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생화학 실험 보고서 - PCR2025.01.271. PCR(Polymerase Chain Reaction) PCR은 중합효소 연쇄반응으로, 열을 가하여 DNA의 특정 부분을 증폭시키는 기술이다. reverse transcription PCR은 mRNA에 대해 PCR을 적용하기 위한 방법으로, mRNA를 역전사시켜 cDNA를 합성하고 primer와 DNA polymerase를 이용해 DNA의 일부분을 복제, 증폭시킨다. PCR은 Denaturation, Annealing, Extension의 3단계로 진행되며, 주형 DNA, primer, dNTP, DNA polymerase가 ...2025.01.27
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식품 생화학 실험 real time qPCR과정과 결과값2025.01.141. GAPDH GAPDH 유전자는 glyceraldehyde-3-phosphate 탈수소효소 단백질 계열의 구성원을 암호화한다. 암호화된 단백질은 기계적으로 구별되는 능력을 기반으로 월광 단백질로 확인되었다. 이 유전자의 산물은 무기 인산염과 nicotinamide adenine dinucleotide (NAD)의 존재 하에서 glyceraldehyde- 3-phosphate의 가역적 산화적 인산화인 탄수화물 대사에서 중요한 에너지 생성 단계를 촉매한다. 암호화된 단백질은 핵에서 uracil DNA glycosylase 활성을 갖...2025.01.14
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RNA 추출, cDNA 합성 및 qRT-PCR2025.01.181. PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR은 DNA의 상보적 가닥에 결합하는 2개의 프라이머를 동시에 사용하여 증폭을 원하는 DNA의 특정 영역만을 in vitro에서 복제, 증폭하는 기술이다. 3단계를 거쳐 DNA를 복제하는데, 변성, 결합, 신장 과정을 반복하여 DNA를 증폭시킨다. 2. RT-PCR (Reverse Transcriptase PCR) RT-PCR은 유전자에서 만들어진 RNA에서 역전사효소를 이용하여 cDNA를 생성한 후, cDNA를 주형 가닥으로 PCR을 수행하여, 유전자의 RNA 발현...2025.01.18
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생물공정실험 결과보고서 - Gene Expression Analysis by RT-PCR2025.01.041. Reverse Transcription PCR (RT-PCR) 이 실험의 목적은 reverse transcription PCR을 통해 얻은 cDNA 샘플을 real-time PCR로 증폭시키는 것입니다. 다양한 시약을 사용하여 cancer cell과 ADSC cell의 유전자 발현, 특히 housekeeping gene인 GAPDH와 target gene인 Thy-1의 발현 차이를 분석하고자 합니다. 2. Real-time PCR 분석 실험 결과를 통해 ΔCt 값을 계산하여 각 세포주에서 target gene인 Thy-1이 h...2025.01.04
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RT(역전사효소) PCR 실험 보고서2025.05.141. Reverse Transcriptase (RT) Reverse Transcription 과정을 통해 RNA 주형가닥으로부터 상보적인 DNA(cDNA)를 생성하는 효소. 1970년 RDDP의 발견 이후 눈부신 발전으로 역전사바이러스학과 암 유전학의 토대가 되어왔다. 3가지 효소활성 domain을 가지며, RNA 의존성 DNA polymerase(RDDP), C말단의 RNaseH, DNA 의존성 DNA Polymerase(DDDP)이다. 교정기능(Proofreading)이 없어 돌연변이의 누적이 쉽다. 2. One/Two step...2025.05.14
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PCR을 이용한 유전자 증폭 및 전기영동 분석2025.12.181. PCR (Polymerase Chain Reaction) PCR은 DNA 중합효소를 이용해 특정 DNA 서열을 시험관 내에서 반복적으로 복제하여 짧은 시간 안에 수백만 배로 증폭하는 분자생물학 기술이다. 주형 DNA, 프라이머, dNTPs, DNA 중합효소 등 네 가지 주요 구성요소가 필수적이며, 변성(95℃), 결합(55~65℃), 신장(72℃)의 세 단계 온도 사이클을 반복하여 수행된다. 유전자 분석, 질병 진단, 유전자 클로닝, 법의학 등 다양한 분야에서 활용된다. 2. 역전사 PCR (Reverse Transcripti...2025.12.18
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RNA 분리 및 RT-PCR을 이용한 NQO1 유전자 발현 분석2025.12.171. RNA 분리 및 정량 Trizol을 이용하여 세포에서 RNA를 분리하는 방법으로, Phenol이 단백질과 지질을 붕괴하고 Chloroform 첨가 후 원심분리하여 3개 층으로 분리된다. 상층의 RNA를 Isopropyl alcohol로 침전시켜 분리한다. UV 분광광도계를 이용해 260nm와 280nm에서 흡광도를 측정하여 RNA 농도와 A260/A280 ratio를 구함으로써 RNA의 순도를 평가한다. 순수한 RNA는 1.9~2.1의 ratio를 나타내며, 1.6~1.8은 잘 분리된 것으로 간주된다. 2. RT-PCR 반응 ...2025.12.17
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RT-PCR 실험 및 결과 분석2025.05.101. RT-PCR RT-PCR은 RNA를 추출하고 cDNA를 합성하여 PCR로 증폭하는 기술입니다. 이 실험에서는 Labozol을 이용한 RNA 추출, cDNA 합성, GAPDH와 Twist1 유전자의 RT-PCR 증폭을 진행했습니다. RNA 추출 과정에서 chloroform으로 수용성층과 지용성층을 분리하고, isopropanol로 RNA를 침전시켰습니다. 이후 ethanol로 세척하고 DEPC 처리된 물에 재용해하여 RNA 농도와 순도를 확인했습니다. RT-PCR 결과 GAPDH는 일정한 발현을 보였고, Twist1은 chemi...2025.05.10
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qRT-PCR을 이용한 세포 분화에 따른 유전자 발현 분석2025.12.161. PCR(중합효소연쇄반응)의 원리 및 기술 PCR은 DNA의 특정 부분을 복제하고 증폭하는 분자생물학적 기술로, 변성(90~95℃), 결합(50~60℃), 확장(72℃)의 세 단계를 거쳐 25~30회 반복함으로써 DNA를 기하급수적으로 증폭한다. 프라이머는 18~25nt 길이의 단일가닥 DNA로 특정 DNA 단편과 상보적 서열을 가지며, Taq 중합효소가 뉴클레오타이드를 연결하여 새로운 DNA 분자를 생성한다. 유전자 분석, 감염병 진단, 범죄 수사 등 다양한 분야에서 활용되며 소량의 DNA로부터 수백만 배 이상의 증폭이 가능하...2025.12.16
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Western blot을 통한 단백질 정량 분석2025.12.161. Western blot 기법 Western blot(면역블롯팅)은 세포나 조직에서 추출한 단백질 혼합물로부터 특정 단백질을 검출하고 정량하는 면역기반 단백질 분석 기법이다. SDS-PAGE를 통해 단백질을 크기별로 분리한 후 막에 전이시키고 항체를 이용해 선택적으로 검출한다. 최근에는 인산화나 유비퀴틴화 같은 번역 후 변형도 확인할 수 있어 생리적 또는 병리적 상태에 따른 단백질 변화 연구에 유용하다. 2. SDS-PAGE와 Stacking gel/Running gel 불연속 버퍼 시스템에서 사용되는 두 가지 젤로, 기공이 큰...2025.12.16
