고추 풋마름병 저항성 관련 QTL 탐색을 위한 F2 집단 구성과 GBS 분석

서지정보

· 발행기관 : 한국국제농업개발학회
· 수록지 정보 : 한국국제농업개발학회지 / 36권 / 4호 / 414 ~ 422페이지
· 저자명 : 최세나, 이준대, 양은영, 안율균

초록

고추 풋마름병은 역병, 흰가루병 등의 각종 병과 더불어 고추에 많은 위해를 가하고 있는 병 중 하나로, 이에 연관된 유전자는 양적 형질로 알려져 있으며, 이 유전자를 탐색하기 위해 필요한 QTL을 수행하기 위해 다음과 같이 GBS 분석을 시행함1. 본 연구는 고추 풋마름병의 연관 유전자좌 탐색을 목표로 풋마름병 저항성과 관련 있는 SNP 탐색을 수행함2. 이를 위해 풋마름병에 이병성인 ‘생력211’ 품종과 저항성 유전자를 가지는 ‘FRH1’이라는 품종을 실험 재료로 사용하고, 유전자형 분석을 위해 ‘생력 211’과 ‘FRH11’ 품종을 교배하여 F2 세대를 전개함3. QTL 탐색을 위해 F2 집단에 풋마름병을 접종하여 저항성이 큰 순서에 따라 0부터 4까지 다섯 단계로 나누어 표현형데이터를 수집함4. F2 집단의 180개체를 활용하여 염기 서열 분석 기술 중하나인 GBS 방식으로 고추 유전자 전반을 아우를 수 있는 수준의 SNP 정보를 수집하고, 부족한 부분은 모 부본을 재해독(resequencing) 한 데이터를 활용하여 보충함5. Barcode sequence를 활용하여 얻은 각 샘플의 raw reads 의 평균은 3.2 Mbp이고 분석된 총 raw reads 길이는 326.4 Mbp로 확인함6. Trimming 단계를 거쳐 결과적으로 raw reads의 92.23% 에 해당하는 247.8 Mbp의 염기서열 데이터를 획득함7. 이 데이터와 표현형 데이터를 기반으로 향후 고추 풋마름병 저항성과 관련된 유전자좌를 찾는 QTL mapping을 진행할 예정임

참고자료

· 없음