[미생물학]미생물 유전자 분석법

소개

먼저 16S rRNA, 미생물 분류, 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction, PCR), DNA 중합효소, 전기영동에 대해서 자세히 설명해 놓았고 16S rRNA분석 실험 방법, 실험결과(직접 실험한 전기영동 사진포함), 고찰이 포함되어 있는 완벽한 레포트 입니다.

목차

7-1. 16S rRNA와 미생물 분류
1.RNA의 합성과 종류
7-2. 중합효소연쇄반응(Polymerase Chain Reaction, PCR)
1) PCR의 원리
7-3. DNA 중합효소
1) DNA 합성양상
2) DNA의 변성
3) Primer 의 결합(annealing)
7-4. 전기영동
*참고 : Agar 의 특징
*참고 : Agar 및 Agarose Gel 에 사용하는 완충액
7-5 16S rRNA의 분석
1.실험의 목적
2.실험의 원리
3.실험 방법
4.실험결과
5.고찰
7-6 참고문헌 / SITE

본문내용

7-1 16S rRNA와 미생물 분류
순수배양을 통해 소위 특정한 미생물만 증식되는 enrichment bias가 존재함이
알려지면서, 학자들은 배양에 의존하지 않고, 미생물 다양성을 분석할 수
있는 방법을 고안하기 시작하였다. 미생물은 고도의 효율성으로 인해 유전자의
존재가 대부분 유전자의 발현으로 이어지는 경향이 있다. 따라서 유전자의
존재만을 판별함으로써, 어떠한 미생물이 존재하는지 간접적으로 확인할 수
있다.
특히 계통분류학(systematics)에서는 SSU rRNA(small subunits ribosomal
RNA)의 유전자인 16S rRNA(원핵생물, 미토콘드리아, 엽록체)와 18S rRNA
(진핵생물)가 계통생성과 분류의 좋은 척도로 사용되고 있는 16S rRNA의
서열비교를 통한 계통 분류학은 기존의 분류체계에 비해 미생물다양성을
부각시키는 데 결정적인 역할을 하였고, 이를 통해 특정한 분류군의 미생물이
자연계에 존재하는지를 생물을 배양하지 않고도 알아볼 수 있게 되었다.

7-5 16S rRNA의 분석
1.실험의 목적
세포내의 유전정보는 DNA → RNA → 단백질로 전달된다. DNA에 있는
유전정보를 이용하여 단백질을 합성하기 위해서는 RNA를 필요로 하며
세포에서 합성된다. 즉 세포에서 어떤 특정한 단백질을 요구할 때 DNA는
단백질 합성 자체를 직접 지시하는 것이 아니고. DNA의 일부분에 해당하는
염기서열이 다른 형태의 핵산인 RNA로 합성될 단백질의 정보를 제공한다.
이 RNA 중에서 16S rRNA를 분석해본다.

2.실험의 원리
16S rRNA를 이용해 세균의 종류를 확인하기 위해서는 우선 이를 추출,
분리하고 PCR을 이용해 증폭한 이후, 염기서열을 해독하고 그 결과를 이미
알려진 Database의 서열과 비교하는 과정을 거친다. RNA는 다루기가
상대적으로 어려우므로 대부분 16S rRNA의 유전자 즉, 16S rDNA를 분석
한다. 순수 분리된 세균, 또는 환경시료로부터 세균의 세포를 원심분리를
통하여 분리한 후, 세포를 파쇄하고 DNA만을 Phenol등을 이용하여 정제
한다.
이 과정을 거친 세균의 DNA는 약 20kb의 크기를 갖는 세균의 전체 DNA
조각이다. 전기영동을 통하여 크기를 확인함으로써 정제가 효율적으로
되었는가를 판단한다.

참고자료

· ❑ 이정근, 오석준, 김종민 역, 바이오인포매틱스, 한빛 미디어, 2001
· ❑ Snyder and Champness, "Molecular genetics of Bacteria", 1997
· ❑ DNA Microarray와 최신 PCR 기법 수윤사, 2000
· ❑ http://kin.naver.com/browse/db_detail.php?d1id=11&dir_id
· =110205&docid=117206
· ❑ http://kin.naver.com/browse/db_detail.php?d1id=11&dir_id
· =110205&docid=650723&ts=1078629533
· ❑ http://kin.naver.com/xfile/xfile_detail.php?d1id=11&dir_id
· =110205&docid=1342722&ts=1115726739
· ❑ http://kin.naver.com/browse/db_detail.php?d1id=11&dir_id
· =110205&docid=1319279&ts=1105627194
· ❑ http://kin.naver.com/browse/db_detail.php?d1id=11&dir_id
· =110205&docid=117206&ts=1049728940
· ❑ http://www.immunoblot.com
· ❑ http://www.komabiotech.com
· ❑ http://www.dongeui.ac.kr/%7Ecblee/lec05/bio05.html
· ❑ http://www.knou.ac.kr/~bhkim/study52.htm