ERIC-PCR genomic fingerprinting에 의한 주요 식중독 그람 음성 세균 4속의 구별

서지정보

· 발행기관 : 한국식품과학회
· 수록지 정보 : 한국식품과학회지 / 37권 / 6호 / 1005 ~ 1011페이지
· 저자명 : 정혜진, 박성희, 서현아, 김영준, 조준일, 박성수, 송대식, 김근성

초록

본 연구에서는 높은 분리능을 가지고 있을 뿐만 아니라 실 험의 재현성과 경제성의 측면에서도 많은 장점을 갖고 있는 ERIC DNA sequence를 응용한 ERIC-PCR을 이용하여 Salmonella, E. coli, Shigella, Vibrio 등 4속의 주요 그람 음성 식중독 유발 세균들의 분리·동정 방법을 확립하고자 하였다. ERIC-PCR 결과, E. coli의 경우 0.3kb, 0.42kb 및 1.2kb의 band가 모든 균주에서 공통적으로 확인되었고, Salmonella속으로부터는 0.22kb, 0.4kb 및 0.7kb의 band가 증폭되었다. Shigella속은 모 든 표준균주와 분리균주로부터 0.33kb와 1.25kb의 band가 증 폭되었으며, S. sonnei의 경우 위의 주요 2개 band 이외에도 대 부분의 균주에서 0.44kb, 2.0kb 및 3.05kb의 band가 증폭되어 다른 종의 Shigella와 구별되는 fingerprinting pattern을 나타내었 다. 그리고 V. parahaemolyticus의 경우 표준균주와 분리균주 모 두 0.51kb와 1.5kb의 band가 증폭되어 V. cholerae, V. mimicus 등과 같은 다른 종의 Vibrio와 구별되는 fingerprinting pattern을 나타내었다. 이와 같이 4속의 모든 식중독 균주마다 ERIC-PCR 후 생성되는 fingerprinting pattern에서 3-5개의 공통적인 band가 증폭되는 것이 확인되어 이를 이용한 속 수준의 분리·동정과 이러한 주요 band들 이외의 부수적인 band들을 고려하여 종 수 준까지의 분리도 가능함을 확인하였다. 따라서 본 연구의 결과 는 ERIC 반복적 DNA 염기서열을 이용한 ERIC-PCR이 식중 독균의 분리·동정 방법으로 사용될 수 있음을 확인하였으며, 나아가 더 많은 속(genus)의 식중독세균을 대상으로 한 새로운 분리·동정 방법을 확립하는데도 응용이 될 수 있을 것이다.

참고자료

· 없음