A+ 현대생물학실험3 (현생실3) 1차 풀레포트 BIOFILM

소개

"A+ 현대생물학실험4 (현생실4) 1차 풀레포트 BIOFILM"에 대한 내용입니다.

목차

1. Abstract

2. Introduction

3. Material & Method

4. Result

5. Discussion

6. References

본문내용

본 실험은 탄소원 배양 조건에 따른 biofilm 형성 능력을 비교하고, 탄소원에 따른 EPS의 형성 능력을 비교함으로써 biofilm과 EPS 간의 연관성을 고찰하고, 탄소원에 따른 EPS 형성이 전사 수준에서 조절됨을 확인하는 것에 그 목적이 있다. Biofilm은 attachment, maturation, dispersion 단계를 거치며 형성되는 Bacteria의 보호막이다. BIiofilm은 TCSS(Two-Component Systems)에서 Histidine Kinase가 stimuli를 인식한 후 Response regulator를 인산화하는 과정을 통해 형성된다. 외부 자극으로 Dicarboxylic acid와 같은 carbon source가 들어오면 Response regulator인 DctD가 maturation 단계에서 중요한 역할을 하는 EPS(Exopolysaccharide)의 합성을 촉진해 Biofilm이 많이 형성된다

<중 략>

V.vulnificus의 EPS clusters는 RpoN에 의해 시작되는 전사에서 필요한 NtrC에 의해 강하게 조절된다. NtrC는 Biofilm 성장에 사용되는 탄소원으로 TCA intermediates(tricarboxylic acids, dicarboxylic acids 등)가 포함된 media에서 배양될 때 생성된다

<중 략>

DctD는 bEBP Group Ⅰ에 속하며 host 뿌리에서 수송된 dicarboxylic acid를 전자공급원으로 사용해 dinitrogen을 ammonia로 환원하는 질소고정세균에서 넓게 연구되었다. DctD의 SK인 DctB는 주변 환경의 dicarboxylic acid를 감지하고 DctD를 인산화한다. 인산화 형태의 DctD는 dicarboxylic acid의 uptake system을 encoding 하는 gene의 전사를 활성화한다

참고자료

· de Santos Silva, M., & Ferreira, P. C. (Eds.). (2012). Glycerol: Production, structure and applications. New York, NY: Nova Science Publishers, p145-159.
· Yadav, M. K., Song, J. H., Vasquez, R., Lee, J. S., Kim, I. H., & Kang, D.K. (2024). Methods for detection, extraction, purification, and characterization of exopolysaccharides of lactic acid bacteriaA systematic review.Foods, 13(22), 3687.
· Sebin Kang, Kyu-Ho Lee(2022), Transition of Dephospho-DctD to the Transcriptionally Active State via Interaction with Dephospho-IIAGlc, mBio, 13(2), pp.1-5
· Pernille Ommen, Natalia Zobek, Rikke Louise Meyer(2017), Quantification of biofilm biomass by staining: Non-toxic safranin can replace the popular crystal violet, Journal of Microbiological Methods, vol.141, pp.87-89
· de Jong, H., Ranquet, C., Ropers, D.et al.2010. Experimental and computational validation of models of fluorescent and luminescent reporter genes in bacteria.BMC Syst Biol4, 55.