생물정보공학- 기출문제정리

목차

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본문내용

1. 아래의 용어, 관용표현 및 관용어구 등에 대해 간략히 설명하거나 정의하시오 (30점).
① GC -
② 0 (buoyant density) -
③ Acceptor site –
④ Leader sequences in protein -
⑤ Window size –
⑥ Step size –
⑦ Threshold value -
⑧ Net force –
⑨ Log-Odd Value –
⑩ Palindrome in DNA sequence

2. Biological Sequence, Molecular Structure, Biochemical Function 등이 갖는 상호 연관관계에 대해 생물학적 의미 차원에서 기술하시오. 게다가 동일한 기능을 갖는 거대분자들이 반드시 동일한 1차원 서열구조를 갖지 않는 이유도 부연 설명하시오 (15점).

3. Dot matrix를 이용해서 서열정렬 할 경우의 기본 방법은 어떻게 되는가?. 그리고 Dot matrix를 이용한 서열정렬 방법이 갖는 장점과 단점을 간략히 나열하시오 (10점).

4. PAM(N) (ex, PAM 1, PAM 120, PAM 250)의 수치 값 N이 갖는 상대적인 의미는 무엇인가? 만약 여러분들이 진화론적으로 거리가 가까워 유사성이 높은 서열들을 대상으로 상동성 서열을 탐색하고자 할 경우 어떤 PAM을 선택하는 것이 합당한가요? (10점).

5. ENTREZ란 무엇이라 정의할 수 있는가? 그리고 ENTREZ 내부를 구성하고 있는 데이터베이스들로 어떠한 것들이 있는지 아는 대로 열거하시오 (10점).

6. 어떠한 경우에 우리는 하나의 주어진 제한효소가 Degeneracy한 성질을 갖는다고 말하는가? 그리고 혹 여러분들이 알고있는 제한효소관련 데이터베이스를 하나 이상 열거하시오 (10점).

7. 동일한 기능이나 역할을 하는 해당 부위 DNA서열들을 다중정렬했을 경우 특정 위치가 Uncertainty하다라고 얘기하는 경우 어떤 경우인가?

참고자료

· 없음