"BLOSUM"의 검색결과 입니다.

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실험실습 아주대 생물정보 생물정보학 생물정보학 실습 ncbi

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"BLOSUM" 검색결과 1-20 / 30건

BLAST를 이용한 바이러스의 동정 및 BLOSUM 분석을 활용한 아미노산 서열 관찰

-실험목적: 이번 실험의 목적은 5개의 DNA 및 단백질 서열은 어떤 코로나 바이러스인지 BLAST를 이용해 동정하는 것이다. 또한 BLOSUM 분석을 활용하여 5개의 바이러스 ... 의미는 바이러스간의 유사성이 높다는 것이다. 즉 5번쨰의 바이러스는 SARS-CoV보다 SARS-CoV-2와 더 유사하다는 것을 알 수 있다.BLOSUM 분석을 활용 ... -related 중 98.3% 유사성을 가진 Pangolin(천산갑)-CoV이다. 이 결과는 기본 옵션인 BLOSUM62를 이용하였다. BLOSUM90으로 바꾸면 Bat-RaTG12

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| 리포트 | 3페이지 | 1,000원 | 등록일 2020.09.17

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[일반생물학실험]생명정보학 실습

는 서열이다.② Seed 서열 : Query Sequence에서 일정 부분을 추출하여 각각 자른 word에 점수를 부여하여 분석에 이용 한다.라. BLOSUM생물 정보학 ... (%)BLOSUM 90서로 정말 비슷한 서열의 유사성을 비교할 때 사용한다. 서열의 길이가 짧지만 그 내에서도 다른 점을 찾고 싶을 때 이용한다.70~90BLOSUM 80BLOSUM 90 ... 을 이용한 서열보다는 긴 서열이고 그 내에서 유사성을 찾고 싶을 때 사용한다.50~60BLOSUM 62가장 통상적으로 사용하며 서열 유사성이 타당한지의 유무를 판단할 때 사용한다.30

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| 리포트 | 6페이지 | 2,500원 | 등록일 2022.06.17

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아주대학교 생물학실험1 7주차 생물정보학 실습 보고서 만점입니다

.BLAST 프로그램의 유형3) BLOSUM (EMBOSS NEEDLE)BLOSUM (Blocks Substitution Matrix)단백질 서열의 서열 유사성 판단할 때 유용 ... 하게 쓰임.한 아미노산이 다른 아미노산으로 바뀔 가능성(두 아미노산의 유사성)을 나타.냄BLOSUM은 점수행렬을 사용. 양의 수는 두 아미노산이 서로 잘 바뀔 수 있는 경우를 의미 ... 하며, 음의 수는 그 반대, 즉 두 아미노산이 서로 잘 바뀌지 않는 경우를 의미함.점수가 높으면 높을수록 homology(항등성)가 더 있다고 판단함.BLOSUM 점수 행렬의 종류

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| 리포트 | 11페이지 | 2,000원 | 등록일 2022.01.29

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생명과학실험 A+) 생물정보학 실습 결과 레포트

의 핵산 일치하는 단어가 있는지 데이터베이스 내에서 검색한다. 양방향으로 matching hit를 확장한 후, 정렬을 생성하고 통계량을 생산한다.4. BLOSUM-서열 정렬에 가장 많이 ... ) NCYFPLNSYGFQYTTG (단백질서열)BLOSUM62, Word size:6 설정-ㄱ2019년 신종 코로나바이러스2. BLOSUM 실습1) Bat-RaTG12아미노산 서열 ... : YLYRLFRKANLKPFERDISTEIYQAGSTPCNGQTGLNCYYPLYRYGFYPTDGVGHQPYBLOSUM62: similarity 53/59, 89.8%BLOSUM90: similarity 53

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| 리포트 | 13페이지 | 1,000원 | 등록일 2022.06.29

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[생물학실험1] 생물정보학

- Blastn : 핵산(DNA) 서열을 DNA 데이터베이스로부터 찾고자 할 때 사용한다.Blastp : 단백질 서열을 단백질 데이터베이스로부터 찾고자 할 때 사용한다.4) BLOSUM ... [4]- Blocks Substitution Matrix 의 약자- 아미노산 서열을 정렬할 때, BLOSUM이 사용된다.- 단백질 서열들 간 서열 유사도를 비교, 분석할 수 있다. ... 을 입력한 후, “BLAST” 버튼을 클릭한다.2) BLOSUM 사용 방법- 첫 번째 빈칸에 첫 번째 아미노산의 서열을 입력하고 두 번째 빈칸에 두 번째 아미노산 서열을 입력한 후

리포트 | 17페이지 | 2,000원 | 등록일 2024.07.31

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아주대 생명과학실험 생물정보학 실습

었다. BLAST 검색은 BLOSUM62와 같은 채점 매트릭스를 사용한다. BLAST는 시퀀스의 중요한 패턴만을 검색하므로, FASTA보다 시간 효율적이면서도 상대적으로 민감 ... 의 정렬되지 않는다. 이러한 매트릭스는 단백질의 구조와 기능에 대한 변화를 연구하는 데 중요한 도구로, 세포의 중요한 기능에 영향을 미치는 돌연변이를 파악하는 데 사용된다.BLOSUM ... 은 BLOSUM 행렬은 밀접하게 관련된 시퀀스를 비교하기 위해 설계된 반면, 숫자가 낮은 BLOSUM 행렬은 더 먼 관련 시퀀스를 비교하기 위해 설계되었다. 예를 들어, BLOSUM80

리포트 | 14페이지 | 1,500원 | 등록일 2024.04.15

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생물학실험1_생물 정보학

검서 아미노산들의 치환의 정도를 표로 정리한 것이다. BLOSUM을 만드는 데 쓰이는 서열 정렬은 사용된 서열들의 퍼센트 동일성에 따라, 단어의 끝에 숫자를 붙인다. 예를 들 ... 면, BLOSUM60은 60%의 서열 동일성을 가진 다중 서열 정렬에서 아미노산들의 치환을 계산해 내서 만들었다. 그러면, BLOSUM80과 BLOSUM45는 어떤 차이가 있을까? 서열 ... 의 퍼센트 동일성이 낮다는 것은 BLOSUM을 구하기 위해 정열을 한 단백질들이 서로 진화적으로 먼 것들을 모았다는 것을 말한다. 그러므로, BLOSUM45는 진화적 거리가 먼

리포트 | 14페이지 | 2,000원 | 등록일 2023.02.25

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단백질 서열 분석 보고서

을 이2,p2) BLOSUM을 통해 얻어진 점수를 바탕으로 EMBOSS Needle은 아미노산 서열 정렬결과를 나타낸다. 이 때 점수가 높을수록 두 서열간이 유사성이 높다는 것을 의미 ... 수SARS-CoV-related69.5%, 262.069.5%, 178.067.8%, 192.0위의 표는 EMBOSS Needle 알고리즘을 이용하여 BLOSUM Matrix 옵션 ... (천산갑)-CoV임을 알 수 있다. 이는 Human-SARS-CoV-2와 Pangolin(천산갑)-CoV의 DNA 및 단백질 서열을 입력했을 때 BLOSUM62를 기준으로 한다면

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| 리포트 | 8페이지 | 1,000원 | 등록일 2020.11.25

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[아주대] 생물학실험1 생명정보학 보고서 A0

과 단백질 서열을 검색하는 BLASTp가 있다. 또 다른 분석방법으로 BLOSUM(Blocks Substitution Matrix)이 있는데 BLOSUM은 블록처럼 틈이 없는 서열정렬 ... 에서 아미노산들의 치환 정도를 정리한 행렬표를 말한다. 따라서 서로 비교할 두 개의 단백질 서열을 각각 입력하면 유사성을 수치적으로 알 수 있다. 이때 BLOSUM을 만드는 데 ... 쓰이는 서열 정렬은 사용된 서열들의 퍼센트 동일성에 따라 단어 끝에 숫자를 붙인다. 예를 들어 BLOSUM60은 60%의 서열동일성을 가진 서열들 중에서 아미노산들의 치환을 계산해서

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| 리포트 | 9페이지 | 2,000원 | 등록일 2021.01.14

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아주대 생물학실험1 결과보고서 [7주차 생물 정보학] (점수 10/10, 에이쁠)

에서 일정 부분을 추출하여 각각 자른 word에 점수를 부여하여 분석에 이용3. BLOSUM(1) BLOSUM의 정의 : 생물정보학에 BLOSUM은 BLOcks Substitution ... Matrix의 약자이다. 이는 단백질의 서열 정렬에 사용되는 치환 매트릭스이다. BLOSUM 매트릭스는 진화적으로 발산하는 단백질 서열 간의 정렬을 점수화하는 데 사용하고 로컬 ... 할 수 있다.(2)BLOSUM Matrix의 종류와 용도Matrix용도Similarity(%)BLOSUM 90서로 정말 비슷한 서열의 유사성을 비교할 때 사용한다. 서열의 길이가 짧

리포트 | 25페이지 | 2,000원 | 등록일 2024.01.30

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아주대학교 생물학 실험 1. 4주차 생물정보학

서열 기반 생물계통수를 그려본다.3. 실험재료 & 방법실험재료 : BLAST, BLOSUM(Emboss Needle), Mutiple sequence alignment ... ( ClustalW)실험방법:1. BLAST를 이용해 서열의 가장 유사성이 높은 종을 알아본다.2. BLOSUM(Emboss Needle)를 이용해 서열 유사성을 비교해본다.3. Mutiple

리포트 | 6페이지 | 1,000원 | 등록일 2025.09.10

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아주대 생물학실험1 A+ 생물정보학 보고서

protein sequences3) BLOSUM① BLOSUM : 한 아미노산이 다른 아미노산으로 바뀔 가능성(두 아미노산의 유사성)을 나타낸다.양수 – 두 아미노산이 서로 잘 바뀔 수 있 ... .② BLOSUM 점수 행렬4. 실험방법- 준비물 : 컴퓨터1) BLAST 사용법① BLAST 사이트에 접속하기② DNA BLAST 선택하기③ 노란색 박스에 유전자 서열 입력하기④ 옵션 ... 에서 Somewhat similar sequences 선택하기⑤ BLAST 클릭하기⑥ 실패할 경우 옵션에서 WORD 바꿔서 다시 BLAST 클릭하기2) BLOSUM 사용법

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| 리포트 | 13페이지 | 2,000원 | 등록일 2021.12.28

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아주대 생물학실험 1 생물정보학실습

다. Percent Identity는 쿼리가 시퀀스와 얼마나 유사한지 설명한다.5) BLOSUM서열 정렬에 가장 많이 쓰이는 치환 행렬이다. 1992년 PNAS저널에 헤니코프 부부 ... 는 서열 정렬은 사용된 서열들의 퍼센트 동일성에 따라, 단어의 끝에 숫자를 붙인다.① BLOSUM 점수 행렬Matrix사용할 때Similarity(%)BLOSUM 90서로 정말 비슷 ... 한 서열의 유사성을 비교할 때 사용한다. 서열의 길이가 짧지만 그 내에서도 다른 점을 찾고 싶을 때 이용한다.70~90BLOSUM 80BLOSUM 90을 이용한 서열보다는 긴 서열

리포트 | 12페이지 | 1,500원 | 등록일 2024.03.18

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생물 정보학 리포트

인지 알아보는 실험과 단백질 서열의 서열 유사성을 비교하는 실험을 진행해 보도록 한다. 이 과정에서 BLAST와 BLOSUM을 이용하여 실습을 해보도록 한다. 실험 결과 1 ... 에서 betacoronavirus로 변경하였을 때, entrez record가 변경되었다. 2). BLOSUM 실습 과제 (1). 위 표의 첫 번째 서열은 현재 전 세계적으로 유행하고 있 ... 는 코로나바이러스의 아미노산 서열 일부를 가져온 것이다. BLOSUM 분석을 활용하여 Human-SARS-CoV-2와 가장 유사한 아미노산 서열을 가진 바이러스는 무엇인지 보고서 결과

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| 리포트 | 10페이지 | 1,000원 | 등록일 2022.07.08 | 수정일 2025.01.28

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아주대학교 A+ 생명과학실험 생물정보학실습

을 BLAST의 데이터베이스와 비교하여 동정할 수 있다. BLOSUM은 서열을 정렬할 때 쓰이는 치환 행렬로 두 아미노산 간의 유사성을 나타내는 매트릭스이다. BLOSUM을 이용 ... &lvl=3&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock" \o "species" Pan troglodytes( 침팬지)2. BLOSUM 실습 과제 ②1) 사람Length ... 을수록 유연관계 또한 먼 것으로 판단할 수 있기 때문에 결과3에서 얻은 계통수로 동물들의 유연관계를 예측할 수 있다.[6] 참고문헌위키피디아, BLOSUM, https://ko

리포트 | 5페이지 | 1,000원 | 등록일 2024.04.04

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생물정보학 실험 보고서(아주대학교 생명과학실험 A+ 보고서)

성을 통계적으로 일정 기준보다 만족하는 서열들을 결정하고, 결정된 서열을 display에 보여주는 Report단계로 종료된다. 해당 과정에서 BLOSUM 매트릭스는 아미노산 서열 ... 할 때 사용하는 BLOSUM 90, BLOSUM 90에 사용하는 것보단 조금 더 길지만 유사성이 비슷할 때 사용하는 BLOSUM 80, 서열 유사성에 대한 타당성을 판단 ... 하는 BLOSUM 62, 엄청 먼 유형 관계에 대한 유사성 관계를 제시할 때 사용하는 BLOSUM 30이 존재한다.4. 실험 방법4.1 아미노산 서열 정렬 실습EMBOSS Neele의 방법

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| 리포트 | 14페이지 | 2,000원 | 등록일 2021.01.05 | 수정일 2023.10.23

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아주대학교 생물학실험1 세포정보학 실험 결과보고서

1. 실험 목적 - BLAST의 원리를 이해하고 사용방법을 익힌다. 이를 활용하여 주어진 아미노산 서열 정보를 기존 데이터베이스와 비교하고 동정해본다.- BLOSUM 점수행렬 ... 다. 이 값은 sequence 데이터베이스 크기에 따라 다르며 시퀀스 길이에 비례한다. 3) BLOSUM(Blocks Substitution Matrix): 아미노산 서열을 정리 ... 하는 알고리즘. 한 아미노산이 다른 아미노산으로 바뀔 가능성(두 아미노산의 유사성)을 나타낸다. BLOSUM 점수행렬에서 양의 수는 두 아미노산이 서로 잘 바뀔 수 있는 경우(유사도가 높

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| 리포트 | 7페이지 | 2,500원 | 등록일 2020.12.17 | 수정일 2020.12.19

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생물정보학 결과보고서

타입으로 나뉜다2) BLOSUM : Blocks Substitution Matrix Matrix의 약자로 단백질의 서열 정렬에 사용되는 치환 행렬이다한 아미노산이 다른 아미노산 ... 으로 바뀔 가능성 즉 두 아미노산의 유사성을 나타내며 아미노산 사이 생물학적 화학적 관계를 반영해 점수를 매긴다 BLOSUM 점수행렬에서 양의 수는 두 아미노산이 서로 잘 바뀔 수

리포트 | 14페이지 | 1,000원 | 등록일 2023.11.13

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[아주대 생명과학실험] 생물정보학 실험 보고서

째 아미노산 서열을 각각 입력한 뒤 Submit을 눌러 유전자의 단백질 정보를 확인한다. (More options… 배너를 클릭해 BLOSUM matrix 와 같은 옵션을 재설정할 수 ... .2 BLOSUM 실습 과제5.2.1 사람-오리너구리 비교 결과5.2.2 바늘두더지-오리너구리 비교 결과5.2.3 개-오리너구리 비교 결과5.2.3 주머니쥐-오리너구리 비교 결과5 ... 이 존재하는 것이다.(2) BLOSUM 실습BLOSUM 90 matrix를 이용하여 주어진 오리너구리의 PTPN4 유전자 일부와 가장 유사한 아미노산 서열을 가진 종은 무엇인지 보고서

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| 리포트 | 21페이지 | 1,500원 | 등록일 2022.08.30 | 수정일 2022.09.01

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생물정보학 정리

, biological 분석 프로그램 제공4.BLOSUM과 PAM 숫자가 가지는 의미*PAM(Percent Accepted Mutation): 100개를 기준으로 mutation 생긴 것-PAM 1 ... 고 있다.*BLOSUM(Blocks Amino Acid Substitution Matrices)-BLOSUM 60 : 사용한 sequence의 similary 60이상 ... -Consensuce formed: 60% identical=BLOSUM 60 , 80% identical=BLOSUM 80*점수 높음= 적용하는 룰이 엄격하다, mutation 일어나지 않

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| 리포트 | 3페이지 | 1,500원 | 등록일 2020.12.10

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