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아주대 생물학실험 1 생물정보학실습

"아주대 생물학실험 1 생물정보학실습"에 대한 내용입니다.
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한컴오피스
최초등록일 2024.03.18 최종저작일 2023.07
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아주대 생물학실험 1 생물정보학실습
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    • 🧬 생물정보학의 핵심 도구인 BLAST와 BLOSUM 사용법을 상세히 학습할 수 있음
    • 🔬 유전자 서열 분석 및 비교 방법론을 실제 실험을 통해 직접 익힐 수 있음
    • 🌍 다양한 생물종 간 유전적 유사성과 진화적 관계를 탐구하는 방법을 배울 수 있음
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    소개

    "아주대 생물학실험 1 생물정보학실습"에 대한 내용입니다.

    목차

    1. 실험 목적
    2. 실험 원리(이론)
    3. 실험재료 & 방법
    4. 실험결과
    5. 고찰
    6. 참고문헌

    본문내용

    1. 실험 목적
    생물정보학 학문을 이해하고 생물정보학 Tool을 사용하는 방법을 익힌다. 생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 미지의 유전자를 데이터베이스에 대조하고 어떤 서열인지 탐구한다. 생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 단백질 서열의 서열 유사성을 비교해본다. 생물정보학 기반의 Tool을 이용하여 DNA 및 단백질 서열 기반 생물 계통수를 그려보려고 한다.

    2. 실험 원리(이론)
    1) 생물정보학 (Bioinformatics)
    생물정보학은 생물학적 데이터를 저장, 검색, 구성하고 분석하는 데 생물공학 IT를 사용하는 분야를 일컫는다. 유전체 서열 프로젝트나 여타 연구에서 엄청난 양의 데이터가 생성되었는데, 이 데이터 웨이브의 결과 생물학 분야의 난제는 대부분 컴퓨팅 쪽 문제로 바뀌게 되었다. 생물정보학이라는 용어는 1970년 Paulien Hogeweg와 Ben Hesper가 처음 사용한 말이다. 당시에는 지금과 의미가 달랐는데, 그때는 사용처가 "생물 시스템 내에서의 정보 프로세스 연구"와 관련이 있었기 때문이다. 이 말은 사상 최초의 생물학적 서열 데이터가 공유되기 시작하면서 만들어졌다. 현재는 좀 더 넓은 의미로 사용되어 컴퓨터 구조 생물학, 화학 생물학과 시스템 생물학 등을 포괄한다.(데이터 통합과 시스템 모델링도 포함). 고도의 학제간 연구인 이 분야에는 응용 수학, 인포매틱스, 통계, 컴퓨터 과학, 인공지능, 화학과 생화학 등 여러 분기의 지식이 관련된다. 생물정보학은 현대 생물학과 의학에서 데이터 관리에 필수적이다. 흥미로운 이 과학 분야에는 무수히 많은 응용 분야와 연구 분야가 있어 다양하게 적용할 수 있으며, 대표적인 예시들은 서열 분석, 단백질 구조 예측, 유전체 주석, 비교유전체학, 의료 및 신약 개발, 폐기물 처리, 생물공학 등이다.

    참고자료

    · 위키백과, 미국 국립생물공학정보센터 https://ko.wikipedia.org/wiki/미국_국립생물공학센터
    · 위키백과, EBI https://ko.wikipedia.org/wiki/EBI
    · 환경부 , 국립생물자원관 한반도의 생물자원 https://species.nibr.go.kr/gi/blast/blast.do
    · wikipedia, BLOSUM https://en.wikipedia.org/wiki/BLOSUM
    · 위키백과, BLOSUM https://ko.wikipedia.org/wiki/BLOSUM
    · wikipedia, Multiple sequence alignment
    · https://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_sequence_alignment
    · MOO-Sang Kim, NCBI의 소개 (II) BLAST file:///C:/Users/lucyh/Downloads/NCBI-BLAST.pdf (2023.07.06.)
    · 고주온,2015 Bric 연재지 초심자를 위한 생물학+정보학 _12_- NCBI BLAST+의 내부
    · Scinece Direct, https://www.sciencedirect.com/topics/medicine-and-dentistry/multiple-sequence-alignment (2023.07.06.)
    · 위키백과, 진화, https://ko.wikipedia.org/wiki/%EC%A7%84%ED%99%94
  • AI와 토픽 톺아보기

    • 1. 생물정보학
      생물정보학은 생물학, 컴퓨터 과학, 수학 등 다양한 학문 분야가 융합된 학문 분야입니다. 생물정보학은 방대한 생물학 데이터를 효과적으로 수집, 저장, 분석하고 해석하는 데 중요한 역할을 합니다. 이를 통해 유전체 연구, 단백질 구조 예측, 진화 연구, 질병 진단 및 치료 등 다양한 분야에서 중요한 발견과 혁신을 이루어 왔습니다. 생물정보학은 앞으로도 생물학 연구의 핵심 분야로 자리잡을 것으로 기대됩니다.
    • 2. NCBI
      NCBI(National Center for Biotechnology Information)는 생물정보학 분야에서 매우 중요한 기관입니다. NCBI는 유전체, 단백질, 문헌 등 방대한 생물학 데이터베이스를 구축하고 관리하며, 이를 전 세계 연구자들에게 무료로 제공하고 있습니다. NCBI의 데이터베이스와 도구들은 유전체 분석, 단백질 구조 예측, 진화 연구, 질병 진단 및 치료 등 다양한 생물학 연구에 필수적으로 활용되고 있습니다. 또한 NCBI는 생물정보학 분야의 연구와 교육을 지원하는 등 생물정보학 발전에 크게 기여하고 있습니다.
    • 3. BLAST
      BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)는 생물정보학에서 가장 널리 사용되는 서열 비교 도구 중 하나입니다. BLAST는 주어진 DNA 또는 단백질 서열과 유사한 서열을 데이터베이스에서 빠르게 찾아내어 비교할 수 있게 해줍니다. 이를 통해 유전자 기능 예측, 진화 관계 분석, 유전체 어노테이션 등 다양한 생물학 연구에 활용될 수 있습니다. BLAST는 사용이 간편하고 결과 해석이 직관적이어서 생물학자들이 가장 많이 사용하는 도구 중 하나입니다. 앞으로도 BLAST는 생물정보학 분야에서 핵심적인 역할을 할 것으로 기대됩니다.
    • 4. BLOSUM
      BLOSUM(Blocks Substitution Matrix)은 아미노산 서열 간 유사성을 정량화하기 위해 개발된 행렬입니다. BLOSUM 행렬은 단백질 서열 정렬 및 비교에 널리 사용되며, 특히 BLAST와 같은 서열 비교 도구에서 중요한 역할을 합니다. BLOSUM 행렬은 아미노산 치환 빈도를 기반으로 하여 아미노산 간 유사성을 수치화하므로, 단백질 구조 예측, 진화 관계 분석, 기능 유추 등 다양한 생물정보학 연구에 활용될 수 있습니다. BLOSUM 행렬은 생물정보학 분야에서 필수적인 도구로 자리잡았으며, 앞으로도 지속적으로 발전할 것으로 기대됩니다.
    • 5. Multiple Sequence Alignment
      Multiple Sequence Alignment(MSA)는 생물정보학에서 매우 중요한 기술 중 하나입니다. MSA는 여러 개의 DNA, RNA 또는 단백질 서열을 동시에 정렬하여 서열 간 유사성과 차이점을 분석할 수 있게 해줍니다. MSA를 통해 유전자 기능 예측, 진화 관계 추정, 단백질 구조 예측 등 다양한 생물학 연구를 수행할 수 있습니다. 최근에는 기계학습 기반의 MSA 알고리즘이 개발되면서 MSA의 정확도와 효율성이 크게 향상되고 있습니다. 앞으로 MSA는 생물정보학 분야에서 더욱 중요한 역할을 할 것으로 기대됩니다.
  • 자료후기

      Ai 리뷰
      생물정보학 Tool을 활용하여 다양한 생물 종의 유전적 유사성을 비교 분석하고, 진화 관계를 추론하는 실험을 수행하였다.
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