PFGE

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PFGE (Pulsed Field Gel Electrophoresis)

감염질환의 관리와 발생 예방에 필수적인 기초자료로 사용되는 병원체의 유연관계 확인은 과거에는 serotyping, biotyping, bacteriophage typing등의 bacteria의 특성 파악을 통한 실험법이 사용되었으나, 1980년대 이후에는 다양한 분자생물학적인 방법이 사용되었으며 그 중 PFGE (pulsed field gel electrophoresis)는 분자생물학 연구에 거대한 진보를 일으킨 DNA를 분리하는 기술 중 하나이다. 기존에 이용되는 gel electrophoresis는 널리 사용되었으나, 거대분자의 DNA를 효율적으로 분리할 수 없다는 것에 제한이 존재한다. 일반 DNA 전기영동법은 미생물의 DNA를 제한효소를 이용하여 몇 개의 단편으로 절단한 뒤, 아가로스 젤에 넣고 전기를 걸어 짧은 DNA가 긴 DNA보다 빨리 이동하는 특성을 이용하여 젤 중에 이동되어 형성된 DNA 조각들이 이동 패턴을 비교함으로써 유전자의 같고 다름을 구분한다. 40kb이상의 크기가 되면 선상의 이중사슬 DNA들은 아가로오스 gel에서 같은 속도로 진행하게 되어 일정한 전기장이 적용되는 조건에서는 쉽게 분리가 되지 않기 때문에 이를 해결하기 위하여 사용된 방법이 PFGE로 주기적으로 전기장을 바꾸어주는 방법이다. PFGE가 일반 전기영동법과 다른 점은 고전압으로 장시간 영동하여 크기가 큰 DNA 단편을 분리할 수 있다는 점이다.

참고자료

· 강영희. 2008. 생명과학대사전. 아카데미서적, p.326.
· 배종철 외 4인. 2009. 닭에서 분리한 salmonella gallinarum의 약제내성 및 PFGE 양상. 한국가축위생학회지, p.156.
· Schwartz DC외 1인. 1984. Separation of yeast chromosome-sized DNAs by pulsed field gradient gel electrophoresis. Cell. P.67–75.