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[충남대] 분자생물생화학실험 - 대장균 IPTG 처리, 크로마토그래피, 재조합 단백질 생산

충남대 분자생물생화학실험 보고서 입니다! (A+)
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한컴오피스
최초등록일 2024.04.17 최종저작일 2023.04
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[충남대] 분자생물생화학실험 - 대장균 IPTG 처리, 크로마토그래피, 재조합 단백질 생산
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    소개

    충남대 분자생물생화학실험 보고서 입니다! (A+)

    목차

    I. 서론

    II. 재료 및 방법
    1. Recombinant protein production
    2. Total protein extraction
    3. Affinity chromatography (Ni-NTA)
    4. Size exclusion chromatography (FPLC)
    5. SDS-PAGE
    6. Bradford assay
    7. Enzyme activity assay

    III. 결과

    IV. 논의

    V. 참고문헌

    본문내용

    Escherichia coli BL21 그리고 BL21(DE3)은 재조합 단백질 생산을 위한 일반적인 실험실 균주이다. BL21에서 파생된 E.coli BL21(DE3)은 재조합 단백질의 고수준 발현에 가장 널리 사용되며 T7 RNA polymerase 유전자를 제어하는 박테리오파지λ에서 유래된 prophage DE3를 갖고 있다[1]. 대장균에서 도입 유전자 발현을 위해 쓰이는 프로모터는 주로 조절성이다. lac 프로모터는 대장균의 젖당 오페론에서 쓰이는 프로모터로서 lac repressor가 있을 때 발현이 없다가 젖당 또는 젖당의 유사체(IPTG 등)가 있을 때 억제자가 프로모터에 결합하지 못하므로 유전자 발현이 일어난다. 이 lac 프로모터를 발현하고자 하는 표적유전자와 함께 삽입하면 이 유전자는 젖당 의존적 발현을 하게 된다. T7 발현 시스템은 lac 프로모터와 T7 프로모터를 복합적으로 사용하는 것으로 다른 프로모터와 달리 촉진성 발현 조절 양식을 채택하고 있다. T7 발현 시스템으로 단백질을 발현하려면 T7 프로모터를 지닌 발현 벡터와 DE3 유전자가 삽입된 대장균 균주를 사용해야 한다. DE3란 lac 프로모터에 의해 조절되는 T7 RNA 중합효소 유전자이다. T7 프로모터가 든 발현 벡터에 표적유전자를 재조합하여 적절한 대장균 균주에 도입하여 선별한다. 이후 이 대장균을 IPTG로 처리하면 T7 중합효소의 발현이 일어난다. 이후 이 중합효소는 T7 프로모터에 결합하여 표적유전자 발현을 시작한다[2]. 실험에 사용한 vector는 pET28a이다. 유도되지 않은 발현을 억제하기 위해 T7 promoter 및 인접한 lac operator 서열을 포함한다. 발현될 coding 서열은 poly-histidine purification 및 thrombin protease recognition site에 대한 코딩 서열의 frame과 함께 클로닝되어 생산된 재조합 단백질을 만들 수 있다[3].

    참고자료

    · Haeyoung Jeong et al. 2015. Complete Genome Sequence of Escherichia coli Strain BL21, Genome Announc, 3(2): e00134-15.
    · 남상욱 외2인. 2020. 유전공학의 이해, 제3판, 라이프사이언스, pp.188~194, pp.265~267, pp.271~272
    · Patrick J. Shilling et al. 2020. Improved designs for pET expression plasmids increase protein production yield in Escherichia coli, Communications Biology 3, 214
    · Shijie Liu, 2017. How Cells Grow, Bioprocess Engineering, Second Edition
    · Thermo Fisher Scientific. 2019. Centrifugation Theory, Fischer Scientific
    · 강영희. 2011. 생명과학대사전, 아카데미서적, p.399, p.1207
    · Ashkan Madadlou et al. 2010. Fast Protein Liquid Chromatography, Protein Chromatography, pp.439~447
    · 부성희 외3인. 2015. 생화학실험, 청문각, p.96
    · Toni A. Trumbo et al. 2013. Applied spectrophotometry: Analysis of a biochemical mixture, Biochemistry and Molecular Biology Education, Volume 41, Issue 4, pp.242~250
    · Eric R. Bonner et al. 2005. Molecular Basis of Cysteine Biosynthesis in Plants, THE JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY VOL. 280, NO. 46, pp. 38803–38813
    · Julie A. Francois et al. 2006. Structural Basis for Interaction of O-Acetylserine Sulfhydrylase and Serine Acetyltransferase in the Arabidopsis Cysteine Synthase Complex, Plant Cell, 18(12): 3647~3655
    · Cengiz Kaya et al. 2020. Involvement of l-Cysteine Desulfhydrase and Hydrogen Sulfide in Glutathione-Induced Tolerance to Salinity by Accelerating Ascorbate-Glutathione Cycle and Glyoxalase System in Capsicum, Antiodants, 9(70) 603.
    · Sibsankar Kundu and Robert L. Jernigan. 2004. Molecular Mechanism of Domain Swapping in Proteins: An Analysis of Slower Motions, Biophys J. 86(6): 3846–3854.
    · Xu, Dong, Nussinov, Ruth. 1998. Favorable domain size in proteins, Folding & Design, 3(1): 11–17.
    · 강병욱. 2017. 대두(Glycine max)의 L-cysteine desulfhydrase 기능에 중요한 O-acetyl-serine(thiol) lyase 아미노산 잔기 규명, 충남대학교 대학원 석사학위논문, pp.35~36
  • AI와 토픽 톺아보기

    • 1. 재조합 단백질 생산
      재조합 단백질 생산은 생명공학 분야에서 매우 중요한 기술입니다. 이 기술을 통해 우리는 다양한 유용한 단백질을 대량으로 생산할 수 있습니다. 예를 들어 인슐린, 성장 호르몬, 혈액 응고 인자 등의 의약품 생산에 활용되고 있습니다. 또한 효소, 항체, 백신 등 산업적으로 유용한 단백질도 생산할 수 있습니다. 재조합 단백질 생산 기술은 지속적으로 발전하고 있으며, 향후 더 다양한 분야에서 활용될 것으로 기대됩니다. 단, 이 기술의 안전성과 윤리적 문제에 대한 지속적인 연구와 논의가 필요할 것 같습니다.
    • 2. 단백질 분석
      단백질 분석은 생명과학 분야에서 매우 중요한 연구 분야입니다. 단백질의 구조, 기능, 상호작용 등을 분석하는 다양한 기술들이 발전하고 있습니다. 예를 들어 질량분석기, 크로마토그래피, 전기영동 등을 통해 단백질의 분자량, 순도, 아미노산 서열 등을 분석할 수 있습니다. 또한 X-ray 결정학, NMR 분광법 등을 통해 단백질의 3차원 구조를 규명할 수 있습니다. 이러한 단백질 분석 기술은 신약 개발, 질병 진단, 생명공학 응용 등 다양한 분야에 활용되고 있습니다. 향후 단백질 분석 기술의 정확성과 효율성이 더욱 향상될 것으로 기대됩니다.
    • 3. 크로마토그래피
      크로마토그래피는 복잡한 혼합물을 분리하고 분석하는 강력한 기술입니다. 다양한 종류의 크로마토그래피 기법들이 발전해왔는데, 예를 들어 액체 크로마토그래피, 기체 크로마토그래피, 이온 교환 크로마토그래피 등이 있습니다. 이러한 기법들은 단백질, 핵산, 대사물질 등 생물학적 중요 물질의 분리와 정제에 널리 사용되고 있습니다. 또한 정량 분석, 구조 분석 등 다양한 응용 분야에서 활용되고 있습니다. 향후 크로마토그래피 기술은 더욱 정밀해지고 자동화되어 생명과학 연구와 산업 응용에 더욱 기여할 것으로 기대됩니다.
    • 4. 단백질 구조와 기능
      단백질의 구조와 기능에 대한 이해는 생명과학 분야의 핵심 주제입니다. 단백질은 생명체 내에서 다양한 역할을 수행하는데, 효소, 호르몬, 항체, 구조 단백질 등 매우 다양한 기능을 가지고 있습니다. 단백질의 3차원 구조는 그 기능을 결정하는 중요한 요인이며, 최근 X-ray 결정학, NMR 분광법 등의 발전으로 단백질 구조 규명 기술이 크게 발전하고 있습니다. 이를 통해 단백질의 작용 메커니즘을 이해하고 신약 개발, 단백질 공학 등에 활용할 수 있습니다. 향후 단백질 구조와 기능에 대한 연구가 더욱 심화되어 생명과학 전반에 걸쳐 큰 발전이 있을 것으로 기대됩니다.
    • 5. 대사 경로
      대사 경로는 생명체 내에서 일어나는 화학 반응의 연쇄 과정을 의미합니다. 이는 생명체가 에너지와 물질을 생산하고 조절하는 핵심 메커니즘입니다. 대사 경로에는 탄수화물, 지질, 아미노산 대사 등 다양한 대사 과정이 포함되어 있습니다. 이러한 대사 경로에 관여하는 효소, 조절 인자, 신호 전달 체계 등에 대한 연구가 활발히 진행되고 있습니다. 대사 경로에 대한 이해는 질병 진단, 신약 개발, 대사 공학 등 다양한 분야에 활용될 수 있습니다. 향후 첨단 분석 기술과 컴퓨터 시뮬레이션 등의 발전으로 대사 경로에 대한 이해가 더욱 깊어질 것으로 기대됩니다.
  • 자료후기

      Ai 리뷰
      재조합 단백질 생산 및 정제, 단백질 분석 기법, 효소 활성 측정을 통한 단백질 기능 추정 등 생명공학 실험 기법을 종합적으로 다루고 있다.
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