는 Sodium Dodecyl Sulfate (SDS)를 이용해 단백질에 음전하를 부여함으로써 Polyacrylamide Gel Electrophoresis (PAGE)를 수행하여 단백질을 크기에 따라 분리하는 전기영동 방법입니다. SDS-PAGE는 일반적으로 5~250 kDa 범위의 단백질을 분리하는 데 사용되며, 이 방법을 통해 단백질의 구조와 전하가 이동 속도에 미치는 영향을 제거할 수 있습니다. SDS에 의해 음전하를 띤 선형화 된 단백질은 전기장을 가했을 때 양극(+)을 향해 이동하며, ...2025.01.20
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LDH assay2025.01.231. 단백질 정제 실험 주제에서 다루고 있는 LDH assay는 단백질 정제 과정에 대한 내용을 포함하고 있습니다. 단백질 정제는 다양한 종류의 단백질이 섞여 있는 샘플에서 원하는 단백질을 분리하는 작업입니다. 크로마토그래피, SDS-PAGE, Western blot 등의 방법을 통해 단백질의 순도를 점차 높여나가는 과정이 설명되어 있습니다. 2. 효소 활성 측정 이 실험에서는 LDH(Lactate Dehydrogenase)라는 효소의 활성을 측정하는 방법에 대해 설명하고 있습니다. 효소 활성은 반응 속도, 특정 활성, 수율 등으로...2025.01.23
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