SDS-PAGE 의 이해

소개

분자생물학 실험 및 다양한 실험에서 사용되고 있는 SDS-PAGE 실험기법에 대해
필자가 이해한 방식으로 새롭게 서술한 보고서입니다.
내용은 A4 한장에 꽉 차게 썼는데, SDS-PAGE에 대해 쉽게 이해하고 싶으신 분이나
기존의 천편일률적인 정보가 싫으신 분께 권합니다.

목차

SDS-PAGE 란?

본문내용

SDS-PAGE(Sodium dodecyl sulfate - Polyacrylamide gel electrophoresis)란 단백질을 크기에 따라 분리하는 방법이다. 보통 서로 다른 두 가지의 gel이 붙어있는 상태인 Disc(Discontinuous pH 혹은 disc) gel 전기영동으로 시행하게 된다. 두 가지의 gel로 시행하는 이유는 시료를 gel에 걸었을 때 서로 다른 크기인 단백질을 첫 번째 gel인 stacking gel의 성질을 이용해 두 번째 gel인 running gel의 똑같은 지점에서 출발할 수 있도록 압축하기 위해서이다. 그 후 두 번째 gel에서는 단백질의 성질 자체에 의해 분리가 된다.

그렇다면 두 가지 다른 gel의 성질을 알아보자. 먼저 well에 시료를 loading하고 전기를 걸어주면 시료 내 모든 ion들이 (+)극을 향해 움직이게 된다. 이 때 이동되는 ion들로는 Cl-, Glycine, 단백질 등이 주요하다. 시료를 넣으면 우선 단백질은 Sodium dodecyl sulfate에 둘러싸여 음전하를 띠게 된다. Cl-ion 역시 음전하를 띤다. 하지만 glycine의 경우에 net charge가 0이되는 pH, 즉 pI값이 약 6.2 정도이다. stacking gel은 pH 값이 6.5~ 6.8 정도이기 때문에 glycine은 stacking gel에서 부분적으로만 음전하를 띠거나 혹은 net charge를 0으로 갖는 zwitter ion으로 존재한다.

참고자료

· 없음