[자연과학]분자마커
- 최초 등록일
- 2007.05.12
- 최종 저작일
- 2006.05
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소개글
요즘 유전자를 cloning 하는게 많이 쓰이는 분자 마커(molecular marker 입니다. )
목차
marker의 이용의 전제 조건
-Polymerase Chain Reaction (PCR) PCR이란?
Molecular maker의 정의
Molecular maker의 특성
분자마커 개발과정
Molecular maker의 종류
SSR의 기본원리
TaqMan probe를 이용한 SNP genotyping
SNP분석의 DNA chip 이용
DNA 칩 기술의 응용
혼성화 결과 해석 방법
본문내용
자체적으로는 의미가 없지만 원하는 유전자를 찾기 위한 주변 가까이에 위치한 부위를 찾음으로 인해 Marker로 사용하고 유전자를 묶어 두기 위한 것이다.
DNA 염기배열에서의 차이는 곧바로 종내 개체 간 그리고 종간 유전변이의 근원이 된다.
연구하고자 하는 대상의 유전적 차이를 가장 확실히 알아보는 방법은 전체 DNA 염기서열의 비교 분석법이 되겠지만 저등한 대장균 4,200,000개, 곰팡이류 27,000,000개나 되기 때문에 이 모든 것을 조사 분석하여 개체간의 유전적 차이를 비교한다는 것은 많은 시간과 경비가 소요 된다 .그렇기 때문에 비용이 적게 들고 손쉬운 새로운 연구방법을 고안 하였는데 크게 나누면 3가지로 구분 가능 하다.
첫째 , 제한효소를 이용하는 방법(RFLP marker분석)
둘째 , PCR반응에 의한 특정부위의 증폭방법 (PCR-based marker분석)
셋째 , 실제 전사 부위 유전자의 일부를 이용하는 SNP marker분석
Molecular maker의 특성
연구 대상 지표종과 연구 성격에 적합한 유전자를 선별하여 다음의 특성을 갖는 분자마커를 개발한다 .
▷ 현장 샘플에 대해 안정되게 PCR 증폭이 될 수 있는 primer를 제작한다.
▷ PCR 산물은 분석에 용이한 500-1,000 bp 내외 정도의 길이를 갖는다.
▷ multiplex primer set은 비교가 용이할 수 있도록 뚜렷한 길이 변이성이 보여야 한다.
▷ 제한 효소는 가능한 star activity가 없고 반응성이 높아 1-2 시간 이내에 반응이 종결될 수 있는 효소를 선정한다 (예: Hind III 등)
▷ multiplex primer set은 최소 5종 최대 12종 내외의 종을 1회 반응으로 확인할 수 있도록 제작한다.
참고 자료
없음