아주대 생물학실험 1 생물정보학실습

소개

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목차

1. 실험 목적
2. 실험 원리(이론)
3. 실험재료 & 방법
4. 실험결과
5. 고찰
6. 참고문헌

본문내용

1. 실험 목적
생물정보학 학문을 이해하고 생물정보학 Tool을 사용하는 방법을 익힌다. 생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 미지의 유전자를 데이터베이스에 대조하고 어떤 서열인지 탐구한다. 생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 단백질 서열의 서열 유사성을 비교해본다. 생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 DNA 및 단백질 서열 기반 생물 계통수를 그려보려고 한다.

2. 실험 원리(이론)
1) 생물정보학 (Bioinformatics)
생물정보학은 생물학적 데이터를 저장, 검색, 구성하고 분석하는 데 생물공학 IT를 사용하는 분야를 일컫는다. 유전체 서열 프로젝트나 여타 연구에서 엄청난 양의 데이터가 생성되었는데, 이 데이터 웨이브의 결과 생물학 분야의 난제는 대부분 컴퓨팅 쪽 문제로 바뀌게 되었다. 생물정보학이라는 용어는 1970년 Paulien Hogeweg와 Ben Hesper가 처음 사용한 말이다. 당시에는 지금과 의미가 달랐는데, 그때는 사용처가 "생물 시스템 내에서의 정보 프로세스 연구"와 관련이 있었기 때문이다. 이 말은 사상 최초의 생물학적 서열 데이터가 공유되기 시작하면서 만들어졌다. 현재는 좀 더 넓은 의미로 사용되어 컴퓨터 구조 생물학, 화학 생물학과 시스템 생물학 등을 포괄한다.(데이터 통합과 시스템 모델링도 포함). 고도의 학제간 연구인 이 분야에는 응용 수학, 인포매틱스, 통계, 컴퓨터 과학, 인공지능, 화학과 생화학 등 여러 분기의 지식이 관련된다. 생물정보학은 현대 생물학과 의학에서 데이터 관리에 필수적이다. 흥미로운 이 과학 분야에는 무수히 많은 응용 분야와 연구 분야가 있어 다양하게 적용할 수 있으며, 대표적인 예시들은 서열 분석, 단백질 구조 예측, 유전체 주석, 비교유전체학, 의료 및 신약 개발, 폐기물 처리, 생물공학 등이다.

참고자료

· 위키백과, 미국 국립생물공학정보센터 https://ko.wikipedia.org/wiki/미국_국립생물공학센터
· 위키백과, EBI https://ko.wikipedia.org/wiki/EBI
· 환경부 , 국립생물자원관 한반도의 생물자원 https://species.nibr.go.kr/gi/blast/blast.do
· wikipedia, BLOSUM https://en.wikipedia.org/wiki/BLOSUM
· 위키백과, BLOSUM https://ko.wikipedia.org/wiki/BLOSUM
· wikipedia, Multiple sequence alignment
· https://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_sequence_alignment
· MOO-Sang Kim, NCBI의 소개 (II) BLAST file:///C:/Users/lucyh/Downloads/NCBI-BLAST.pdf (2023.07.06.)
· 고주온,2015 Bric 연재지 초심자를 위한 생물학+정보학 _12_- NCBI BLAST+의 내부
· Scinece Direct, https://www.sciencedirect.com/topics/medicine-and-dentistry/multiple-sequence-alignment (2023.07.06.)
· 위키백과, 진화, https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%A7%84%ED%99%94