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Genotyping2025.01.211. Genotyping Genotyping(유전형 분석)은 생물학적 분석을 이용한 DNA 염기 서열 조사를 통해 genotype의 차이점을 결정하는 것이다. 특정 단백질을 이루는 유전자가 궁금할 경우 genotyping을 이용하여 genotype을 유추할 수 있으며, 특정 질병에 영향을 미치는 유전자의 유무를 밝혀내는 등 다양한 생물학적 연구에 활용된다. 2. SIRT1 SIRT1은 NAD-dependent deacylase로서 세포의 대사와 밀접한 관련이 있는 단백질이다. 이는 노화 과정을 조절하는 역할을 하며, 식단 및 환경적...2025.01.21
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식물분자생물학실험 Genotyping 결과보고서2025.01.181. Genotyping 이 보고서는 식물 샘플에서 추출한 Genomic DNA를 PCR로 증폭하고 gel electrophoresis를 통해 DNA 삽입 여부를 확인하는 실험 결과를 다루고 있습니다. 실험 결과, T-DNA-specific primer를 사용한 샘플에서 600~700bp 사이의 밴드가 검출되었으며, 이는 해당 식물에 T-DNA가 Homozygote 상태로 삽입되었음을 의미합니다. 이러한 실험 기법은 형질전환 식물에서 유전적 특성의 안정적인 유지를 증명하고 연구 및 상업적 활용에 있어 예측 가능성을 제공하는 데 중요...2025.01.18
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마우스 genotyping 실습레포트2025.01.221. 전기영동 전기영동법은 크기와 전하에 다른 핵산 및 단백질의 절편의 분리, 식별 및 정제를 위한 실험 방법이다. 핵산은 (-)전하를 가지고 있어서 DNA 샘플을 아가로스 겔에 로딩하고 buffer 안에서 전기를 흘려보내면 DNA는 (+)극으로 이동하게 된다. 아가로스 겔의 그물 구조에 의해 큰 사이즈의 DNA는 천천히 이동하고 작은 DNA는 더 빠르게 이동한다. 2. PCR PCR은 DNA 또는 RNA의 특정 영역을 대량으로 복제, 증폭시키는 기술이다. PCR에 필요한 구성요소는 template DNA, forward prime...2025.01.22
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Simple tandem repeat를 이용한 인간유전형 분석2025.01.231. 유전자 분석 이 실험은 simple tandem repeat(STR)를 이용하여 인간 유전자의 allelic variation을 분석하는 것을 목적으로 합니다. PCR과 PAGE 분석을 통해 개인과 집단 내에서 alleles의 발현 양상을 확인하고, 유전학적 개념들을 이해하고자 합니다. 2. 유전자 다형성 인간 유전체에는 반복되는 simple sequence가 존재하며, 이 부분의 반복 횟수가 개인마다 다르기 때문에 allelic variation을 쉽게 관찰할 수 있습니다. PCR과 PAGE 분석을 통해 이러한 유전자 다형성...2025.01.23
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유전과 환경이 인간 발달에 미치는 영향2025.04.251. 반응범위(Reaction-Range) 모델 유전적으로 결정된 특성을 바탕으로 각 개인은 환경과 상호작용한다는 모델입니다. 극단적 환경에서 풍요로운 환경으로 변하면 개인의 지능 점수가 향상되고, 각 개인은 독특한 유전적 특성을 지니고 있어 환경에 다르게 반응합니다. 2. 유전-환경 상관(Genotype-environment Correlation) 모델 유전적으로 유사한 사람은 환경을 선택할 때에도 유사한 환경을 선택하는 경향을 보이고, 이를 통해 개인이 자신의 유전자를 바탕으로 자신의 환경을 생성한다는 모델입니다. 이 모델은 유...2025.04.25
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[일반생물학실험]초파리 침샘염색체 관찰하기2025.04.251. Polytene chromosomes 다사염색체는 DNA가 복제를 반복하여 염색체가 중복된 후 분리되지 않고 다발이 된 특수한 대형 간기염색체이다. 전형적인 다사염색체는 파리목 곤충 유생의 침샘, 식도, 소장의 표피, 말피기관, 신경세포 등에서 볼 수 있으며, 크기는 감수분열기나 체세포분열중기의 염색체의 200배 정도이다. 2. 초파리의 모델 생물로서의 특성 초파리는 몸집이 작고 다양한 환경에 쉽게 적응하며, 침샘의 다사염색체를 관찰할 수 있어 유전자 연구에 유용하다. 또한 짧은 세대주기와 많은 번식, 다양한 돌연변이체 등의 ...2025.04.25
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식물분자생물학실험 Plant genomic DNA extraction 결과보고서2025.01.181. DNA purification DNA extraction이라고도 불리는 DNA purification은 DNA를 각종 시료에서 얻어낸 sample로부터 추출하고, 물리적, 화학적 방법을 이용하여 DNA만 정제하는 방법을 말한다. 이를 위해 cell을 녹이고, 불필요한 다른 물질을 제거하는 과정이 필요하다. 대표적인 DNA purification 방법으로 organic extraction (phenolchloroform method), nonorganic method (salting out and proteinase K trea...2025.01.18
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PCR을 통한 gene structure 분석2025.05.011. EtOH Precipitation DNA는 전하를 띄는 인산골격을 가지고 있어서 극성이다. 물도 극성이므로 물에 잘 녹는다. DNA를 뭉치게 하려면 물과 DNA간 결합을 약화시켜야 한다. Ethanol은 물보다 훨씬 덜 극성이다. 따라서 ethanol을 첨가하면 DNA의 인산기와 다른 양이온간의 결합이 강해지면서 DNA 침전을 형성한다. 이 과정을 위해선 적절한 양의 양이온이 필요하다. 너무 많으면 DNA와 같이 침전되고 너무 적으면 침전되지 못한 DNA가 생긴다. 이 실험에선 3M sodium acetate를 final 0....2025.05.01
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Bacterial Transformation 레포트2025.01.211. Transformation Transformation은 특정 DNA 조각을 생명체의 유전체 내로 삽입하여 새로운 genotype이 발현되도록 하는 방법이다. 박테리아에 plasmid를 통해 gene을 도입하는 기술로 알려져 있지만, 동물이나 식물에서도 transformation 기술이 개발되어 유전자 변형 생물(GMO)을 만드는 기술로 이용되고 있다. Bacterial plasmid는 restriction enzyme이 작용하는 multicloning site와 Selectable Marker로 사용하기 위한 antibioti...2025.01.21
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A+ 생화학실험 <5주차. Transformation> 레포트2025.01.201. Competent cell (DH5α) DH5α는 recA1 유전자의 160번 아미노산이 glycine에서 aspartic acid로 변이되는 돌연변이로 인하여 endonuclease의 기능을 상실하고 재조합 효소의 활성을 억제되었다. 이에 삽입된 plasmid DNA가 세포 내에서 안정적으로 유지되고 분해되지 않도록 하여, 높은 transformation efficiency(1×10^8 cfu/μg)를 가진다. 2. Plasmid DNA Plasmid DNA는 박테리아의 chromosomal DNA와 물리적으로 분리되어 있으...2025.01.20