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DNA와 RNA에서 사용되는 염기차이, DNA polymerase의 효소활성, 단백질 합성시 사용되는 ATP (에너지) 계산2025.05.081. DNA와 RNA의 염기 차이 DNA에서는 뉴클레오티드로 Thymine이 사용되고, RNA에서는 Uracil이 사용되는데, Thymine이 Uracil로부터 합성되는 경로와 왜 이렇게 구분되어 사용되는지 합리적인 이유를 설명하였다. Thymine과 Uracil의 구조적 차이, Cytosine의 Deamination 과정, Methylation에 의한 Thymine 합성 경로, Uracil의 Base pairing 가능성 등을 고려하여 DNA와 RNA에서 서로 다른 염기를 사용하는 이유를 분석하였다. 2. DNA 복제 과정의 Re...2025.05.08
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DNA 복제 과정 및 관련 효소 활동 정리2025.05.101. DNA 복제의 특성 DNA 복제는 semiconservative 방식으로 진행되며, 5'→3' 방향으로 진행된다. DNA 복제 과정에서 오류가 발생할 수 있으며, DNA polymerase가 이를 교정하는 proofreading 기능을 가지고 있다. 2. DNA polymerase의 종류와 기능 DNA polymerase I은 DNA 복제와 수선에 모두 관여하며, Klenow fragment는 합성, proofreading, nick 수선 기능을 가진다. DNA polymerase II는 복제 재개 기능, DNA polymer...2025.05.10
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[예비] PCR을 이용한 DNA 증폭2025.01.221. PCR 기술 PCR 기술은 DNA의 특정 부분을 증폭하는 기술로, 1983년 Kary Mullis에 의해 개발되었습니다. PCR의 원리는 자연적인 DNA 복제 과정에서 영감을 받았는데, DNA 복제는 세포 내에서 DNA 폴리머레이즈 효소에 의해 이루어지며, 이 효소는 DNA의 주형 가닥을 읽고 상보적인 뉴클레오타이드를 추가하여 새로운 DNA 가닥을 만듭니다. 2. DNA 복제 과정 DNA 복제 과정은 크게 3가지로 진행됩니다. 1) 시작: 복제 기점에서 DNA 이중나선이 풀리고 단일 가닥으로 분리됩니다. 2) 신장: 프라이머가...2025.01.22
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RT(역전사효소) PCR 실험 보고서2025.05.141. Reverse Transcriptase (RT) Reverse Transcription 과정을 통해 RNA 주형가닥으로부터 상보적인 DNA(cDNA)를 생성하는 효소. 1970년 RDDP의 발견 이후 눈부신 발전으로 역전사바이러스학과 암 유전학의 토대가 되어왔다. 3가지 효소활성 domain을 가지며, RNA 의존성 DNA polymerase(RDDP), C말단의 RNaseH, DNA 의존성 DNA Polymerase(DDDP)이다. 교정기능(Proofreading)이 없어 돌연변이의 누적이 쉽다. 2. One/Two step...2025.05.14
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Site-directed mutagenesis & DNA sequencing2025.01.181. Site-directed mutagenesis Site-directed mutagenesis는 원하는 돌연변이를 포함하는 짧은 DNA primers를 사용하여 DNA 염기서열 특정 위치의 mutation을 일으켜 돌연변이를 얻는 방법입니다. 이 방법을 이용하여 GFP의 chromophore 아미노산 서열을 변경하여 다양한 색상의 형광 단백질을 만들 수 있습니다. 2. DNA sequencing DNA sequencing은 DNA를 구성하는 염기 순서를 결정하는 작업입니다. Sanger sequencing 방법은 dNTP와 dd...2025.01.18