[유전체기능학]유전체기능학 6장

소개

유전체 기능학 6장. Sequencing Genomes


공부하면서 정리도 하고 발표도 하기위해 정리하고 만든 ppt입니다.

많은 도움이 되었으면 합니다.

목차

Chapter 6. Sequencing Genomes.
6.1 The Methodology for DNA sequencing
6.2 Assembly of a contiguous DNA sequence
6.3 The Human Genome Projects

본문내용

Chapter 6. Sequencing Genomes.

6.1 The Methodology for DNA sequencing
chain termination method : sanger, 1977
chemical degradation mothod : Maxam 4 Gilbert, 1977

6.1.1 Chain termination DNA sequencing
: single stranded DNA를 만든 후 여기에 상보적인 polynucleotide chain
enzyme을 이용 합성해 가면서, 특정 nucleotide protein에서 chain
termination시킴.
다양한 크기의 single stranded DNA molecule이 만들어짐
polyacrylamide gel eleectropheresis로 분리
* polyacrylamide gel : 10~1500bp크기의 molecules를 nucleotide의
하나 차이도 뚜렷하게 분리가능

agarose gel보다 polyacrylamide gel이 pore size가
작아서 해상도 높다.
* polyacrylamide gel의 구성 :
acrylamide monomers(CH2=CH-CO-NH2)
+ N’N’-methyleebis acrylamide unit(‘bis’)
(CH+CH-CO-NH-CH2-NH-CO-CH=CH2)

6% gel : acrylamide: bis =19:1, 100nucleotides(primer로 부터
100번째) ~ 750nucleotides( 총 650nucleotides)를
뚜렷하게 보여줌
8% gel : 50(primer로 부터 50번째) ~ 400nucleotide 읽을 수 있음
4% gel : 500~1500nucleotide 읽음

참고자료

· genomes 영문판 + 수업내용 + 자가학습내용