[분자생물학실험] Reverse Genetics and Bioinformatics 결과보고서

소개

20점 만점을 받았고 A+ 받은 과목입니다.
이론 설명 잘 되어있고, 결과 사진 첨부 및 고찰에 설명 충실히 되어있습니다.

목차

1. 실험 목적
2. 이론
3. 실험방법
4. 결과
5. 고찰
6. 참고문헌

본문내용

1. 실험 목적
Reverse genetics를 이해하고 Bio-informatics tools를 사용하여 데이터를 분석한다.

2. 실험 이론
1) Reverse Genetics
Forward genetics의 방법 즉, 유전자에 코드로부터 아미노산 배열과 그 기능의 해석에 도달하는 것에 반하여 reverse genetics는 어느 단백질에 주목하여 그것이 어떤 기능을 갖는가를 분석한다. 예를 들어, 흥미 있는 단백질의 아미노산 배열을 조사하고, 그 배열에 대응하는 올리고뉴클레오티드를 화학합성하고 그것을 탐침으로 유전자를 클로닝하여 그 유전자를 이용하여 염색체 DNA 상에 변이를 이식, 변이체의 표현형을 조사하여 그 산물ㅇ인 단백질이 세포에서 나타내는 기능을 연구하는 과정을 밟는다.

2) Mutagenesis
돌연변이가 생기는 과정 및 생긴 상태이다. 자연스럽게 일어나는 것을 자연돌연변이, 인공적으로 일으키는 것을 유발돌연변이라 한다. 자연돌연변이는 영양조건이 좋을 때는 DNA의 복제 착오가 주된 원인이 되어 일어난다. 그러나 영양조건이 나쁠 때나 DNA 복제가 없는 상태에서는 시간에 비례한 어떤 확률로 DNA에 자연스럽게 상처가 나고 그것이 기초가 되어 복잡한 생물학적 과정을 거쳐 돌연변이가 생성된다. 유발돌연변이는 DNA 손상의 회복 에러, DNA 염기의 가벼운 상처에 의한 대합 오류, 또는 복제 오류를 증가시키는 상처의 생성 등 생물학적 과정을 거쳐서 생긴다.

3) Mutation
생명체가 세대에서 세대로 자신의 유전물질을 전달할 떄 생기는 오류로 DNA replication error, DNA에 가해진 chemical damage, transposon의 삽입에 의한 transposition 등이 원인이 된다.

참고자료

· Henikoff, S. and Henikoff, J.G. (1992) Amino acid substitution matrices from protein blocks, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 89, 10915-10919.
· Karlin, S. and Altschul, S.F. (1990) Methods for assessing the statistical significance of molecular sequence features by using general scoring schemes, Proc Natl Acad Sci U S A, 87, 2264-2268.Korf, I., Yandell, M. and Bedell, J. (2003) BLAST. O'Reilly Media, Incorporated.Morgulis, A., et al. (2006) A fast and symmetric DUST implementation to mask low-complexity DNA sequences, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology, 13, 1028-1040.Morgulis, A., et al. (2006) WindowMasker: window-based masker for sequenced genomes, Bioinformatics (Oxford, England), 22, 134-141.Smith, T.F. and Waterman, M.S. (1981) Identification of common molecular subsequences, Journal of molecular biology, 147, 195-197.Wootton, J.C. and Federhen, S. (1996) Analysis of compositionally biased regions in sequence databases, Methods Enzymol, 266, 554-571.