진핵생물 38종의 공통적 대사경로 분석 (Analysis of Common Metabolic Pathways of 38 Species of Eukaryote)

서지정보

· 발행기관 : 한국생명과학회
· 수록지 정보 : 생명과학회지 / 35권 / 1호 / 62 ~ 68페이지
· 저자명 : 이동근

초록

38종의 진핵생물에 공통적인 대사경로를 파악하기 위하여 대사경로 3,555개가 각 진핵생물에 분포하는 양상을 MetaCyc database (version 28.0)을 이용하여 분석하였다. 대사경로 수는 13개부터 642개까지 진핵생물에 따라 다양하였다. 모든 진핵생물에 공통적인 대사경로는 없었으며 34종의 진핵생물에 UDP-N-acetyl-D-glucosamine biosynthesis Ⅱ, tRNA charging 대사경로가 존재하였다. 진핵생물에 분포하는 상위 15개 대사 경로는 아미노산 4개, 단백질 변형과 항산화에 각 3개, 지질 2개와 당, 핵산, 신호전달에 각각 1개씩 관련되어 있었다. 대사경로 보유 계통수에서는 주로 광합성과 비광합성 생물이 위치하는 2개의 그룹으로 나눌 수 있었다. 계통수의 distance value의 평균과 표준편차를 이용한 분포에서는 표준편차에 따라 대사경로의 분포가 다양한 분류단위 등 3개로 나타났다. 본 연구 결과는 진핵생물의 대사경로에 대한 이해를 통해 기초과학 발전에 기여하고, 유용한 물질 탐색을 위한 단서를 제공할 것으로 기대된다.

영어초록

To identify common metabolic pathways in 38 eukaryotes, the distribution of 3,555 metabolic pathways in each eukaryote was analyzed using the MetaCyc database (version 28.0). The number of metabolic pathways in each species varied from 13 to 642 among eukaryotes. No metabolic pathways were common to all eukaryotes, although UDP-N-acetyl-D-glucosamine biosynthesis II and tRNA charging metabolic pathways were present in 34 eukaryotic species. Of the 15 most distributed metabolic pathways, four were related to amino acids, three to protein modification, three to antioxidants, two to lipids, and one each to sugars, nucleic acids, and signal transduction. The presence/absence phylogenetic tree of metabolic pathways can be divided into two groups, mainly photosynthetic and non-photosynthetic organisms. An examination of the distribution of eukaryotic taxa using the average and standard deviation of distance values ​​drawn from the phylogenetic tree resulted in the division of the species into three groups. The results of this study were expected to contribute to the development of basic science through understanding of the metabolic pathways of eukaryotes and provide clues for the exploration of useful substances.

참고자료

· 없음