토양 및 퇴적토 환경 시료로부터 DNA 추출하는 방법에 대한 고찰 (A Review on the Current Methods for Extracting DNA from Soil and Sediment Environmental Samples)

서지정보

· 발행기관 : 한국지하수토양환경학회
· 수록지 정보 : 지하수토양환경 / 14권 / 3호 / 57 ~ 67페이지
· 저자명 : 박준홍, 유근제, 이재진

초록

토양미생물은 토양 및 퇴적토 환경에서 생물학적 물질순환의 중요한 역할을 맡고 있다. 이러한 중요성으로 인해 토
양미생물 생태 다양성과 군집구성이 토양 및 퇴적토 생태환경과 자연저감능력을 평가하는 지표로 유용하게 쓰일 수
있다. 보다 정확한 다양성과 군집구조 분석을 위해서는 다양한 토양 및 퇴적토 시료로부터 분석에 필요한 DNA수율
과 순도를 확보해야 한다. 지금까지 토양 및 퇴적토에서 DNA추출하는 방법들에 대한 다양한 기초연구가 이루어졌
지만, 실제 환경생태영향평가와 분해기능평가에 사용시 DNA추출방법 선정에 대한 지침 및 정보는 매우 부족하다.
이에 본 연구에서는 문헌조사를 통해서 다양한 방법들의 토양 및 퇴적토 내 미생물 DNA 추출 특성을 비교·분석
하고, 현재 주로 사용되고 있는 DNA추출방법을 토양 및 퇴적토 환경평가나 오염지하수토양 자연저감능평가에 활용
할 경우 고려해야 할 기술적 사항에 대해 고찰하였다. 본 연구를 통해 하나의 특정 추출 방법으로는 미생물다양성,
군집구성 및 개체간 상호작용에 대한 정보를 얻기에는DNA양과 순도 차원에서 충분하지 않으며, 토양 및 퇴적토 미
생물 군집분석의 목적에 따라 적합한 방법의 선택이 매우 중요함을 알 수 있었다.

영어초록

In soil and sediment environment, microorganisms play major roles in biochemical cycles of ecological significant
elements. Because of its ecological significance, microbial diversity and community structure information are useful as
indexes for assessing the quality of subsurface ecological environment and bioremediation. To achieve more accurate
assessment, it is requested to gain sufficient yield and purity of DNA extracted from various soil and sediment samples.
Although there have been a large number of basic researches regarding soil and sediment DNA extraction methods, little
guideline information is given in literature when choosing optimal DNA extraction methods for various purposes such as
environmental ecology impact assessment and bioremediation capability evaluation. In this study, we performed a
thorough literature review to compare the characteristics of the current DNA extraction methods from soil and sediment
samples, and discussed about considerations when selecting and applying DNA extraction methods for environmental
impact assessment and bioremediation capability evaluation. This review suggested that one approach is not enough to
gain the suitable quantity and yield of DNA for assessing microbial diversity, community structure and population
dynamics, and that a careful attention has to be paid for selecting an optimal method for individual environmental purpose.

참고자료

· 없음