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[생물학실험1] 생물정보학2025.01.191. 생물정보학 생물정보학은 생물학과 컴퓨터를 이용한 정보학이 통합되어 발전된 학문으로, 수학이나 통계학을 기초로 컴퓨터를 이용하여 생물학을 연구하는 학문이다. 생물정보학으로 인해 유전 정보 등을 체계적으로 정리하고 발전시킬 수 있었으며, 컴퓨터를 이용한 실험 모델의 생산 등이 가능해졌다. 2. NCBI NCBI(National Center for Biotechnology Information)는 미국 국립생물공학정보센터로, 생물 의학 및 게놈 정보에 대한 액세스를 제공함으로써 과학과 건강을 발전시키는 정보센터이다. 게놈 분석, 서...2025.01.19
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Bioinformation: Analyzing Gene Sequences Using NCBI and BioEdit2025.01.061. 코돈(Codon) 코돈은 DNA에서 전사된 mRNA의 3염기 조합을 의미합니다. mRNA의 유전암호의 단위로, 이것에 의해 세포 내에서 합성되는 아미노산의 종류가 결정됩니다. 개시코돈(AUG)은 단백질 번역을 시작하는 첫 번째 코돈이며, 종결코돈(UAA, UAG, UGA)은 단백질 합성 과정이 끝났음을 알리는 신호로 작동합니다. 2. NCBI 데이터베이스 활용 NCBI(National Center for Biotechnology Information)는 웹 기반 생물학 데이터베이스로, 유전자 및 단백질 정보를 얻을 수 있습니다...2025.01.06
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서강대학교 일반생물학실험1 실험 6. GFP 단백질과 단백질 정량 (Protein Measurements)2025.01.021. 단백질 정량 방법 실험에서는 Lowry assay와 Extinction coefficient assay 두 가지 단백질 정량 방법을 사용하여 EGFP의 질량농도를 측정하였다. Lowry assay는 Biuret reaction과 Folin reaction을 거쳐 750nm에서 흡광도를 측정하고 BSA 표준곡선을 이용하여 EGFP 농도를 계산하였다. Extinction coefficient assay는 EGFP의 몰흡광계수와 Lambert-Beer's Law를 이용하여 488nm에서 EGFP 농도를 직접 계산하였다. 두 방법의 ...2025.01.02
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종이 크로마토그래피에 의한 물질 분리 충북대2025.05.041. 종이 크로마토그래피 종이 크로마토그래피는 물질을 분리하는 기술로, 이 실험에서는 광합성 색소와 아미노산을 분리하였습니다. 광합성 색소의 경우 엽록소 a, 엽록소 b, 카로틴이 분리되었고, 아미노산의 경우 메티오닌, 리신, 글리신이 분리되었습니다. 각 물질의 Rf 값을 계산하여 물질의 종류를 확인하였습니다. 1. 종이 크로마토그래피 종이 크로마토그래피는 화학 분석 기술 중 하나로, 다양한 화합물을 분리하고 확인하는 데 널리 사용됩니다. 이 기술은 간단하고 저렴하며 실험 장비가 복잡하지 않아 많은 연구자들이 선호합니다. 종이 크로...2025.05.04
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Peptide 질량분석2025.01.231. 펩타이드 질량분석 단백질은 20종류의 아미노산들이 여러 개 연결된 폴리펩타이드 사슬이며, 펩타이드는 둘 이상의 아미노산이 탈수축합반응을 통해 결합된 것이다. MALDI-TOF 질량분석법은 분석 물질에 자외선을 흡수하는 matrix를 넣고 레이저로 기화시켜 기체상 이온을 만들어 질량/전하수 값을 측정하는 방법이다. 실험에서는 단백질을 트립신으로 가수분해한 펩타이드 용액을 CHCA matrix와 혼합하여 MALDI-TOF 질량분석을 수행하였고, 얻어진 펩타이드 질량지문으로부터 주어진 단백질을 동정하였다. 2. MALDI-TOF 질...2025.01.23
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아주대 생물학실험 1 생물정보학실습2025.01.121. 생물정보학 생물정보학은 생물학적 데이터를 저장, 검색, 구성하고 분석하는 데 생물공학 IT를 사용하는 분야를 일컫는다. 유전체 서열 프로젝트나 여타 연구에서 엄청난 양의 데이터가 생성되었는데, 이 데이터 웨이브의 결과 생물학 분야의 난제는 대부분 컴퓨팅 쪽 문제로 바뀌게 되었다. 생물정보학이라는 용어는 1970년 Paulien Hogeweg와 Ben Hesper가 처음 사용한 말이다. 현재는 좀 더 넓은 의미로 사용되어 컴퓨터 구조 생물학, 화학 생물학과 시스템 생물학 등을 포괄한다. 2. NCBI NCBI는 미국 국립보건원 ...2025.01.12
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[A+ 보장!] 연세대 의대 의예과 1학년 General Biology 실험 레포트 Protein quantificaiton2025.01.141. 단백질 구조와 기능 단백질은 생체 내에서 다양한 기능을 수행하며, 아미노산으로 구성되어 있다. 단백질의 1차 구조는 아미노산이 펩타이드 결합으로 연결된 폴리펩타이드의 사슬이며, 2차 구조는 폴리펩타이드의 펩타이드 결합 사이의 수소 결합으로 인해 형성되는 α 나선구조와 β 병풍구조를 의미한다. 단백질의 3차 구조는 폴리펩타이드의 3차원 형태를 의미하며, 곁사슬 사이의 다양한 결합이 이를 결정한다. 마지막으로 단백질의 4차 구조는 두 개 이상의 폴리펩타이드로 구성된다. 2. Bradford assay Bradford assay는 ...2025.01.14
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Structural analysis of a dipeptide2025.05.031. Amino acids 아미노산(amino acid)은 단백질의 기본 구성 단위로, 단백질을 완전히 가수분해하면 암모니아와 함께 생성된다. 화학적으로 아미노기와 카복실기를 포함한 모든 분자를 지칭하며 화학식은 NH2CHRnCOOH(n=1~20)이다. 생화학에서는 흔히 α-아미노산을 간단히 아미노산이라 부른다. α-아미노산은 아미노기와 카복실기가 하나의 탄소(알파 탄소라고 부른다)에 붙어있다. 아미노산의 일종인 프롤린(proline)은 실제로는 아미노기 대신 이차 아미노기를 포함한 2차 아민인데 생화학적으로 보통의 아미노산과 비슷...2025.05.03
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생물정보학을 활용한 유전자 서열 분석2025.01.041. 생물정보학 생물정보학은 생물학 분야의 해석을 통계학과 컴퓨터 시스템의 도움을 받아 생물학적 데이터를 이용하여 유전자를 해석하고 기능을 유추해내는 작업을 하는 학문입니다. NCBI는 생물학의 구글이라고 볼 수 있는 국립 생물 공학 정보센터로, 온라인으로 유전자나 단백질 서열을 검색할 수 있습니다. BLAST는 연구 과정에서 얻은 아미노산 서열이나 DNA 염기 서열을 데이터베이스와 비교하는 알고리즘입니다. BLOSUM은 단백질 간 서열의 유사성을 확인할 때 사용하는 도구로, 아미노산 간 치환 확률을 나타내는 행렬입니다. 이를 통해...2025.01.04
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[화공생물공학단위조작실험1] 단백질 정량법 비교 (BCA, Bradford)2025.05.111. 단백질 정량법 단백질은 다양한 종류의 아미노산이 펩타이드 결합을 통해 형성된 고분자 화합물로, 결합 길이나 아미노산 종류에 따라 화학적∙물리적 성질이 다르다. 이러한 성질의 차이로 단백질 정량법의 종류도 다양하다. 정량법에는 Biuret assay, BCA assay, Bradford assay, 동위원소 희석 LC-MS method, 분광학적 정량법 등이 있다. 2. Biuret Assay Biuret(H2N-CO-NH-CO-NH2)구조가 알칼리성의 CuSO4와 반응하면 2가의 구리이온과 보라색의 착화합물을 형성한다. Biu...2025.05.11
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