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[유전학] DNA sequencing, vector의 제작, NGS2025.05.031. DNA sequencing DNA는 단백질을 암호화 하고있는 물질로 A,T,G,C라는 기본 단위로 이루어진다. 어떤 서열을 갖고 있는 지에 따라 결과적으로 생산되는 단백질이 달라지게 되는데 이 서열을 확인하는 것은 분자생물학에 있어서 큰 의미가 있다. DNA sequencing은 그 DNA 서열을 확인하는 방법이다. 과거에는 그 방법으로 sanger method를 사용했지만 현재는 더욱 빠르고 신속하게 원하는 DNA서열을 확인할 수 있는 방법인 NGS를 통해 염기서열을 확인한다. 2. Vector 제작 우리는 DNA 재조합 기...2025.05.03
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[A+ 리포트] Ligation & Transformation (분자생물학실험)2025.04.251. Ligation 실험에서는 Vector와 PCR 산물을 Ligation하는 과정을 수행하였습니다. Ligation 시 주의사항으로는 T4 Ligase를 ice에 보관하며 가장 마지막에 첨가하고, 강한 충격을 피하는 것 등이 있습니다. 2. Transformation Transformation 과정에서는 Competent cell(E.coli)에 Ligation 산물을 처리하고 Heat-shock을 주었습니다. Competent cell은 온도에 매우 민감하므로 실험 중 ice 상태를 유지하는 것이 중요합니다. 실험 결과 일부 ...2025.04.25
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서포트 벡터 머신(Support Vector Machine, SVM)2025.05.101. 서포트 벡터 머신(Support Vector Machine, SVM) 서포트 벡터 머신(Support Vector Machine, SVM)의 이름은 알고리즘의 기본 원리와 핵심 개념에 기반하여 지어졌습니다. 데이터 포인트들을 분류하기 위해 사용되는 초평면(hyperplane)의 위치는 이 서포트 벡터들에 의해 결정됩니다. 서포트 벡터는 결정 경계와 가장 가까운 데이터 포인트들을 의미합니다. 이러한 포인트들은 결정 경계 주변에서 서로 다른 클래스에 속하는 데이터들을 분리하는 역할을 수행합니다. SVM은 주어진 데이터를 기반으로 ...2025.05.10
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Purification of Plasmid DNA by Mini-prep2025.01.211. Plasmid DNA Plasmid DNA는 bacterial cell의 소기관으로서 transformation 등 다양한 곳에 사용된다. Plasmid DNA는 host cell 당 적게는 1~3개, 많게는 수십 개까지 복제되기도 한다. Plasmid DNA 또한 유전자를 지녔기에 transformation을 일으킬 수 있으며, vector로서 사용되기도 한다. 2. Plasmid DNA Purification Mini-prep은 bacteria로부터 plasmid DNA만을 정제하는 실험법이다. 수확한 bacteria에 다...2025.01.21
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A+ 생화학실험 <10주차. Cloning> 레포트2025.01.201. Molecular Cloning Molecular cloning은 분자 생물학에서 recombinant DNA를 생성하고 숙주 내에서 replication을 수행하는 실험적인 기법입니다. 이 기법의 주된 목적은 target 유전자(insert)를 plasmid DNA(vector)에 넣어 대량의 target 유전자 또는 해당 유전자로 인해 발현되는 단백질을 얻는 것입니다. 일반적으로, 서로 다른 유기체에서 얻은 DNA sequence를 사용하며, 하나의 유기체는 cloning되는 DNA의 source 역할을 하며, 다른 유기체...2025.01.20
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DNA ligation, Transformation, Mini-scale preparation of plasmid DNA2025.01.221. DNA ligation DNA ligation은 T4 DNA ligase 효소를 이용하여 DNA 말단을 phosphodiester 결합으로 연결하는 과정이다. 이 과정에서 vector와 insert의 ligation, vector의 self-ligation, insert의 self-ligation 등 세 가지 형태가 나타날 수 있다. 본 실험에서는 HindⅢ와 NdeⅠ로 double-digestion한 vector와 insert를 T4 DNA ligase로 ligation하였다. 2. Transformation ligation...2025.01.22
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서강대학교 23년도 마이크로프로세서응용실험 7주차 Lab07 결과레포트 (A+자료)2025.01.121. 인터럽트의 동작원리 인터럽트는 마이크로프로세서에서 외부에서 스위치가 눌리거나 통신에서 신호가 수신되는 등 예기치 못한 상황, 사건을 의미한다. 인터럽트가 발생하면 프로세서는 명령어 수행을 마친 후, 해당 인터럽트의 처리를 하는 서브루틴인 interrupt service routine(ISR)을 수행하게 된다. 인터럽트 처리 과정에서 stack이 어떻게 사용되는지, vector table의 구성과 역할, 인터럽트 처리에 사용되는 레지스터들의 종류 및 역할 등을 이해한다. 2. 인터럽트 pending 동작 외부 인터럽트가 발생하면...2025.01.12
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[A+] 서강대학교 일반생물학실험1 실험 11. Plasmid DNA의 제한효소 절단 및 전기영동 풀레포트2025.01.021. DNA 운반체 (Vector) DNA 운반체인 vector는 종류가 다양하며, DNA의 유지와 복제가 가능한 DNA분자이다. 그 중 plasmid는 가장 널리 쓰이는 vector이며, circular구조의 이중가닥 형태를 갖는다. plasmid는 bacteria 또는 몇몇 eukaryotic cell에 존재하는 DNA molecules로 extrachromosomal circular, double stranded의 특징을 갖는다. Chromosomal DNA와는 독립적으로 자가복제가 가능하며 일반적인 bacteria genom...2025.01.02
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[서강대학교 현대생물학실험2] (2차 풀레포트) TA cloning & transformation, mini-prep, Enzyme cut, electrophoresis2025.01.221. TA cloning TA cloning을 통해 insert를 삽입한 vector는 transformation을 이용해 세포에 주입하여 lacZ selection으로 insert 삽입 여부를 확인할 수 있다. lacZ operon이 작동하면 β-1, 4-linkage를 분해 시킬 수 있는 β-galactosidase가 생성된다. X-gal(5-bromo-4-chloro-3-indolyl-D-galactopyranoside)은 β-1, 4 linkage를 가지고 있으며 이 linkage가 분해되면 파란색을 띠게 된다. 2. Tra...2025.01.22
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식물분자생물학실험 Agrobacterium Transformation 결과보고서2025.01.181. Agrobacterium competent cell (GV3101) GV3101은 Agrobacterium tumefaciens Chemically Competent Cell의 일종으로, 애기장대, 담배, 옥수수, 감자 등의 식물을 형질 전환하는데 사용될 수 있다. 여기에는 screening을 위한 rifampicin resistant gene (rif)이 미리 포함되어 있으며, gentamicin resistance gene 과 vir gene을 포함한 Ti plasmid를 운반할 수 있다. 2. Freeze-Thaw met...2025.01.18
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