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생화학 실험 보고서 - PCR2025.01.271. PCR(Polymerase Chain Reaction) PCR은 중합효소 연쇄반응으로, 열을 가하여 DNA의 특정 부분을 증폭시키는 기술이다. reverse transcription PCR은 mRNA에 대해 PCR을 적용하기 위한 방법으로, mRNA를 역전사시켜 cDNA를 합성하고 primer와 DNA polymerase를 이용해 DNA의 일부분을 복제, 증폭시킨다. PCR은 Denaturation, Annealing, Extension의 3단계로 진행되며, 주형 DNA, primer, dNTP, DNA polymerase가 ...2025.01.27
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PCR 활용한 유전자 증폭 실험 예비레포트2025.01.191. Polymerase Chain Reaction (PCR) PCR은 Denaturation, Annealing, Extension 등의 과정을 거쳐 특정 DNA 영역을 증폭시키는 분자 생물학적 기술이다. PCR 기법에는 다양한 종류가 존재하며, 민감도 상승을 위한 Nested PCR, 미지 영역의 서열 확인을 위한 Inverse PCR, RNA를 분석하는 RT-PCR 등이 있다. PCR에 필요한 구성 요소는 내열성 DNA polymerase, 2가 양이온, dNTP, 주형 DNA, Buffer, forward/reverse pr...2025.01.19
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[예비] PCR을 이용한 DNA 증폭2025.01.221. PCR 기술 PCR 기술은 DNA의 특정 부분을 증폭하는 기술로, 1983년 Kary Mullis에 의해 개발되었습니다. PCR의 원리는 자연적인 DNA 복제 과정에서 영감을 받았는데, DNA 복제는 세포 내에서 DNA 폴리머레이즈 효소에 의해 이루어지며, 이 효소는 DNA의 주형 가닥을 읽고 상보적인 뉴클레오타이드를 추가하여 새로운 DNA 가닥을 만듭니다. 2. DNA 복제 과정 DNA 복제 과정은 크게 3가지로 진행됩니다. 1) 시작: 복제 기점에서 DNA 이중나선이 풀리고 단일 가닥으로 분리됩니다. 2) 신장: 프라이머가...2025.01.22
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[생명공학 레포트] gDNA isolation 및 T7E1 assay를 통한 genome editing 확인2025.05.031. gDNA isolation gDNA는 plasmids와 같은 extra-chromosomal DNAs와는 다르게 chromosomal DNA를 의미한다. gDNA를 분리하는 단계에서는 cell과 CLS(Cell Lysis Solution), proteinase K를 섞어 DNA 추출을 위해 cell을 파괴하는 역할을 한다. CLS에는 SDS, Tris-HCl, EDTA 등이 들어가 있으며, SDS는 cell membrane의 lipid를 제거하고, Tris-HCl은 pH 변화를 방지하며, EDTA는 세포 내의 DNases의 역...2025.05.03
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생화학 실험/실습 보고서 (PCR)2025.01.231. DNA DNA는 살아있는 모든 유기체 및 많은 바이러스의 유전적 정보를 담고 있는 실 모양의 핵산 사슬이다. DNA는 2개의 뉴클레오타이드 가닥이 결합하여 이중나선 구조를 이루고 있으며, 각각의 가닥은 뉴클레오타이드 단량체들의 복합체로 염기, 디옥시리보오스, 인산염 3가지로 구성되어 있다. DNA의 상보성은 DNA 정보 저장, 복제, 전사 등에 기여한다. 2. RNA RNA는 DNA와 더불어 핵산이라고 하는데, 지방, 단백질, 탄수화물과 더불어 생명체를 이루는 주된 물질이다. RNA는 DNA와 마찬가지로 뉴클레오타이드가 연결된...2025.01.23
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서울대학교 A+ 생물학 실험 PCR, DNA technology2025.01.281. DNA 기술 DNA 기술은 생명과학 및 생명공학의 핵심적인 도구로, 유전 물질의 분석, 변형 및 조작을 가능하게 한다. 이러한 기술 중 특정 유전자를 vector라 불리는 plasmid에 삽입하고, 그 유전자의 복제본을 생산하는 기술인 DNA cloning, 전기영동을 통한 분석은 유전자 연구와 다양한 생물학적 응용에 있어 중요한 역할을 한다. 2. Plasmid DNA Plasmid DNA는 세균 내에서 독립적으로 복제할 수 있는 작은 원형 DNA 분자로, 염색체 DNA와는 별개로 존재한다. Plasmid는 외래 유전자를 운...2025.01.28
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Site-directed mutagenesis, DNA sequencing2025.01.221. GFP (green fluorescent protein) GFP는 Aequorea victoria로부터 추출한 형광 단백질로, 빛을 흡수하여 형광을 발광한다. GFP는 11개의 β-sheet가 β-barrel 구조를 이루고 있으며, barrel 내의 chromophore가 빛을 흡수하여 전자를 excitation시키고 바닥 상태로 돌아가면서 형광을 방출한다. GFPuv는 GFP의 variant 중 하나로, UV(ultra violet)을 흡수하여 형광을 방출한다. 2. Site-directed mutagenesis Site-d...2025.01.22
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Site-directed mutagenesis & DNA sequencing2025.01.181. Site-directed mutagenesis Site-directed mutagenesis는 원하는 돌연변이를 포함하는 짧은 DNA primers를 사용하여 DNA 염기서열 특정 위치의 mutation을 일으켜 돌연변이를 얻는 방법입니다. 이 방법을 이용하여 GFP의 chromophore 아미노산 서열을 변경하여 다양한 색상의 형광 단백질을 만들 수 있습니다. 2. DNA sequencing DNA sequencing은 DNA를 구성하는 염기 순서를 결정하는 작업입니다. Sanger sequencing 방법은 dNTP와 dd...2025.01.18
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마우스 genotyping 실습레포트2025.01.221. 전기영동 전기영동법은 크기와 전하에 다른 핵산 및 단백질의 절편의 분리, 식별 및 정제를 위한 실험 방법이다. 핵산은 (-)전하를 가지고 있어서 DNA 샘플을 아가로스 겔에 로딩하고 buffer 안에서 전기를 흘려보내면 DNA는 (+)극으로 이동하게 된다. 아가로스 겔의 그물 구조에 의해 큰 사이즈의 DNA는 천천히 이동하고 작은 DNA는 더 빠르게 이동한다. 2. PCR PCR은 DNA 또는 RNA의 특정 영역을 대량으로 복제, 증폭시키는 기술이다. PCR에 필요한 구성요소는 template DNA, forward prime...2025.01.22
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