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NCBI의 유전자 서열 분석 및 단백질 삼차원 구조 모델링2025.01.231. NCBI 데이터베이스 NCBI에서 제공하는 다양한 데이터베이스(Genome, BioProject, BioSystems 등)에 대해 설명하고, 이를 통해 유전자 정보와 서열을 분석할 수 있음을 설명하였다. 2. 유전자 돌연변이 유전자 돌연변이의 개념과 종류(염기 치환, 결실, 삽입, 중복, 역위, 반복 확장 등)에 대해 설명하였다. 3. SOD1 유전자 SOD1 유전자의 기능, 발현, 관련 질병 등에 대해 자세히 설명하였다. 4. 서열 정렬 BLAST와 MSA 기법을 사용하여 SOD1 단백질 서열을 다른 생물종과 비교 분석하고,...2025.01.23
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Real-time PCR을 이용한 유전자 발현 분석2025.01.231. 전사(Transcription) 수준에서의 유전자 발현 분석 기법들 유전자 발현 분석 기법에는 Single gene analysis와 Whole genome analysis가 있다. Single gene analysis는 개별 유전자의 발현량을 확인하는 실험 기법으로 Northern Blotting과 Real-time PCR이 있다. Whole genome analysis는 세포 내 전체 유전자의 발현량을 확인하는 실험 기법으로 RNA sequencing이 있다. 2. cDNA 합성에 사용될 수 있는 primer의 종류 cDN...2025.01.23
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생물정보학을 활용한 유전자 서열 분석2025.01.041. 생물정보학 생물정보학은 생물학 분야의 해석을 통계학과 컴퓨터 시스템의 도움을 받아 생물학적 데이터를 이용하여 유전자를 해석하고 기능을 유추해내는 작업을 하는 학문입니다. NCBI는 생물학의 구글이라고 볼 수 있는 국립 생물 공학 정보센터로, 온라인으로 유전자나 단백질 서열을 검색할 수 있습니다. BLAST는 연구 과정에서 얻은 아미노산 서열이나 DNA 염기 서열을 데이터베이스와 비교하는 알고리즘입니다. BLOSUM은 단백질 간 서열의 유사성을 확인할 때 사용하는 도구로, 아미노산 간 치환 확률을 나타내는 행렬입니다. 이를 통해...2025.01.04
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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(Simple tandem repeat를 이용한 인간유전자 분석)2025.01.231. Simple tandem repeat를 이용한 인간유전자 분석 본 실험에서는 구강 상피세포를 채취하여 PCR로 증폭시키고 PAGE를 이용하여 밴드의 발현양상을 통해 STR을 분석하였다. 인간의 유전자 sequence는 거의 유사하지만 genome상의 simple sequence가 나타나는 부위와 그 크기는 차이가 있다. Simple sequence에서 반복되는 숫자는 allele에 따라 다른데 이 부분을 DNA 비교분석으로 allelic variation을 조사하는 것이다. 밴드의 발현양상을 STR을 분석가능한데 인간의 경우에...2025.01.23
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유전자 발현 분석을 위한 RT-PCR 실험2025.01.041. PCR (중합효소 연쇄반응) PCR은 target DNA의 특정 염기서열을 복제하는 기술로, template DNA, primer, dNTP, DNA 중합효소 등이 필요합니다. 온도 조절을 통해 DNA 변성, primer 결합, 신장 단계를 반복하여 DNA 단편을 기하급수적으로 증폭할 수 있습니다. 2. real-time PCR real-time PCR은 PCR 과정 중 증폭되는 DNA를 실시간으로 모니터링할 수 있는 기술입니다. 형광 검출법을 사용하여 증폭되는 DNA 양을 정량적으로 분석할 수 있습니다. 이를 통해 초기 DN...2025.01.04
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Forensic Science (과학수사)에 사용되는 유전자 검사의 종류와 비교를 통한 범죄사건 해결 판례에 대한 분석 및 고찰2025.01.181. DNA와 유전자 DNA는 생물의 생명현상에 대한 정보가 포함된 화학물질로, 생물의 형질에 관한 유전정보를 담고 있는 분자이다. 유전자는 DNA의 특정부분으로, 생물의 형질에 대한 유전정보를 담고 있다. DNA의 발견은 생명과학계에 큰 충격과 발전을 가져왔다. 2. DNA를 통한 신원확인 1984년 알렉제프리 박사가 개인마다 고유한 유전자 배열을 밝혀내면서, DNA를 이용한 신원확인 방법이 개발되었다. 이를 통해 범죄수사에 큰 혁명이 일어났다. 3. DNA 감식을 이용한 첫 번째 사건 해결 1983년 영국에서 발생한 두 건의 연...2025.01.18
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이화여대 생명과학실험 A+ 리포트(Realtime PCR을 이용한 유전자 발현 분석)2025.01.231. RNA sequencing RNA sequencing은 DNA로부터 전사되는 모든 RNA 전사체의 염기서열을 차세대 분석기술을 사용하여 분석하는 기술이다. RNA sequencing을 위해서는 cDNA가 필요한데 cDNA를 준비하는 일반적 과정은 보통 RNA 추출>RNA 선택>cDNA 합성>라이브러리 제작으로 이루어진다. RNA 염기서열 분석 기술을 통해 alternative RNA splicing, 유전자의 발현량, 염기서열의 변이, gene fusion, single nucleotide polymorphism, SNP 등의...2025.01.23
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Simple tandem repeat를 이용한 인간유전형 분석2025.01.231. 유전자 분석 이 실험은 simple tandem repeat(STR)를 이용하여 인간 유전자의 allelic variation을 분석하는 것을 목적으로 합니다. PCR과 PAGE 분석을 통해 개인과 집단 내에서 alleles의 발현 양상을 확인하고, 유전학적 개념들을 이해하고자 합니다. 2. 유전자 다형성 인간 유전체에는 반복되는 simple sequence가 존재하며, 이 부분의 반복 횟수가 개인마다 다르기 때문에 allelic variation을 쉽게 관찰할 수 있습니다. PCR과 PAGE 분석을 통해 이러한 유전자 다형성...2025.01.23
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유당분해효소 유전자 데이터 분석2025.01.171. 유당불내증 유당불내증은 유당분해효소인 락테이스의 결핍으로 인해 발생하는 증상이다. NCBI의 OMIM 데이터베이스에서 락테이스 합성 유전자인 B3GNT5 유전자에 대한 정보를 확인할 수 있었다. 이 유전자는 3번 염색체에 위치하며, 락토실세라마이드를 합성하는 효소를 암호화한다. 유당불내증 환자의 경우 이 유전자의 돌연변이로 인해 락테이스 효소가 정상적으로 합성되지 않아 유당을 분해하지 못하게 된다. 1. 유당불내증 유당불내증은 유당을 소화하고 흡수하는 능력이 부족한 상태를 말합니다. 이로 인해 유당을 섭취하면 복통, 설사, 가...2025.01.17
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연세대(미래) 12주차. 인류의 유전 및 초파리 거대염색체 관찰2025.05.031. 유전학 멘델의 유전법칙, 유전자형과 표현형, 우성과 열성, 순종과 잡종, 자가 수분과 타가 수분 등 유전학의 기본 개념을 설명하고 있다. PTC 미각 검사를 통해 유전자형과 표현형의 관계를 확인하고, 초파리 거대염색체 관찰을 통해 염색체와 유전자의 관계를 이해할 수 있다. 2. 초파리 거대염색체 초파리의 침샘에 존재하는 거대염색체를 관찰하여 염색체의 구조적 특성과 유전자와의 관계를 이해할 수 있다. 거대염색체는 유전학 연구에 중요한 실험 재료가 되며, 교차 현상을 통해 염색체 지도 작성이 가능하다. 3. 유전형질 분석과 가계도...2025.05.03