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서울대학교 물리분석실험 quantum calculation 결과 보고서

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최초등록일 2025.07.18 최종저작일 2024.04
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서울대학교 물리분석실험 quantum calculation 결과 보고서
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    • 🔬 양자역학적 계산 방법인 DFT를 깊이 있게 다루는 전문 연구 보고서
    • 🧪 실제 분자 구조와 에너지 특성을 상세히 분석한 학술 문서
    • 📊 5,6-dihydrodibenzo[c,g][1,2]diazocine의 E, Z isomer 비교 연구

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    목차

    1. Abstract
    2. Result
    3. Discussion
    4. Reference

    본문내용

    Abstract
    Density Functional Theory는 분자 내 전자의 거동 및 에너지를 예측하기 위해 사용되는 양자역학적 계산 방법이다. 이 방법에서는 전자들의 파동함수 대신 전자의 밀도를 이용해 물질을 분석함으로써 해석적으로 풀기 어려운 슈뢰딩거 방정식을 이용해 물질의 에너지를 효과적으로 계산할 수 있다. 핵이 고정되어 있다고 가정하는 Born-Oppenheimer approximation와 전자가 상호작용하지 않는 계를 가정하고 실제와 같은 퍼텐셜 에너지, 전자 밀도를 구하는 Kohn-Sham Density Functional Theory등의 가정을 사용해 효율적인 계산을 진행한다.[1] 본 실험에서는 Density functional theory를 이해하고, 이를 활용해 5,6-dihydrodibenzo[c,g][1,2]diazocine E, Z isomer의 에너지, UV/Vis absorption spectra, vibration 등의 특성을 분석하고자 했다. ORCA 계산 프로그램으로 Density Functional Theroy를 활용한 계산 방법인 Grimme’s 3-corrected Hatree-Fock method, B3LYP을 사용해 5,6-dihydrodibenzo[c,g][1,2]diazocine의 E, Z isomer를 분석했다. 실험을 통해 두 분자의 진동 모드, excitation energy에 대한 정보를 얻을 수 있었다. 또한, 두 isomer의 Gibbs free energy를 비교해 Z isomer가 E isomer보다 안정함을 확인했다. 두 isomer의 uv/vis absorption spectra를 얻고 실제 실험 결과와 비교함으로써 본 실험의 계산 결과에서 실제 실험보다 긴 파장의 peak가 나타나는 것을 확인했다.

    참고자료

    · Eberhard Engel; Reiner M. Dreizler. Density Functional Theory: An Advanced Course, Springer-Verlag, 2011.
    · Sure R.; Grimme S. Corrected small basis set Hatree-Fock method for large systems. JComput Chem. 2019, 34 (19), 1672-1685. DOI: 10.1002/jcc.23317
    · Christopher J. Cramer. Essentials of Computational Chemistry: Theories and Models, WILEY, 2004.
    · Siewertsen R.; Neumann H.; Buchheim-Stehn B.; Herges R.; Nather C.; Renth F.; Temps F. Highly Efficient Reversible Z-E Photoisomerization of a Bridge Azobenzene with Visible Light through Resolved S1(nπ*) Absorption Bands. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131 (43), 15594-15595.
    · Siewertsen R.; Neumann H.; Buchheim-Stehn B.; Herges R.; Nather C.; Renth F.; Temps F. Highly Efficient Reversible Z-E Photoisomerization of a Bridge Azobenzene with Visible Light through Resolved S1(nπ*) Absorption Bands. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131 (43), 15594-15595.
    · 4.4: Ultraviolet and visible spectroscopy.
    · https://chem.libretexts.org/Courses/Oregon_Institute_of_Technology/OIT%3A_CHE_333_-_Organic_Chemistry_III_(Lund)/New_Page/4%3A_Structure_Determination_I-_UV-Vis_and_Infrared_Spectroscopy_Mass_Spectrometry/4.4%3A_Ultraviolet_and_visible_spectroscopy (accessed 2024-04-16).
    · Siewertsen R.; Neumann H.; Buchheim-Stehn B.; Herges R.; Nather C.; Renth F.; Temps F. Highly Efficient Reversible Z-E Photoisomerization of a Bridge Azobenzene with Visible Light through Resolved S1(nπ*) Absorption Bands. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131 (43), 15594-15595.
  • AI와 토픽 톺아보기

    • 1. 밀도범함수이론(DFT)
      밀도범함수이론은 현대 계산화학의 핵심 방법론으로, 전자 밀도를 기반으로 분자의 성질을 효율적으로 예측할 수 있습니다. DFT는 정확성과 계산 비용의 균형이 우수하여 대규모 분자 시스템 연구에 매우 유용합니다. 다양한 교환-상관 범함수(B3LYP, PBE, CAM-B3LYP 등)를 선택할 수 있어 연구 목적에 맞는 정확도를 달성할 수 있습니다. 다만 강상관 전자계 또는 여기상태 현상에서는 제한이 있을 수 있으므로, 연구 대상의 특성을 고려한 신중한 방법론 선택이 필요합니다.
    • 2. 이성질체 안정성 비교
      이성질체의 상대적 안정성 비교는 분자 구조 최적화와 에너지 계산을 통해 정량적으로 평가할 수 있습니다. DFT를 이용한 형성열, 자유에너지 계산으로 열역학적 안정성을 판단할 수 있으며, 활성화 에너지 계산으로 반응 경로와 동역학적 안정성도 예측 가능합니다. 용매 효과를 포함한 연속 용매 모델(PCM, CPCM)을 적용하면 실제 화학 환경에서의 안정성을 더 정확히 반영할 수 있습니다. 이러한 계산 결과는 실험적 관찰과 비교하여 검증하는 것이 중요합니다.
    • 3. 여기에너지 및 UV/Vis 흡광 스펙트럼
      여기에너지와 UV/Vis 흡광 스펙트럼은 분자의 전자 구조와 광학 성질을 이해하는 데 필수적입니다. TD-DFT(시간 의존 DFT)는 여기상태 에너지와 진동강도를 효율적으로 계산할 수 있어 실험 스펙트럼과의 비교가 용이합니다. 다만 전하이동 여기상태나 다중 여기상태의 경우 범함수 선택에 따라 오차가 발생할 수 있으므로, 필요시 파동함수 기반 방법(CC2, EOM-CCSD)을 고려해야 합니다. 용매 효과와 온도 효과를 포함한 정교한 계산으로 실험값과의 일치도를 높일 수 있습니다.
    • 4. 분자 진동 모드 분석
      분자 진동 모드 분석은 IR, Raman 스펙트럼 해석과 분자 구조 특성화에 중요한 역할을 합니다. DFT를 이용한 진동수 계산은 비교적 정확하며, 진동 모드의 원자 변위 벡터를 통해 각 진동의 물리적 의미를 파악할 수 있습니다. 스케일 인자(scaling factor)를 적용하면 계산값과 실험값의 일치도를 개선할 수 있습니다. 분자 대칭성을 고려한 군론 분석과 결합하면 스펙트럼 해석이 더욱 체계적이 됩니다. 다만 수소 결합이나 약한 상호작용이 있는 경우 진동수 예측의 정확도가 감소할 수 있습니다.
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