proteomics

소개

주어진 환경에서 유전체(genome)에 의하여 발현되는 단백질들을 단백체(proteome)라 하며, 이를 연구하는 학문을 단백체학(proteomics)이라고 한다. 어원은

목차

Proteomics의 배경
Proteomics의 정의
Proteomics 와 Genomics

....
Proteomics의 한계와 전망

본문내용

❷ Proteomics의 정의
Proteomics (단백질체학) : 프로테옴을 연구하는 법과 technique을 포괄적으로 의미한다. 즉, protein의 성질을 발현, post-translational modification, 다른 단백질과의 결합에 초점을 두어 연구하여 세포 내 변형 과정과 네트워크 형성을 질병의 진행과정과 연계시켜 총괄적으로 이해할 수 있는 연구 분야이다. 다시 말해서 Proteomics는 생명체의 전체 유전자인 게놈에 의해 발현되는 모든 단백질의 총합인 프로테옴을 다루는 학문임과 동시에 유전체 구조와 세포내 행동 간에 갭을 메우는 역할을 하는 도구로써 이들을 대량으로 분석하고 상호기능관계 지도를 작성하며 구조분석을 통해 궁극적으로 특정 단백질과 이를 만드는 유전자의 기능을 동시에 밝혀내는 것을 목적으로 한다

❸ Proteomics 와 Genomics
Proteomics와 Genomics는 공히 유전자의 기능을 밝힌다는 점에서 목표는 같으나 방법이 매우 다르다. 기술적으로는 실험의 출발점도 proteomics가 단백질 차원에서, genomics는 유전자차원에서 각각 유전자의 기능을 연구를 하는 기술이므로 연구형태가 매우 다르다. 그러나 이 둘은 실제 유전자구조를 이용한다는 점에서 한 뿌리이며 상호 보완적인 연구 분야이다. 가령 genomics가 세포의 핵산 (DNA, RNA, 또는 이들의 유사체)을 대상으로 각 유전자발현의 정도차이를 분석하고, 유사유전자들의 수집 및 분류, 특정 생리조건에 반응하는 유전자들의 대량분석(DNA칩 및 올리고 칩), 특정 유전자의 발굴(mining)을 수행하는 연구 분야로서, 이미 알고 있는 유전자구조를 근간으로 연구하는 기술인데 비해, proteomics는 일단 유전자의 산물인 단백질을 대상으로 조직이나 세포, 체액과 같은 개체의 실시간 세포 생리현장에서 얻어진 시료를 대상으로, 이들을 대량으로 분석하고, 상호기능관계의 지도를 작성하며, 구조분석을 통하여 궁극적으로 특정 단백질과 이를 만드는 유전자의 기능을 동시에 밝혀내는 기술이다. 실제로, 특정 유전자의 발현과 단백질의 발현차이에는 밝혀진 유전자를 기준으로 30% 이상이 상관성이 거의 없는 것으로 알려져, 그만큼 genomics의 수단으로 단백질과 유전자의 발현(mRNA) 상관성을 분석하고 예측하기는 불가능하다.
이 두 분야에 속한 공통 분야가 있는 데, 구조 유전체학 (sturctural genomics) 또는 구조proteomics(structural proteomics)라고도 불리는 단백질 구조분석 연구이다. 이 분야는 proteomics에 의해 밝혀진 특정 단백질이나 이미 알려진 게놈 DB 상의 특정유전자 정보를 바탕으로 단백질의 1차 구조를 예측하고, 구조와 기능간의 관계를 유추하여 궁극적으로는 생리적 활성상태인 가상적인 3-D 구조를 추측해낸다
❹ Proteomics 의 분지
1.단백질 별거 - 모든 proteomic 기술은 복잡한 혼합물을 분리하는 능력에 의지한다.
2.단백질 식별 - 높은 처리량 proteomic 기술은 대량 spectrometry, 공동적으로 더 간단한 계기에 펜티드 대량 fingerprinting에 기초를 둔다,

참고자료

· 없음