응용미생물학실험 결과보고서 sequencing & BLAST

소개

부산대학교 응용미생물학실험 결과보고서로 미생물 동정실험에서 sequencing과 BLAST 실험에 대한 결과 보고서입니다.

서열검색프로그램인 BLAST를 이용하여 미지의 뉴틀레오타이드 서열을 검색하여 유사한 서열을 조회하여 찾은 후 균을 동정하는 실험입니다.

본문내용은 실험 목적, 재료, 실험 방법, seqencing 결과, 균을 동정한 결과 , seqencing과 BLAST 프로그램을 사용하는 방법에 대한 상세한 설명 등을 포함하고 있습니다.

목차

1. Title
2. Purpose
3. Materials
4. Method
5. Result
6. Discussion
7. References

본문내용

1. Title : 미생물 동정실험 - sequencing & BLAST

2. purpose : 서열검색프로그램인 BLAST를 이용하여 미지의 뉴틀레오타이드 서열을 검색하 여 유사한 서열을 조회하여 찾은 후 균을 동정한다.

3. Materials : BLAST, 동정하려는 균의 염기 서열

4. Method

① 동정하려는 균의 염기 서열을 sequencing하고 서열을 정리한다.

② BLAST에 염기서열을 넣고 검색한다.

③ 나온 결과에 따라서 균을 동정한다.

<중 략>

6. Discussion

DNA sequencing 또는 DNA 염기서열결정은 DNA에서 뉴클레오타이드의 순서인 염기서열을 결정하는 과정으로 DNA sequencing에는 아데닌, 구아닌, 사이토신, 티민의 4가지 염기의 순서를 결정하는 데 사용되는 모든 방법 및 기술을 포함한다.
DNA sequencing을 통한 DNA 염기서열에 대한 지식은 기본적인 생물학적 연구와 의학 진단, 생명공학, 법의생물학, 바이러스학, 계통분류학과 같은 수많은 응용 분야에서 필수 불가결한 요소가 되었다. 정상적인 DNA 염기서열과 돌연변이가 일어난 DNA 염기서열을 비교하면 다양한 암을 포함한 다양한 질병을 진단하고, 항체 레퍼토리를 특정할 수 있으며, 환자 치료를 안내하는 데 사용할 수 있다. DNA를 신속하게 시퀀싱하는 방법을 이용하면 보다 빠르고 개별화된 의료 서비스를 관리할 수 있으며, 더 많은 생물들을 동정하고 분류할 수 있다.

우리는 모르는 미지의 균을 동정하고 분류하기 위해서 DNA sequencing을 하였다. 그 후 서열검색프로그램인 BLAST를 이용하여 균을 동정하였다.
균을 동정하는 방법은 먼저 NCBI의 BLAST 사이트 (http://www.ncbi.nim.nih.gow/ BLAST) 에 접속한 후 BLAST 프로그램을 실행한다. 이때 사용자는 검색하고자 하는 서열을 fasta 포맷으로 준비하여 입력하거나, accession number를 찾아 입력하고 BLAST라고 표시된 버튼을 누르면 된다.

참고자료

· 유전공학의 이해/ 남상욱 외 2인/ 라이프 사이언스/ p.224~227
· https://ko.wikipedia.org/wiki/DNA_%EC%8B%9C%ED%80%80%EC%8B%B1
· http://www.bio.davidson.edu/courses/molbio/molstudents/01licohen/sequencing.html