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Quantum Calculation

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최초등록일 2024.09.26 최종저작일 2024.03
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Quantum Calculation
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    • 📊 분자 이성질체의 에너지 및 스펙트럼 분석 방법 상세 해설

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    목차

    1. Abstract
    2. Data & Results
    3. Discussion
    4. Reference

    본문내용

    1. Abstract
    본 실험에서는 계산화학 이론에 대한 이해를 바탕으로 5,6-dihydrodibenzo[c,g][1,2]diazocine (이하 diazocine)과 azobenzene의 각 이성질체의 구조를 ORCA 프로그램을 활용해 Hartree-Fock 방법으로 직접 최적화했다. 또한 TD-DFT 방법을 이용해 각 이성질체의 UV/vis absorption spectrum을 계산하고 이를 실제 실험 값과 비교해보았다. 또한 각 이성질체의 excitation energy를 구하여 HOMO-LUMO gap과 비교함으로써 두 값이 차이가 나는 이유를 분석했다. 계산 결과 diazocine의 경우 E-diazocine의 Gibbs free energy가 Z-diazocine보다 약 15.00 kcal/mol만큼 높아 Z-form이 더 안정하다는 것을 밝혔고, azobenzene의 경우 이와 반대로 Z-azobenzene의 Gibbs free energy가 E-azobenzene보다 약 7.73 kcal/mol만큼 높아 E-form, 즉 trans-azobenzene이 더 안정한 것으로 나타났다. 이러한 이성질체 안정성에 대한 경향성 차이는 두 분자 구조의 안정성이 중심 고리 구조에 의해 영향을 받는지에 따라 결정된다고 분석했다. E-diazocine의 UV/vis 파장은 505.9 nm, Z-diazocine의 UV/vis 파장은 413.7 nm로 계산되어 실제 실험 값인 490 nm, 404 nm보다 약간 높은 것으로 나타났다.

    2. Data & Results
    1) 계산화학 개론
    본 실험에서는 계산화학적 방법을 사용해 구조 최적화와 UV/vis absorption spectra를 분석한다. 계산화학이란 직접 관찰하거나 계산하기 어려운 화학의 영역을 컴퓨터를 활용해 분석하는 분야로, 크게 분자동력학과 양자계산의 분야로 나눌 수 있다.

    참고자료

    · Sure, R.; Grimme, S. Corrected small basis set Hartree‐Fock method for large systems. Journal of Computational Chemistry 2013, 34 (19), 1672–1685.
    · Becke, A. D. A new mixing of Hartree–Fock and local density-functional theories. the Journal of Chemical Physics 1993, 98 (2), 1372–1377.
    · Hellweg, A.; Rappoport, D. Development of new auxiliary basis functions of the Karlsruhe segmented contracted basis sets including diffuse basis functions (def2-SVPD, def2-TZVPPD, and def2-QVPPD) for RI-MP2 and RI-CC calculations. PCCP. Physical Chemistry Chemical Physics (Print) 2015, 17 (2), 1010–1017.
    · Siewertsen, R.; Neumann, H. R.; Buchheim-Stehn, B.; Herges, R.; Näther, C.; Renth, F.; Temps, F. Highly Efficient Reversible Z−E Photoisomerization of a Bridged Azobenzene with Visible Light through Resolved S1(nπ*) Absorption Bands. Journal of the American Chemical Society (Print) 2009, 131 (43), 15594–15595.
    · Atkins, P. W.; De Paula, J.; Keeler, J. Atkins’ Physical Chemistry, 11th ed.; Oxford University Press: Oxford, 2019, pp. 462-464.
    · Siewertsen, R.; Schönborn, J. B.; Hartke, B.; Renth, F.; Temps, F. Superior Z → E and E → Z photoswitching dynamics of dihydrodibenzodiazocine, a bridged azobenzene, by S1(nπ*) excitation at λ = 387 and 490 nm. PCCP. Physical Chemistry Chemical Physics (Print) 2011, 13 (3), 1054–1063.
  • AI와 토픽 톺아보기

    • 1. 계산화학
      계산화학은 컴퓨터를 이용하여 화학 시스템의 구조와 성질을 예측하고 이해하는 학문입니다. 이는 실험적 접근이 어렵거나 비용이 많이 드는 경우에 유용하게 활용될 수 있습니다. 계산화학은 양자역학, 통계역학, 분자동역학 등의 이론적 기반을 바탕으로 하며, 다양한 계산 방법과 프로그램을 사용하여 화학 반응, 분자 구조, 분광학적 특성 등을 예측할 수 있습니다. 이를 통해 새로운 물질 개발, 반응 메커니즘 이해, 실험 설계 등에 기여할 수 있습니다. 계산화학은 실험과 이론의 상호작용을 통해 발전하고 있으며, 화학 연구에 있어 점점 더 중요한 역할을 하고 있습니다.
    • 2. XC functional, Basis set, Calculation program
      계산화학에서 XC functional, basis set, 계산 프로그램은 매우 중요한 요소입니다. XC functional은 전자 교환 및 상관 에너지를 근사적으로 표현하는 방법으로, 계산 결과의 정확도에 큰 영향을 미칩니다. 적절한 XC functional 선택은 계산 대상 시스템에 따라 달라지며, 이를 위해 다양한 XC functional이 개발되고 있습니다. 또한 basis set은 원자 궤도함수를 표현하는 방식으로, 계산 정확도와 효율성에 영향을 줍니다. 계산 프로그램은 이러한 XC functional과 basis set을 활용하여 실제 계산을 수행하는 도구로, 사용자의 목적과 시스템에 맞는 프로그램 선택이 중요합니다. 이러한 요소들의 적절한 조합을 통해 보다 정확하고 효율적인 계산 결과를 얻을 수 있습니다.
    • 3. Diazocine 계산 결과
      Diazocine은 두 개의 아조기(-N=N-)를 가진 화합물로, 광이성질화 반응을 통해 구조 변화가 가능한 것으로 알려져 있습니다. 계산화학을 통해 diazocine의 구조, 에너지, 분광학적 특성 등을 예측할 수 있습니다. 이를 통해 diazocine의 광이성질화 메커니즘, 안정성, 분자 구조 변화 등을 이해할 수 있습니다. 또한 계산 결과는 실험 데이터와 비교하여 검증할 수 있으며, 실험 설계에 활용될 수 있습니다. 이러한 diazocine 계산 결과는 광응답성 물질 개발, 광스위치 응용 등 다양한 분야에서 활용될 수 있을 것으로 기대됩니다.
    • 4. Azobenzene 계산 결과
      Azobenzene은 대표적인 광이성질화 물질로, 자외선/가시광선 조사에 따라 trans-cis 이성질체 간 구조 변화가 가능합니다. 계산화학을 통해 azobenzene의 구조, 에너지, 분광학적 특성 등을 예측할 수 있습니다. 이를 통해 azobenzene의 광이성질화 메커니즘, 안정성, 분자 구조 변화 등을 이해할 수 있습니다. 또한 계산 결과는 실험 데이터와 비교하여 검증할 수 있으며, 실험 설계에 활용될 수 있습니다. 이러한 azobenzene 계산 결과는 광응답성 물질 개발, 광스위치 응용, 광동력학 치료 등 다양한 분야에서 활용될 수 있을 것으로 기대됩니다.
    • 5. 이성질체 안정성 비교
      화합물의 이성질체 간 안정성 비교는 화학 연구에서 매우 중요한 주제입니다. 계산화학을 통해 다양한 이성질체의 구조, 에너지, 분광학적 특성 등을 예측하고 비교할 수 있습니다. 이를 통해 각 이성질체의 상대적 안정성, 전이 상태, 반응 메커니즘 등을 이해할 수 있습니다. 또한 계산 결과는 실험 데이터와 비교하여 검증할 수 있으며, 새로운 물질 개발이나 반응 설계에 활용될 수 있습니다. 이성질체 안정성 비교 연구는 유기화학, 무기화학, 생화학 등 다양한 분야에서 중요한 역할을 하며, 계산화학은 이러한 연구에 필수적인 도구로 활용되고 있습니다.
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      Ai 리뷰
      본 실험에서는 ORCA 프로그램을 활용하여 Hartree-Fock 방법으로 각 이성질체의 구조를 최적화하고 TD-DFT 방법으로 UV/vis absorption spectrum을 계산하였다. 그 결과, diazocine의 경우 Z-form이 더 안정하고 azobenzene의 경우 E-form이 더 안정한 것으로 나타났다.
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