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gene expression

"gene expression"에 대한 내용입니다.
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최초등록일 2024.07.19 최종저작일 2024.03
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gene expression
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    • 유사도 지수
      참고용 안전
    • 🧬 유전자 발현의 심층적인 메커니즘 이해 제공
    • 🔬 실험적 접근 방식을 통한 과학적 통찰력 제시
    • 🧫 유전학적 변이가 세포 분열에 미치는 영향 분석

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    목차

    1. Subject
    2. Object
    3. Introduction
    4. Materials & Method
    5. Result
    6. Discussion
    7. Reference

    본문내용

    1. Subject : gene expression

    2. Object : 특정 gene이 knock out된 yeast의 관찰을 통해 특정 gene이 수행하는 기능을 알 수 있다,

    3. Introduction
    Promoter
    Gene의 transcription이 시작되는 DNA의 지역으로, promoter가 RNA polymerase가 DNA에 결합하도록 하는 역할을 하기에 gene expression에 필수적이다. RNA polymerase에 의해 형성된 mRNA가 최종적으로 protein을 형성하기에 promoter region은 언제, 어디서 특정한 gene이 발현되는지를 조정한다. Promoter은 일반적으로 100-1,000 bp이다. DNA에서 promoter가 결합하며, 실제 protein을 coding하는 부분을 codding strand라고 하며, 반대쪽은 non-coding strand 또는 template strand라고 한다.
    몇몇 promoter은 자체적으로 특수한 성질을 가지기도 한다. CLB2 promoter는 G1기부터 M기가 되기 전까지 발현하며, 분열이 시작되면 발현하지 않는 성질을 가져, 이를 이용해 gene이 분열 전까지만 발현되게 할 수 있으며, CUP1 promoter는 copper가 있을 때에만 Acc1의 발현을 통해서 gene을 발현시키며, 이를 실험적으로 이용해서 gene을 발현시키고 싶을 때에만 copper ion을 투입하는 식으로 이용이 가능하다

    참고자료

    · Gametogenesis in Yeast Is Regulated by a Transcriptional Cascade Dependent on Ndt80, Shelley Chu 1, Ira Herskowitz
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    • 1. Promoter
      A promoter is a DNA sequence that serves as the binding site for RNA polymerase, the enzyme responsible for transcribing genetic information from DNA into RNA. Promoters are located upstream of the gene they regulate and play a crucial role in gene expression. They contain specific DNA sequences that allow RNA polymerase to recognize and bind to the DNA, initiating the transcription process. The strength and regulation of promoters can significantly impact the level of gene expression, making them an important consideration in various areas of molecular biology, biotechnology, and genetic engineering. Understanding the structure and function of promoters is essential for understanding gene regulation and developing strategies for controlling gene expression in both prokaryotic and eukaryotic organisms.
    • 2. ORF (Open Reading Frame)
      An Open Reading Frame (ORF) is a DNA sequence that has the potential to be translated into a protein. It is defined as a continuous stretch of DNA that starts with a start codon (usually ATG) and ends with a stop codon (TAA, TAG, or TGA). ORFs are important in the identification and annotation of genes within a genome, as they represent the coding regions that can be translated into functional proteins. The presence of an ORF does not necessarily mean that the sequence is actively transcribed and translated, as there may be additional regulatory mechanisms that control gene expression. However, the identification of ORFs is a crucial step in the bioinformatic analysis of genomic data and the prediction of potential protein-coding regions. Understanding ORFs is essential for understanding the genetic makeup and potential protein-coding capabilities of an organism.
    • 3. Tetracycline Operon
      The tetracycline operon is a genetic regulatory system found in bacteria that controls the expression of genes responsible for resistance to the antibiotic tetracycline. This operon consists of a promoter, a repressor gene (tetR), and one or more genes (tet) that confer tetracycline resistance. In the absence of tetracycline, the repressor protein binds to the promoter, preventing the expression of the resistance genes. When tetracycline is present, it binds to the repressor, causing it to dissociate from the promoter, allowing the expression of the resistance genes. This mechanism allows bacteria to adapt and survive in the presence of tetracycline, making it an important system for understanding bacterial antibiotic resistance and the development of new antimicrobial strategies. The tetracycline operon has also been widely used as a model system for studying gene regulation and the mechanisms of transcriptional control in bacteria.
    • 4. Cohesin
      Cohesin is a multi-subunit protein complex that plays a crucial role in chromosome organization and segregation during cell division. It is responsible for holding sister chromatids together after DNA replication, ensuring their proper separation during mitosis and meiosis. Cohesin forms a ring-like structure that encircles the DNA, providing a physical link between the replicated chromosomes. This cohesion between sister chromatids is essential for the accurate segregation of genetic material into daughter cells, preventing aneuploidy and maintaining genomic stability. Cohesin also contributes to the three-dimensional organization of the genome, influencing gene expression and chromatin structure. Mutations or defects in cohesin components have been linked to various human diseases, including cancer and developmental disorders, highlighting the importance of this complex in cellular processes and human health.
    • 5. ndt80Δ
      ndt80Δ is a genetic mutation in the yeast Saccharomyces cerevisiae, where the NDT80 gene has been deleted or inactivated. The NDT80 gene encodes a transcription factor that plays a crucial role in the regulation of meiosis, the process of cell division that produces haploid gametes (such as sperm and eggs) from diploid cells. In the ndt80Δ mutant, the absence of the NDT80 transcription factor disrupts the normal progression of meiosis, leading to a block in the transition from prophase I to metaphase I. This results in the inability of the cell to complete meiosis and produce viable gametes. The ndt80Δ mutation has been widely used as a tool to study the molecular mechanisms underlying meiosis and the regulation of gene expression during this critical cellular process. Understanding the role of NDT80 and the consequences of its deletion can provide insights into the fundamental biology of sexual reproduction in eukaryotic organisms.
  • 자료후기

      Ai 리뷰
      이 문서는 유전자 발현 조절의 핵심 메커니즘인 프로모터, ORF, 테트라사이클린 오페론 등을 상세히 설명하고, 유전자 knock out 실험을 통해 관찰된 결과를 바탕으로 해당 유전자의 기능을 유추하는 내용을 담고 있습니다. 또한 유전자 변이로 인한 유전 질환의 발생 원인도 논의하고 있어 전반적으로 유전자 발현과 그 영향에 대해 잘 정리된 문서입니다.
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