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생화학 실험 보고서 - PCR2025.01.271. PCR(Polymerase Chain Reaction) PCR은 중합효소 연쇄반응으로, 열을 가하여 DNA의 특정 부분을 증폭시키는 기술이다. reverse transcription PCR은 mRNA에 대해 PCR을 적용하기 위한 방법으로, mRNA를 역전사시켜 cDNA를 합성하고 primer와 DNA polymerase를 이용해 DNA의 일부분을 복제, 증폭시킨다. PCR은 Denaturation, Annealing, Extension의 3단계로 진행되며, 주형 DNA, primer, dNTP, DNA polymerase가 ...2025.01.27
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식품 생화학 실험 real time qPCR과정과 결과값2025.01.141. GAPDH GAPDH 유전자는 glyceraldehyde-3-phosphate 탈수소효소 단백질 계열의 구성원을 암호화한다. 암호화된 단백질은 기계적으로 구별되는 능력을 기반으로 월광 단백질로 확인되었다. 이 유전자의 산물은 무기 인산염과 nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)의 존재 하에서 glyceraldehyde- 3-phosphate의 가역적 산화적 인산화인 탄수화물 대사에서 중요한 에너지 생성 단계를 촉매한다. 암호화된 단백질은 핵에서 uracil DNA glycosylase 활성을 갖...2025.01.14
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RNA 추출, cDNA 합성 및 qRT-PCR2025.01.181. PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR은 DNA의 상보적 가닥에 결합하는 2개의 프라이머를 동시에 사용하여 증폭을 원하는 DNA의 특정 영역만을 in vitro에서 복제, 증폭하는 기술이다. 3단계를 거쳐 DNA를 복제하는데, 변성, 결합, 신장 과정을 반복하여 DNA를 증폭시킨다. 2. RT-PCR (Reverse Transcriptase PCR) RT-PCR은 유전자에서 만들어진 RNA에서 역전사효소를 이용하여 cDNA를 생성한 후, cDNA를 주형 가닥으로 PCR을 수행하여, 유전자의 RNA 발현...2025.01.18
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생물공정실험 결과보고서 - Gene Expression Analysis by RT-PCR2025.01.041. Reverse Transcription PCR (RT-PCR) 이 실험의 목적은 reverse transcription PCR을 통해 얻은 cDNA 샘플을 real-time PCR로 증폭시키는 것입니다. 다양한 시약을 사용하여 cancer cell과 ADSC cell의 유전자 발현, 특히 housekeeping gene인 GAPDH와 target gene인 Thy-1의 발현 차이를 분석하고자 합니다. 2. Real-time PCR 분석 실험 결과를 통해 ΔCt 값을 계산하여 각 세포주에서 target gene인 Thy-1이 h...2025.01.04
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RT(역전사효소) PCR 실험 보고서2025.05.141. Reverse Transcriptase (RT) Reverse Transcription 과정을 통해 RNA 주형가닥으로부터 상보적인 DNA(cDNA)를 생성하는 효소. 1970년 RDDP의 발견 이후 눈부신 발전으로 역전사바이러스학과 암 유전학의 토대가 되어왔다. 3가지 효소활성 domain을 가지며, RNA 의존성 DNA polymerase(RDDP), C말단의 RNaseH, DNA 의존성 DNA Polymerase(DDDP)이다. 교정기능(Proofreading)이 없어 돌연변이의 누적이 쉽다. 2. One/Two step...2025.05.14
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RT-PCR 실험 및 결과 분석2025.05.101. RT-PCR RT-PCR은 RNA를 추출하고 cDNA를 합성하여 PCR로 증폭하는 기술입니다. 이 실험에서는 Labozol을 이용한 RNA 추출, cDNA 합성, GAPDH와 Twist1 유전자의 RT-PCR 증폭을 진행했습니다. RNA 추출 과정에서 chloroform으로 수용성층과 지용성층을 분리하고, isopropanol로 RNA를 침전시켰습니다. 이후 ethanol로 세척하고 DEPC 처리된 물에 재용해하여 RNA 농도와 순도를 확인했습니다. RT-PCR 결과 GAPDH는 일정한 발현을 보였고, Twist1은 chemi...2025.05.10
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immunoblots2025.01.221. Immunoblotting Immunoblotting(western blotting)은 전기영동 후 단백질, 특히 양이 적은 단백질의 면역검출을 위한 강력하고 중요한 절차이다. Immunoblotting을 통해 nitrocellulose 또는 polyvinylidene fluoride(PVDF)와 같은 단백질 유지 막 지지체에 고정된 단백질 항원을 검출할 수 있다. 관심 단백질의 검출은 membrane에 노출된 관심 단백질을 특이적으로 인식하는 항체의 결합에 의존한다. 2. House keeping gene House keep...2025.01.22
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생화학실험 단백질의 정성분석2025.05.061. Western blot Western blot은 단백질을 폴리아크릴아마이드 겔에서 전기영동을 이용하여 분리하고, 니트로셀룰로오스 membrane에 옮긴 후 찾고자 하는 단백질의 항체(1차 항체)와 결합시킨 후 이 항체와 반응하는 2차 항체를 이용하여 밴드를 형상화하는 기술이다. 이 기술은 크기별 분리, 단백질을 고체 지지체로 이동, 1차 및 2차 항체를 사용하여 표적 단백질을 표시하여 시각화하는 3가지 요소를 사용한다. 2. SDS-PAGE SDS-PAGE는 질량에 의한 단백질 분리가 가능한 전기 영동법이다. 폴리아크릴아마이드...2025.05.06
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구강상피로부터 유전자의 추출 (HKG 이용 PCR & 전기영동) 실험 보고서2025.05.141. PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR은 DNA를 증폭하는 기술로, 3단계(Denaturation, Annealing, Extension)로 구성되어 있다. Denaturation 단계에서는 dsDNA가 ssDNA로 분리되고, Annealing 단계에서는 Primer가 ssDNA에 결합한다. Extension 단계에서는 Taq Polymerase가 Primer를 시작점으로 DNA를 합성한다. 이 과정이 반복되면서 DNA가 지수적으로 증폭된다. 2. 전기영동 (Electrophoresis) 전기영동은 D...2025.05.14
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Real-time PCR을 이용한 유전자 발현 분석2025.01.231. 전사(Transcription) 수준에서의 유전자 발현 분석 기법들 유전자 발현 분석 기법에는 Single gene analysis와 Whole genome analysis가 있다. Single gene analysis는 개별 유전자의 발현량을 확인하는 실험 기법으로 Northern Blotting과 Real-time PCR이 있다. Whole genome analysis는 세포 내 전체 유전자의 발현량을 확인하는 실험 기법으로 RNA sequencing이 있다. 2. cDNA 합성에 사용될 수 있는 primer의 종류 cDN...2025.01.23
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