핵산지문법을 이용한 새삼屬의 종(種) 식별에 관한 연구 (Species Identification of Dodders (Cuscuta spp.) using DNA Fingerprinting)

서지정보

· 발행기관 : 한국잡초학회
· 수록지 정보 : Weed&Turfgrass Science / 29권 / 4호 / 298 ~ 309페이지
· 저자명 : 진영준, 박상원, 권용웅, 이상재, 문병철, 신중두, 고기성

초록

본 연구는 지역별로 수집한 우리나라에서 분포하는 새삼(C. japonica), 실새삼(C. australis), 갯실새삼(C. chinensis) 및 외래종인 미국실새삼(C. pentagona)을 대상으로 RAPD를 이용한 종 특이적 마커를 탐색하고 종식별을 위한 기초자료로 사용하기 위하여 실시되었다. 41개의 Operon과 12개의 URP primer를 이용하고 PCR에서 새삼류 4종의 DNA를 증폭한 결과, 새삼류 4종에서 36개의 primer가 다형성을 보였고, 그 중 18개의 primer가 종 특이적 밴드 부분을 증폭시켜 동일 지역에서 수입된 개체간의 변이를 조사한 결과 같은 종내 변이는 크지 않은 것으로 확인되었다. 지역별로 수집된 새삼류 4종의 유연관계를 조사한 결과 4개의 그룹으로 구분할 수 있었는데, 남원, 대전, 전주에서 수집된 C. pentagona와 화순에서 수집된 C. chinensis가 속하는 그룹 A와 담양1, 담양2, 천안, 양평, 칠곡, 수원에서 수집된 C. pentagona 및 여수에서 수집된 C. australis가 속하는 그룹 B로 구분할 수 있었다. 그리고 여수, 영주, 중국에서 수집된 C. japonica의 그룹 C와 중국에서 수집된 C. reflexa가 속하는 그룹 D로 구분되었다. 13개의 primer를 이용하여 C. japonica, C. chinensis, C. reflexa 및 C.
pentagona에서 각각 7, 5, 7, 2개의 종식별을 위한 특이적 마커를 찾을 수 있었으며, OPS08과 OPS09가 종식별에 가장 효율적인 primer이었다.

영어초록

Dodder (Cuscuta spp.) is a very important holoparasitic weed in plant quarantine and weed control. In Korea, C. japonica, C. australis and C. chinensis are spontaneous, but recently, C.
pentagona, exotic species, was found. Correct identification of the dodder species by morphological characteristics of seed in quarantine is very difficult. Also, species identification of dodders growing in fields is delayed until dodder plants flower. Objective of this experiment was conducted to develop a reliable method of DNA fingerprinting for species identification with seeds and seedlings.
The results are summarized as follows. Seeds of five dodders, i.e., C. australis, C. chinensis, C.
japonica, C. pentagona and C. reflexa were used for species identification by DNA fingerprinting.
Forty one Operon primers and TaKaRa Taq DNA polymerase (5U ㎕-1) were used to be tested.
Consequently 36 primer's showed polymorphism in dodder accessions and 18 primers generated the species-specific bands. For the individual variation within a species in dodder seeds the plant samples were collected from the same area was low except for C. pentagona. Thirteen primers among the 18 primers were used for analysis of inter-specific variation. Overall it was considered that the tested accessions were classified into 4 groups; group A of C. pentagona (Namwon, Daejeon, Jeonju) and C. australis (Hwasun), group B of C. pentagona (Damyang1, Damyang2, Chonan, Yangpyong, Chilgok, Suwon) and C. chinensis (Yeosu), group C of C. japonica (Yeosu, Yongju, China), and group D of C. reflexa (China). The C. japonica-specific 7 bands, the C. chinensis-specific 5 bands, the C. reflexa-specific 7 bands and the C. pentagona-specific 2 bands were identified. As a result, two Operon primers, OPS08 and OPS09, showed sufficient availability for species identification of different dodders.

참고자료

· 없음