정량 PCR을 이용한 벼 흰잎마름병균 밀도 측정 (Measurement of Density for Xanthomoanas oryzae pv. oryzae Cell Using Real Time PCR)

서지정보

· 발행기관 : 한국국제농업개발학회
· 수록지 정보 : 한국국제농업개발학회지 / 25권 / 2호 / 194 ~ 199페이지
· 저자명 : 노태환, 강미형, 서수좌, 심형권, 최만영, 박종철, 백채훈, 김형무

초록

Real Time PCR을 이용한 벼 흰잎마름병균의 밀도를 측정할 수 있는 새로운 방법을 개발하였다. Real Time PCR을 이용하여 벼 흰잎마름병을 예찰하기 위하여 TaqMan MGB probe를 이용한 프라이머인 Xan_PahgeF & Xan_PahgeR primer와 Xan_Pahge FAM MGB probe를 제작하였으며, 높은 특이성이 인정되었다. 병원균 배양액, 벼 흰잎마름병원균의DNA, 병원세균에 오염된 물에서도 효과적으로 검출이 되었다. 농수로물이나 관개수에서 벼 흰잎마름병균의 밀도를 측정할 때 정량 PCR의 저해인자 제거 후 신속하게 벼 흰잎마름병균의 밀도를 측정할 수 있다.

영어초록

ABSTRACT: We developed a new measurement method for the density of Xanthomonas oryzae pv. oryzae(Xoo), a casual pathogen of bacterial leaf blight of rice. The new method used real time PCR with the highly characterized and specific Xan_PahgeF & Xan_PahgeR primer and Xan_Pahge FAM MGB probe primer pairs derived from phage-related integrase gene. The method was effective when tested with a variety of templates including isolated Xoo DNA, pure colonies or liquid culture sources, and could also work on contaminating water. A main advantage of this assay is to accurately and rapidly quantitate the population density of Xoo in paddy field water containing inhibitors.

참고자료

· 없음