아주대학교 생물학실험1 A+ 생물정보학 보고서

소개

아주대학교 생물학실험1 과목 A+를 받은 '생물정보학' 보고서 입니다.

목차

1. 실험 제목
2. 실험 목적
3. 실험 원리
4. 실험 방법
5. 실험 결과
6. 고찰

본문내용

6. 고찰
본 실험은 생물정보학이 무엇인지 알 수 있으며 생물정보학 Tool을 이용해 미지의 유전자를 데이터베이스에 대조해 어떤 서열인지 탐구하고 단백질 서열의 서열 유사성을 비교해 봄으로써 의의가 있다.
첫번째 실험으로 BLAST를 이용해 미지의 단백질 및 DNA서열을 Word size에 따라 대조해본다. 위 실험결과에서 볼 수 있듯이 첫 번째 서열은 word size가 2 일 때는 Dalmatian pelican(달마시안 펠리컨)이 나왔고, word size가 3 일 때도 Dalmatian pelican(달마시안 펠리컨)이었으며 word size가 6일 때는 Yellow-throated sandgrouse가 나왔다. 이 원인을 고찰해보면 해석하는 단위 즉 word size가 6일 때는 6개의 서열 중 하나만 달라도 그 전체가 다르다고 해석되지만 word size가 2나 3 일 때는 더 작은 단위로 해석하기 때문에 몇 개가 다르더라도 다음 부분은 같다고 해석되어 더 광범위하게 분석된다. 두 번째 코드는 word size가 16, 32, 64에서 가장 높은 유사도로 모두 같은 생물인 Ornithorhynchus anatinus로 분석되었다. 세 번째 코드 또한 word size가 16 32 64에서 모두 같이 Gracilinanus agilis가 나왔다. 네 번째 코드는 실험 결과와 같이 word size가 16, 32에서 가장 높은 유사도로 모두 Tachyglossus aculeatus(가시 두더지)가 나와 가시 두더지로 해석할 수 있다. 다섯 번째 코드는 실험 결과에서 볼 수 있듯이 word size가 16, 32에서 가장 높은 유사도로 Homo sapiens로 해석된다.
두 번째 실험으로 BLOSUM을 이용해 5가지 동물들의 아미노산 서열을 비교하여 오리너구리와 가장 유사한 아미노산 서열을 가진 동물을 해석할 수 있다. 위 실험 결과에서 볼 수 있듯이 similarity를 보면 사람과 개는 오리너구리와의 유사도가 95.1% 였으며 주머니 쥐는 93.5%, 가시 두더지와 닭은 100%의 유사도를 볼 수 있다.

참고자료

· 사이언스올,생물정보학, https://www.scienceall.com/%ec%83%9d%eb%ac%bc-%ec%a0%95%eb%b3%b4%ed%95%99bioinformatics/?term_slug=&sa_term=scidictionary
· Britannica, nucleic acid, https://www.britannica.com/search?query=nucleic+acid
· Britannica, DNA, https://www.britannica.com/search?query=DNA
· Britannica, RNA, https://www.britannica.com/search?query=RNA
· https://www.britannica.com/science/RNA/images-videos#Images
· https://www.britannica.com/science/DNA/images-videos#Images
· https://www.britannica.com/science/nucleic acid/images-videos#Images
· https://www.britannica.com/science//images-videos#Images
· https://www.britannica.com/technology/BLAST-computer-program// images-videos#Images