아주대학교 생물학 실험 1. 4주차 생물정보학

소개

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목차

1. 실험목적
2. 실험재료 & 방법
3. 실험결과
4. 고찰
5. 참고문헌

본문내용

1. 생물정보학

2. 실험목적
생물정보학을 이해하고, 생물정보학 Tool 을 사용하는 방법을 탐구해 미지의 유전자 데이터베이스 대조, 단백질 서열의 유사성 비교, DNA 및 단백질 서열 기반 생물계통수를 그려본다.

3. 실험재료 & 방법
실험재료 : BLAST, BLOSUM(Emboss Needle), Mutiple sequence alignment( ClustalW)
실험방법:
1. BLAST를 이용해 서열의 가장 유사성이 높은 종을 알아본다.
2. BLOSUM(Emboss Needle)를 이용해 서열 유사성을 비교해본다.
3. Mutiple sequence alignment( ClustalW)를 이용해 서열을 통해 DNA서열 기반 생물 계통수를 알아본다.

4. 실험 결과
실습 과제 1
ㄴ 1. Mainland tiger snake (Notechis scutatus) : 파충류
Human (Homo sapiens) : 포유류
Painted turtle (Chrysemys picta) : 파충류
Brown trout (Salmo trutta) : 경골어류
Common wall lizard (Podarcis muralis) : 파충류
Mouse (Mus musculus) : 포유류
Tufted duck (Aythya fuligula) : 조류

참고자료

· 위키피디아 / BLAST / https://en.wikipedia.org/wiki/BLAST_(biotechnology)
· 위키피디아/ Multiple sequence alignment / https://en.wikipedia.org/wiki/Multiple_sequence_alignment
· 위키피디아 / BLOSUM / https://en.wikipedia.org/wiki/BLOSUM#Terminology