SSR 마커를 이용한 참깨(Sesamum indicum) 소규모 핵심집단의 유전적 다양성 및 집단 구조 분석 (Assessment of Genetic Diversity and Population Structure of the Sub Core Set in Sesame (Sesamum indicum) using SSR Markers)

서지정보

· 발행기관 : 한국국제농업개발학회
· 수록지 정보 : 한국국제농업개발학회지 / 28권 / 1호 / 73 ~ 83페이지
· 저자명 : 민선경, 최부웅, 박종현, 정종욱, 김규원, 박용진

초록

1. 국립유전자원센터에서 분양받은 참깨 모 핵심집단 277점에 대해 PowerCore 의 휴리스틱 알고리즘을 이용하여 112점의 소규모 핵심집단을 작성하였다.
2. 본 연구에서 작성한 112점의 소규모 핵심집단은, 115개의대립유전자를 가지고 있으며, 이들 대립유전자는 모 핵심집단에서 총 158개의 유전자로부터 유래되었고, 소규모 핵심집단의rare alleles은 모 핵심집단과 거의 100% 가깝게 표현되었다.
3. Structure 프로그램을 이용하여 집단 구조 분석을 수행한결과, 소규모 핵심집단은 4개의 sub 집단과 admixture 집단구조를 가지고 있음이 관찰되었다. Sub 집단 중 대부분의 한국품종을 포함한 Pop-1은 유전적 다양성이 다른 3가지 sub 집단보다 낮지만, 모 핵심집단과 유사한 특징을 같은 비율을지니고 있기 때문에 소규모 핵심집단은 최소한의 품종으로 표현할 수 있다.

영어초록

Sesame is queen of oil seed crops and widely cultivated in Asia and Africa. The aim of this study was to develop a mini sub core set representing the diverse germplasm of sesame and to assess the genetic diversity, population structure and phylogenetic relationship of the resulted sub core set to be used in whole genome resequencing platform. One hundred twelve accessions out of 277 accessions were selected by the PowerCore program. A total of 155 alleles were captured from the 158 alleles detected in the primary core population, and rare alleles and specific alleles were also maintained in the sub core set accessions representing almost 100% of the primary core population. Among the sub core set accessions, four sub populations were observed with some admixture accessions. Although the genetic diversity of Pop-1 which includes most accessions from Korea is relatively lower than that of other three sub populations, it can maintain maximum number of accessions in the sub core set with the same percentage as in the primary core set probably because of the specific features of these accessions. Based on this framework of genetically defined populations, the effective use and conservation management of Sesamum indicum for crop improvement might be possible.

참고자료

· 없음