전기영동 진행 과정을 촬영한 젤 영상들을 위한 자동 분석 기법 (Automatic Analysis Scheme for Multiple Images of Ongoing Electrophoresis Gel)

서지정보

· 발행기관 : 한국정보과학회
· 수록지 정보 : 정보과학회논문지 : 소프트웨어 및 응용 / 39권 / 8호 / 672 ~ 677페이지
· 저자명 : 이완연, 이은영

초록

본 논문에서는 전기영동 기능과 젤닥 기능을 통합한 장치가 제공하는 전기영동 진행 과정을 촬영한 다수의 젤 영상들을 자동으로 분석하는 기법을 제안한다. 기존의 젤 영상 분석 기법들이 전기영동이 완료된 젤을 촬영한 단일 영상만을 해석하였다면, 제안된 젤 영상 분석 기법은 전기영동 진행 과정을 수시로 촬영한 다수의 젤 영상들 중에서 최적의 분석 결과를 전기영동 진행 과정 중에 선택하여 사용자에게 신속하게 제공한다. 제안된 기법은 전기영동 진행 과정 중의 젤 영상을 촬영하여 제공될 때마다 곧바로 분석하고, 직전에 촬영된 젤 영상의 분석 결과와 비교한다. 그리고 최근에 촬영된 젤 영상의 분석 결과가 직전에 촬영된 젤 영상의 분석 결과보다 나빠지는 최초의 시점에서, 직전에 촬영된 젤 영상의 분석 결과를 최종 분석 결과로 선택한다. 젤 영상의 분석 결과를 비교할 때, 추출된 밴드 영역의 개수와 밴드 영역 내의 화소 넓이를 사용하였다. 실제 전기영동 젤 영상 분석 실험에서, 제안된 분석 기법이 기존 분석 기법보다 약 19.3% 많은 밴드 개수와 약 29.6% 많은 화소 넓이를 제공하고 약 31% 빠르게 분석 결과를 제공하였다.

영어초록

We propose an automatic analysis scheme for ongoing electrophoresis gel images provided by an integrated device of the electrophoresis and the gel documentation devices. Whereas the existing schemes analyze a single gel image obtained after completing the electrophoresis operation, the proposed scheme analyzes multiple gel images obtained through continuity photographing during the electrophoresis operation and selects the best analysis result rapidly. The proposed scheme immediately analyzes the gel image whenever the ongoing electrophoresis gel is photographed, and compares the analysis results of the recent and the preceding gel images. In the first time point when the analysis result of the recent gel image is worse than that of the preceding gel image, the analysis result of the preceding gel image is selected as the final analysis result. When comparing the analysis results of gel images, the number of extracted bands and the size of pixels in the extracted bands are used. In practical experiments of electrophoresis gel analysis, the proposed scheme provides about 19.3% large number of extracted bands and about 29.6% larger size of pixels about 31% faster than the existing scheme.

참고자료

· 없음