한국 벼 핵심집단의 유전적 다양성 및 집단의 구조 분석 (Genetic Diversity and Population Structure of Korean Rice Core Collection)

서지정보

· 발행기관 : 한국국제농업개발학회
· 수록지 정보 : 한국국제농업개발학회지 / 21권 / 4호 / 282 ~ 288페이지
· 저자명 : 정종욱, 박용진

초록

Heuristic 방법에 의해 선발된 벼 핵심집단을 170개 SSR
마커를 이용하여 유전적 다양성 및 집단의 구조 분석을 통하
여 향후 육종을 위한 소재로 사용할 수 있도록 기초 정보를
제공하고자 본 실험을 수행하였다.
1. 핵심 집단에 대하여 SSR 마커에 의해 발생된 allele 수
는 2~40개로 다양하게 나타났고 평균 allele 수는 10.7개 였다.
이들의 gene diveristy와 PIC 값은 각각 0.053~0.955와 0.052~
0.953였으며, 평균은 0.668과 0.652로 나타났다.
2. 집단의 구조 분석을 위하여 STRUCTURE을 이용한 결
과, 각각의 자원을 75% 확률로 4개의 subpopulation으로 나눌
수 있었다.
3. STRUCTURE에 의해 분류된 4개 subpopulation 간
pair-wise FST를 분석한 결과 범위는 0.303~0.498로 나타났으
며, 전체 FST는 0.407로 매우 높은 분화 정도를 보였다.
4. Subpopulation에 대한 유전적 다양성은 POP2 집단이 평
균 allele 수, gene diversity 및 PIC 값 모두 가장 높았으며,
allele 수는 POP3 집단에서 gene diversity와 PIC는 POP4 집
단에서 가장 낮게 나타났다.
5. 본 실험을 통해 핵심집단의 유전적 다양성이 매우 높다
는 결과를 얻을 수 있었고 지리적 분포에 따른 자원에 대한
특정한 경향이 나타나지 않았다.

영어초록

One hundred and thirty rice core collection with diverse origin were evaluated for genetic
diversity and population structure by one hundred and seventy SSR loci. A total of 1763 alleles were
detected, ranging from two to 40 with an average of 10.7 alleles per locus. The frequency of major alleles
per locus varied from 0.084 (RM3525) to 0.973 (RM238). The averages of gene diversity and PIC values
were 0.668 and 0.652, with a range from 0053 (RM238) to 0.955 (RM3525) and from 0.052 (RM238) to
0.953 (RM3525), respectively. The average pair-wise FST of the overall loci was 0.407, with FST for each
populations ranging from 0.303 between POP1 and POP4 to 0.498 between POP3 and POP4. These rice
core collection present a valuable source of diversity for future breeding and association analysis.

참고자료

· 없음