생명공학실험 genomic dna preparationc 예비레포트

소개

"생명공학실험 genomic dna preparation"에 대한 내용입니다.

목차

1. 실험 제목
2. 실험 날짜
3. 실험 목표
4. 실험 이론
5. 시약 및 기구
6. 실험방법
7. 예상결과
8. 참고사항
9. 참고문헌

본문내용

1. 실험 제목
Genomic DNA Preparation

2. 실험 날짜

3. 실험 목표
- 각자 채취한 혈액으로부터 DNA 추출 Kit를 사용하여 Genomic DNA를 추출한다.
- Spectrometer(Nano Drop)를 이용하여 추출된 DNA의 Optical Density를 측정하고 이로부터 DNA의 농도를 계산한다.
- DNA의 종류와 DNA 추출 방법을 알아본다.
- 흡광도 측정에 의한 DNA 농도 계산 및 순도측정의 원리를 알아본다.
- DNA는 용액 내 Chaotropic salt의 존재 하에서 silica 표면에 잘 결합한다.
본 실험에서 사용되는 DNA Extraction Kit는 높은 silica 함량의 silica membrance와 buffer들을 사용하여 고상추출방법(solid phase extraction)으로 고순도의 Genomic DNA를 추출한다.
- Genomic DNA를 제외한 다른 물질들은 washing buffer에 의해 쉽게 제거되며, elution buffer에 의해 높은 수율로 Genomic DNA만 회수된다.

4. 실험 이론
4.1. DNA (Deoxyribonucleic Acid)
DNA는 자연계에 존재하는 2종류의 핵산 중 디옥시리보오스를 함유한 것의 총칭을 말하며, 디옥시리보핵산(Deoxyribonucleic Acid)의 약칭이다. DNA는 뉴클레오타이드의 중합체인 2개의 긴 가닥이 서로 꼬여 있는 이중나선구조로 고분자 화합물이다.
DNA의 기본 단위는 뉴클레오타이드이며, 뉴클레오타이드는 염기, 당, 인산으로 구성된다. 염기 성분은 아데닌(A), 구아닌(G), 사이토신(C), 티민(T) 4종이며, 미량의 메틸화염기 등이 포함되는 경우도 있다.
염기가 있는 뉴클레오타이드는 포스포디에스테르 결합으로 당 사이를 연결된 형태로 긴 사슬 모양 중합체를 만들고, 2개 공통의 중심축 주위에 나선모양으로 꼬여 있다. 각 사슬에서는 중심축을 향하여 염기가 나선의 장축에 직각인 평면상에서 다른 사슬의 염기와 마주보아 A와 T, C와 G라는 상보성에 의한 수소결합을 형성하여 전체의 구조를 안정화하고 있다.

참고자료

· 이우주, 이우주 의학사전, 2012, 군자출판사
· 미생물학백과, 한국미생물학회
· 화학대사전
· 안전보건공단(MSDS), https://msds.kosha.or.kr/MSDSInfo/kcic/msdsdetail.do
· 위키피디아, Nucleic acid quantitation, 2022.09.09., https://en.wikipedia.org/wiki/Nucleic_acid_quantitation
· 위키피디아, Solid-phase extraction, 2022.09.09., https://en.wikipedia.org/wiki/Solid-phase_extraction
· 위키피디아, DNA separation by silica adsorption, 2022.09.09., https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_separation_by_silica_adsorption
· 위키피디아, 단백분해효소 K, 2022.09.09., https://ko.wikipedia.org/wiki/%EB%8B%A8%EB%B0%B1%EB%B6%84%ED%95%B4%ED%9A%A8%EC%86%8C_K
· 위키피디아, Vortex mixer, 2022.09.09., https://en.wikipedia.org/wiki/Vortex_mixer
· 위키피디아, Centrifugation, 2022.09.09., https://en.wikipedia.org/wiki/Centrifugation
· 위키피디아, Incubator, 2022.09.09., https://en.wikipedia.org/wiki/Incubator_(culture)
· DNA binds to silica, Researchgate, 2022.09.09., https://www.researchgate.net/figure/DNA-binds-to-silica-in-the-presence-of-high-salt-concentration_fig17_279725996
· silica-based methods, Biolabs, 2022.09.09., https://international.neb.com/applications/cloning-and-synthetic-biology/nucleic-acid-purification/silica-based-methods
· ethanol used in DNA-extraction, AAT bioquest, 2022.09.09., https://www.aatbio.com/resources/faq-frequently-asked-questions/Why-is-ethanol-used-in-DNA-extraction
· the basics how ethanol precipitation of DNA and RNA works, bitesizebio, 2022.09.09., https://bitesizebio.com/253/the-basics-how-ethanol-precipitation-of-dna-and-rna-works/
· Assessment of Nucleic Acid Purity Brian Matlock, Thermo Fisher Scientific, Wilmington, MA, USA