underexpress gene)Normalize algorithmLinear(global): chips have equal median or mean intensityIntensity based ... (lowess): chpis have equal mdian/mean at all intensity valueQuantile: chips have identical intensity ... unt normalization;Transcriptional amplification : high level of c-Myc produces 2 to 3 times more
yield가 다르다. Normalization은 이러한 편차를 보정함Data processingNormalization의 필요성Global normalization : chip ... 에 array된 전체 유전자 signal 강도를 이용한 보정 Housekeeping gene normalization : housekeeping gene의 signal 강도를 이용한 보정 ... External control normalization : 농도를 알고있는 외부 표준물질을 sample에 동일량 첨가하고 labeling 한 후 양자의 signal 강도를 보정
amount of amplifide mRNA = 4ug • Cy3 : Reference RNA Cy5 : Test sampleNormalization by Lowess ... . Preprocessing 1) Normalization Microarray 실험에서는 빈번히 발생하는 많은 systematic variation에 의한 bias 들이 있는데, 이런 bias들은 gene ... expression level 을 정확하게 측정하지 못하게 함으로서 잘못된 결과를 도출하게한다. Normalization은 microarray data에서 이런 system