T-DNA Integration Patterns in Transgenic Tomatoes with PATII Gene

서지정보

· 발행기관 : 한국국제농업개발학회
· 수록지 정보 : 한국국제농업개발학회지 / 24권 / 5호
· 저자명 : Soon-Young Ahn, Hae Keun Yun, Hyo Guen Park

초록

제초제 저항성 유전자가 도입된 형질전환 토마토에서 T-DNA의 특성을 분석하였다. 형질전환 토마토의 T-DNA 도입형태를 분석하기 위한 primer쌍을 제작하여 rpPCR을 실시하 였다. T0-21(15:1, 4 copy), 26(3:1, 3 copy), 34(63:1, 4 copy)의 경우에는 5쌍의 primer를 이용하여 수행한 rpPCR 결과에서 양쪽이 절단된 불완전한 T-DNA 반복이 확인되었다. 도입된 T-DNA의 주변 서열 및 분포를 알아보기 위하여 총 52개체의 형질전환체에 대하여 TAIL-PCR을 실시하였다. 이 중 22개 형질전환체의 TAIL-PCR 산물의 염기서열을 분석하였는데, 2개의 형질전환체에서 나온 염기서열 결과는 토마토의 12번 염색체와 90%, 1개체는 토마토 clone 135006R과 98%, 5개체는 담배의 엽록체와 97% 상동성을 보였으며, 12개체는 다양한 vector의 염기서열을 나타내었고, 그 외 나머지 개체들은 토마토 유전체 정보와 는 유사성을 찾을 수 없었다.

영어초록

The repetitive integration of transgenes in transgenic tomatoes was investigated. Several independent transgenic lines of tomato were screened for possible T-DNA repeats using reverse primer PCR (rpPCR), which utilizes primer pairs oriented in opposite directions. The rpPCR results showed that the binding sites for primers 3 and 4 were missed and were truncated at T-DNA copies in the 3 transgenic lines, including T0-21, -26, and -34. To assess the distribution of inserts, 52 flanking sequenceswere amplified by thermal asymmetric interlaced (TAIL)-PCR. In the nucleotide sequence analysis results of 22 flanking regions, two showed higher than 90% homologys to centromeric region of chromosome 12, one flanking sequence showed 98% homology to tomato clone 135006R, and five flanking sequences showed 97% homology to tobacco chloroplast genome DNA. Twelve of the 22 flanking sequences showed various vector sequences and thirty flanking sequences showed no significant similarity to any released tomato genomic regions.

참고자료

· 없음